MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA1

Total Repeats: 9998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017060	CAG	2	6	289661	289666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527858
5002	NC_017060	TCA	2	6	289684	289689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527858
5003	NC_017060	ATG	2	6	289707	289712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527858
5004	NC_017060	CAC	2	6	289726	289731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527858
5005	NC_017060	CAG	3	9	289823	289831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527858
5006	NC_017060	CCAG	2	8	289867	289874	25 %	0 %	25 %	50 %	384527858
5007	NC_017060	ATC	2	6	289899	289904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527858
5008	NC_017060	CAT	2	6	289918	289923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527858
5009	NC_017060	CAG	3	9	289973	289981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527858
5010	NC_017060	CGCC	2	8	290018	290025	0 %	0 %	25 %	75 %	384527858
5011	NC_017060	CGG	2	6	290088	290093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527858
5012	NC_017060	ACA	2	6	290157	290162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527859
5013	NC_017060	TGCCC	2	10	290264	290273	0 %	20 %	20 %	60 %	384527859
5014	NC_017060	AGC	2	6	290339	290344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527859
5015	NC_017060	TAA	2	6	290346	290351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527859
5016	NC_017060	GCA	2	6	290355	290360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527859
5017	NC_017060	CG	3	6	290417	290422	0 %	0 %	50 %	50 %	384527859
5018	NC_017060	ATCC	2	8	290434	290441	25 %	25 %	0 %	50 %	384527859
5019	NC_017060	ACG	2	6	290444	290449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527859
5020	NC_017060	GCA	2	6	290493	290498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527859
5021	NC_017060	CCCA	2	8	290587	290594	25 %	0 %	0 %	75 %	384527859
5022	NC_017060	CAG	2	6	290632	290637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527859
5023	NC_017060	CAC	2	6	290689	290694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527859
5024	NC_017060	ACA	2	6	290760	290765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527859
5025	NC_017060	AGGA	2	8	290786	290793	50 %	0 %	50 %	0 %	384527859
5026	NC_017060	C	6	6	290859	290864	0 %	0 %	0 %	100 %	384527859
5027	NC_017060	CCAG	2	8	290877	290884	25 %	0 %	25 %	50 %	384527859
5028	NC_017060	AGC	2	6	290900	290905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527859
5029	NC_017060	CAG	2	6	290937	290942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527859
5030	NC_017060	CAG	2	6	291013	291018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527859
5031	NC_017060	AAC	2	6	291029	291034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527859
5032	NC_017060	ACG	2	6	291055	291060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527859
5033	NC_017060	ATT	2	6	291129	291134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527860
5034	NC_017060	GCT	2	6	291208	291213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527860
5035	NC_017060	CGG	2	6	291250	291255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527860
5036	NC_017060	GTT	2	6	291355	291360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527860
5037	NC_017060	TAA	2	6	291389	291394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527860
5038	NC_017060	CAT	2	6	291405	291410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527860
5039	NC_017060	GTGCTG	2	12	291425	291436	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384527860
5040	NC_017060	TCT	2	6	291533	291538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527860
5041	NC_017060	CGT	2	6	291558	291563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527860
5042	NC_017060	T	6	6	291571	291576	0 %	100 %	0 %	0 %	384527860
5043	NC_017060	CAG	2	6	291583	291588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527860
5044	NC_017060	GCT	2	6	291924	291929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527860
5045	NC_017060	GATA	2	8	292017	292024	50 %	25 %	25 %	0 %	384527860
5046	NC_017060	CGG	2	6	292036	292041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527860
5047	NC_017060	CGC	2	6	292044	292049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527860
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5049	NC_017060	T	6	6	292218	292223	0 %	100 %	0 %	0 %	384527860
5050	NC_017060	GTG	2	6	292229	292234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527860
5051	NC_017060	GTG	3	9	292247	292255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527860
5052	NC_017060	TCA	2	6	292322	292327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527860
5053	NC_017060	TG	3	6	292338	292343	0 %	50 %	50 %	0 %	384527860
5054	NC_017060	ACA	2	6	292383	292388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527860
5055	NC_017060	TCT	2	6	292409	292414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527860
5056	NC_017060	CAGT	2	8	292416	292423	25 %	25 %	25 %	25 %	384527860
5057	NC_017060	TCAGG	2	10	292443	292452	20 %	20 %	40 %	20 %	384527860
5058	NC_017060	GAA	2	6	292594	292599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527860
5059	NC_017060	CCTT	2	8	292706	292713	0 %	50 %	0 %	50 %	384527860
5060	NC_017060	CAT	2	6	292719	292724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527860
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5062	NC_017060	AAG	2	6	292779	292784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527860
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5064	NC_017060	TAA	2	6	292828	292833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527860
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5068	NC_017060	ACC	2	6	293475	293480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527861
5069	NC_017060	TCG	2	6	293512	293517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527861
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5072	NC_017060	TCG	2	6	293796	293801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527861
5073	NC_017060	TCA	2	6	293896	293901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527861
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5077	NC_017060	TGA	2	6	295520	295525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527862
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5080	NC_017060	GGT	2	6	295648	295653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527862
