MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA1

Total Repeats: 9998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017060	TTC	2	6	349873	349878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527910
6002	NC_017060	G	6	6	349912	349917	0 %	0 %	100 %	0 %	384527910
6003	NC_017060	AGG	2	6	349989	349994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384527910
6004	NC_017060	GCG	2	6	350090	350095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527910
6005	NC_017060	ATG	2	6	350102	350107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527910
6006	NC_017060	TGGC	2	8	350234	350241	0 %	25 %	50 %	25 %	384527910
6007	NC_017060	ATG	2	6	350256	350261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527910
6008	NC_017060	GATC	2	8	350276	350283	25 %	25 %	25 %	25 %	384527911
6009	NC_017060	ATG	2	6	350383	350388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527911
6010	NC_017060	GCC	2	6	350390	350395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527911
6011	NC_017060	CACG	2	8	350477	350484	25 %	0 %	25 %	50 %	384527911
6012	NC_017060	AAAG	2	8	350505	350512	75 %	0 %	25 %	0 %	384527911
6013	NC_017060	TGA	2	6	350516	350521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527911
6014	NC_017060	GCA	2	6	350532	350537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527911
6015	NC_017060	TAT	2	6	350583	350588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527911
6016	NC_017060	TTA	2	6	350597	350602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527911
6017	NC_017060	GCA	2	6	350660	350665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527911
6018	NC_017060	TCA	2	6	350670	350675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527911
6019	NC_017060	GAT	2	6	350837	350842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527912
6020	NC_017060	ATT	2	6	350939	350944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527912
6021	NC_017060	GGCT	2	8	350991	350998	0 %	25 %	50 %	25 %	384527912
6022	NC_017060	TGGGA	2	10	351051	351060	20 %	20 %	60 %	0 %	384527912
6023	NC_017060	TGT	2	6	351061	351066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527912
6024	NC_017060	GA	3	6	351180	351185	50 %	0 %	50 %	0 %	384527912
6025	NC_017060	GAC	2	6	351226	351231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527912
6026	NC_017060	T	6	6	351254	351259	0 %	100 %	0 %	0 %	384527912
6027	NC_017060	CT	3	6	351293	351298	0 %	50 %	0 %	50 %	384527912
6028	NC_017060	ATGT	2	8	351350	351357	25 %	50 %	25 %	0 %	384527912
6029	NC_017060	GC	3	6	351427	351432	0 %	0 %	50 %	50 %	384527912
6030	NC_017060	GCC	2	6	351545	351550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527912
6031	NC_017060	AGCC	2	8	351572	351579	25 %	0 %	25 %	50 %	384527912
6032	NC_017060	GT	3	6	351666	351671	0 %	50 %	50 %	0 %	384527913
6033	NC_017060	CAGT	2	8	351695	351702	25 %	25 %	25 %	25 %	384527913
6034	NC_017060	GCC	2	6	351764	351769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527913
6035	NC_017060	CGA	2	6	351910	351915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527913
6036	NC_017060	GC	4	8	352002	352009	0 %	0 %	50 %	50 %	384527913
6037	NC_017060	CA	3	6	352060	352065	50 %	0 %	0 %	50 %	384527913
6038	NC_017060	GACA	2	8	352096	352103	50 %	0 %	25 %	25 %	384527913
6039	NC_017060	TCC	2	6	352151	352156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384527913
6040	NC_017060	A	6	6	352255	352260	100 %	0 %	0 %	0 %	384527913
6041	NC_017060	GCC	2	6	352392	352397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527914
6042	NC_017060	TTTGCA	2	12	352416	352427	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384527914
6043	NC_017060	TGG	2	6	352447	352452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527914
6044	NC_017060	TGA	2	6	352518	352523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527914
6045	NC_017060	GCAT	2	8	352667	352674	25 %	25 %	25 %	25 %	384527915
6046	NC_017060	CAT	2	6	352752	352757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527915
6047	NC_017060	TGA	2	6	352826	352831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527915
6048	NC_017060	CTGA	2	8	352914	352921	25 %	25 %	25 %	25 %	384527915
6049	NC_017060	TGT	2	6	352933	352938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527915
6050	NC_017060	GCAG	2	8	352947	352954	25 %	0 %	50 %	25 %	384527915
6051	NC_017060	GTA	2	6	352965	352970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527915
6052	NC_017060	AAG	2	6	353054	353059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527915
6053	NC_017060	CGC	2	6	353081	353086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527915
6054	NC_017060	CG	3	6	353104	353109	0 %	0 %	50 %	50 %	384527915
6055	NC_017060	TGC	2	6	353120	353125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527915
6056	NC_017060	ACCGA	2	10	353182	353191	40 %	0 %	20 %	40 %	384527915
6057	NC_017060	GAA	2	6	353203	353208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527915
6058	NC_017060	AAG	2	6	353432	353437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527916
6059	NC_017060	ATT	2	6	353478	353483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527916
6060	NC_017060	CAG	3	9	353612	353620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527916
6061	NC_017060	G	6	6	353620	353625	0 %	0 %	100 %	0 %	384527916
6062	NC_017060	AG	4	8	354001	354008	50 %	0 %	50 %	0 %	384527917
6063	NC_017060	AG	3	6	354010	354015	50 %	0 %	50 %	0 %	384527917
6064	NC_017060	CAG	2	6	354037	354042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527917
6065	NC_017060	GCG	2	6	354078	354083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527917
6066	NC_017060	AACA	2	8	354134	354141	75 %	0 %	0 %	25 %	384527917
6067	NC_017060	GTT	2	6	354169	354174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527917
