MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA1

Total Repeats: 9998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_017060	CCG	2	6	406287	406292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527955
7003	NC_017060	CGC	2	6	406392	406397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527955
7004	NC_017060	TCC	2	6	406436	406441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384527955
7005	NC_017060	TCA	2	6	406464	406469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527955
7006	NC_017060	CCCG	2	8	406524	406531	0 %	0 %	25 %	75 %	384527955
7007	NC_017060	AAAC	2	8	406642	406649	75 %	0 %	0 %	25 %	384527955
7008	NC_017060	CCAG	2	8	406674	406681	25 %	0 %	25 %	50 %	384527955
7009	NC_017060	CGG	2	6	406717	406722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527955
7010	NC_017060	ATT	2	6	406742	406747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527955
7011	NC_017060	CAGC	2	8	406786	406793	25 %	0 %	25 %	50 %	384527956
7012	NC_017060	CAC	2	6	406805	406810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527956
7013	NC_017060	A	8	8	406817	406824	100 %	0 %	0 %	0 %	384527956
7014	NC_017060	ATC	2	6	406881	406886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527956
7015	NC_017060	ACC	2	6	406890	406895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527956
7016	NC_017060	GCGA	2	8	406948	406955	25 %	0 %	50 %	25 %	384527956
7017	NC_017060	CGT	2	6	406977	406982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527956
7018	NC_017060	CAG	2	6	406994	406999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527956
7019	NC_017060	CCG	2	6	407001	407006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527956
7020	NC_017060	TGC	2	6	407057	407062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527956
7021	NC_017060	GAT	2	6	407063	407068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527956
7022	NC_017060	TGT	2	6	407140	407145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527956
7023	NC_017060	AGC	2	6	407193	407198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527956
7024	NC_017060	GCG	2	6	407242	407247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527956
7025	NC_017060	TGCG	2	8	407339	407346	0 %	25 %	50 %	25 %	384527956
7026	NC_017060	AGC	2	6	407444	407449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527957
7027	NC_017060	GCCGGG	2	12	407458	407469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527957
7028	NC_017060	GGC	2	6	407500	407505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527957
7029	NC_017060	T	6	6	407596	407601	0 %	100 %	0 %	0 %	384527957
7030	NC_017060	ACCCA	2	10	407621	407630	40 %	0 %	0 %	60 %	384527957
7031	NC_017060	GAT	2	6	407659	407664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527957
7032	NC_017060	GCC	2	6	407738	407743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527957
7033	NC_017060	GCG	2	6	407807	407812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527957
7034	NC_017060	CAGC	2	8	407845	407852	25 %	0 %	25 %	50 %	384527957
7035	NC_017060	ACGGC	2	10	407867	407876	20 %	0 %	40 %	40 %	384527957
7036	NC_017060	CTG	2	6	407953	407958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527957
7037	NC_017060	TGAA	2	8	408179	408186	50 %	25 %	25 %	0 %	384527958
7038	NC_017060	ACTG	2	8	408202	408209	25 %	25 %	25 %	25 %	384527958
7039	NC_017060	TGT	2	6	408215	408220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527958
7040	NC_017060	GCCC	2	8	408224	408231	0 %	0 %	25 %	75 %	384527958
7041	NC_017060	GGT	3	9	408267	408275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527958
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7043	NC_017060	CGCC	2	8	408343	408350	0 %	0 %	25 %	75 %	384527958
7044	NC_017060	CTG	3	9	408366	408374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527958
7045	NC_017060	CGC	2	6	408381	408386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527958
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7047	NC_017060	TCA	2	6	408415	408420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527958
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7050	NC_017060	TATT	2	8	408475	408482	25 %	75 %	0 %	0 %	384527958
7051	NC_017060	GCC	2	6	408628	408633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527958
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7054	NC_017060	TGG	2	6	408947	408952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527959
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7057	NC_017060	TTC	2	6	409033	409038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527959
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7063	NC_017060	GGC	2	6	409249	409254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527959
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7065	NC_017060	GCT	2	6	409350	409355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527959
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7069	NC_017060	GCTG	2	8	409685	409692	0 %	25 %	50 %	25 %	384527959
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7489	NC_017060	GAT	2	6	432538	432543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527987
7490	NC_017060	G	6	6	432556	432561	0 %	0 %	100 %	0 %	384527987
7491	NC_017060	TGC	2	6	432587	432592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527987
7492	NC_017060	CGC	2	6	432595	432600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527987
7493	NC_017060	CG	3	6	432620	432625	0 %	0 %	50 %	50 %	384527987
7494	NC_017060	TTC	2	6	432655	432660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527987
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