6068	NC_017060	TTG	2	6	354216	354221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527917
6069	NC_017060	AATC	2	8	354244	354251	50 %	25 %	0 %	25 %	384527917
6070	NC_017060	CGC	2	6	354403	354408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527918
6071	NC_017060	CGTT	2	8	354426	354433	0 %	50 %	25 %	25 %	384527918
6072	NC_017060	GA	3	6	354435	354440	50 %	0 %	50 %	0 %	384527918
6073	NC_017060	GGA	2	6	354549	354554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384527918
6074	NC_017060	CAATTT	2	12	354581	354592	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384527918
6075	NC_017060	TAA	2	6	354627	354632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527918
6076	NC_017060	CTG	2	6	354656	354661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527918
6077	NC_017060	GCA	2	6	354710	354715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527918
6078	NC_017060	T	6	6	354739	354744	0 %	100 %	0 %	0 %	384527918
6079	NC_017060	AGG	2	6	354834	354839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384527918
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6081	NC_017060	CAGC	2	8	354959	354966	25 %	0 %	25 %	50 %	384527918
6082	NC_017060	GGC	2	6	354992	354997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527918
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6087	NC_017060	ACGC	2	8	355240	355247	25 %	0 %	25 %	50 %	384527919
6088	NC_017060	GTT	2	6	355341	355346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527919
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6092	NC_017060	GCC	2	6	355666	355671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527919
6093	NC_017060	GCA	2	6	355706	355711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527919
6094	NC_017060	GCC	2	6	355828	355833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527919
6095	NC_017060	GC	3	6	355841	355846	0 %	0 %	50 %	50 %	384527919
6096	NC_017060	CAC	2	6	355917	355922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527919
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6098	NC_017060	ATA	2	6	355997	356002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527919
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6103	NC_017060	CGG	2	6	356231	356236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527919
6104	NC_017060	CGGA	2	8	356244	356251	25 %	0 %	50 %	25 %	384527919
6105	NC_017060	GCG	2	6	356272	356277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527919
6106	NC_017060	CAG	2	6	356304	356309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527919
6107	NC_017060	ATC	2	6	356422	356427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527919
6108	NC_017060	CGG	2	6	356429	356434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527919
6109	NC_017060	AAT	2	6	356491	356496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527919
6110	NC_017060	ACTT	2	8	356655	356662	25 %	50 %	0 %	25 %	384527920
6111	NC_017060	TGC	2	6	356676	356681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527920
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6114	NC_017060	GCT	2	6	356782	356787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527920
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6118	NC_017060	TCA	2	6	356888	356893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527920
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6120	NC_017060	GCG	2	6	356969	356974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527920
6121	NC_017060	GCC	2	6	356981	356986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527920
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6123	NC_017060	GTG	2	6	357149	357154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527920
6124	NC_017060	TGT	2	6	357220	357225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527920
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6131	NC_017060	GTC	2	6	357636	357641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527921
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6162	NC_017060	GGT	2	6	359547	359552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527922
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6235	NC_017060	TGAC	2	8	363400	363407	25 %	25 %	25 %	25 %	384527925
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6237	NC_017060	GCT	2	6	363563	363568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527926
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6241	NC_017060	GTG	2	6	363816	363821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527926
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6243	NC_017060	CGG	2	6	363872	363877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527926
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6487	NC_017060	TGA	2	6	379992	379997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527937
6488	NC_017060	CGGG	2	8	380003	380010	0 %	0 %	75 %	25 %	384527937
6489	NC_017060	CTGC	2	8	380168	380175	0 %	25 %	25 %	50 %	384527937
6490	NC_017060	AT	3	6	380180	380185	50 %	50 %	0 %	0 %	384527937
6491	NC_017060	T	6	6	380199	380204	0 %	100 %	0 %	0 %	384527937
6492	NC_017060	CATT	2	8	380642	380649	25 %	50 %	0 %	25 %	384527938
6493	NC_017060	CTG	2	6	380742	380747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527938
6494	NC_017060	A	6	6	380849	380854	100 %	0 %	0 %	0 %	384527938
6495	NC_017060	GA	5	10	380875	380884	50 %	0 %	50 %	0 %	384527938
6496	NC_017060	A	6	6	380893	380898	100 %	0 %	0 %	0 %	384527938
6497	NC_017060	GAC	2	6	380909	380914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527938
6498	NC_017060	CGG	2	6	380950	380955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527938
6499	NC_017060	TAAT	2	8	381010	381017	50 %	50 %	0 %	0 %	384527938
6500	NC_017060	AATA	2	8	381035	381042	75 %	25 %	0 %	0 %	384527938

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