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5093	NC_017060	ACGG	2	8	296120	296127	25 %	0 %	50 %	25 %	384527863
5094	NC_017060	CTT	2	6	296134	296139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527863
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5100	NC_017060	AG	3	6	297970	297975	50 %	0 %	50 %	0 %	384527864
5101	NC_017060	GCA	2	6	298067	298072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527864
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5119	NC_017060	CAT	2	6	299308	299313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527865
5120	NC_017060	CA	3	6	299365	299370	50 %	0 %	0 %	50 %	384527865
5121	NC_017060	CGT	2	6	299418	299423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527865
5122	NC_017060	CGG	2	6	299445	299450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527865
5123	NC_017060	GCG	2	6	299457	299462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527865
5124	NC_017060	GAC	2	6	299573	299578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527865
5125	NC_017060	GCT	2	6	299645	299650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527865
5126	NC_017060	ATC	2	6	299705	299710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527865
5127	NC_017060	GCTG	2	8	299731	299738	0 %	25 %	50 %	25 %	384527865
5128	NC_017060	T	6	6	299752	299757	0 %	100 %	0 %	0 %	384527865
5129	NC_017060	TCA	2	6	299773	299778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527865
5130	NC_017060	CACCGG	2	12	299876	299887	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384527865
5131	NC_017060	TGG	2	6	300003	300008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527865
5132	NC_017060	CGG	2	6	300013	300018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527865
5133	NC_017060	TAA	2	6	300019	300024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527865
5134	NC_017060	GATCT	2	10	300026	300035	20 %	40 %	20 %	20 %	384527865
5135	NC_017060	AAT	2	6	300067	300072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527865
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5138	NC_017060	CAG	2	6	300254	300259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527865
5139	NC_017060	CAGC	2	8	300421	300428	25 %	0 %	25 %	50 %	384527865
5140	NC_017060	TGT	2	6	300519	300524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527865
5141	NC_017060	GCCGG	2	10	300554	300563	0 %	0 %	60 %	40 %	384527865
5142	NC_017060	AAG	2	6	300797	300802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527866
5143	NC_017060	CGC	2	6	300806	300811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527866
5144	NC_017060	GTG	2	6	300812	300817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527866
5145	NC_017060	TG	3	6	300827	300832	0 %	50 %	50 %	0 %	384527866
5146	NC_017060	CGGG	2	8	300879	300886	0 %	0 %	75 %	25 %	384527866
5147	NC_017060	CA	4	8	300981	300988	50 %	0 %	0 %	50 %	384527866
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5149	NC_017060	CAT	2	6	301152	301157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527866
5150	NC_017060	GCT	2	6	301188	301193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527866
5151	NC_017060	AGT	2	6	301215	301220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527866
5152	NC_017060	CAC	2	6	301296	301301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527866
5153	NC_017060	CGC	2	6	301349	301354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527866
5154	NC_017060	TGC	2	6	301362	301367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527866
5155	NC_017060	TGA	2	6	301466	301471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527866
5156	NC_017060	CGA	2	6	301476	301481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527866
5157	NC_017060	CGG	3	9	301575	301583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527866
5158	NC_017060	GC	3	6	301608	301613	0 %	0 %	50 %	50 %	384527866
5159	NC_017060	GGC	2	6	301639	301644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527866
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5162	NC_017060	GC	3	6	301731	301736	0 %	0 %	50 %	50 %	384527866
5163	NC_017060	CTGA	2	8	301756	301763	25 %	25 %	25 %	25 %	384527866
5164	NC_017060	TGG	2	6	301799	301804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527866
5165	NC_017060	TGG	2	6	301826	301831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527866
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5168	NC_017060	GCTG	2	8	302022	302029	0 %	25 %	50 %	25 %	384527866
5169	NC_017060	TCAGGC	2	12	302359	302370	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384527867
5170	NC_017060	TGG	2	6	302395	302400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527867
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5172	NC_017060	GC	3	6	302495	302500	0 %	0 %	50 %	50 %	384527867
5173	NC_017060	CGT	2	6	302539	302544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527867
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5177	NC_017060	A	6	6	302888	302893	100 %	0 %	0 %	0 %	384527867
5178	NC_017060	GATCA	2	10	302897	302906	40 %	20 %	20 %	20 %	384527867
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5182	NC_017060	CCGA	2	8	303179	303186	25 %	0 %	25 %	50 %	384527867
5183	NC_017060	CTG	2	6	303237	303242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527867
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5194	NC_017060	TGC	3	9	304112	304120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527868
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5200	NC_017060	TGA	2	6	304223	304228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527868
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5202	NC_017060	CGT	2	6	304253	304258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527868
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5212	NC_017060	CAGT	2	8	304692	304699	25 %	25 %	25 %	25 %	384527868
5213	NC_017060	TGC	2	6	304715	304720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527868
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5218	NC_017060	AATG	2	8	304989	304996	50 %	25 %	25 %	0 %	384527869
5219	NC_017060	CTG	2	6	305019	305024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527869
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5224	NC_017060	GTTTGC	2	12	305399	305410	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384527869
5225	NC_017060	CGA	2	6	305420	305425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527869
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5227	NC_017060	CGACC	2	10	305507	305516	20 %	0 %	20 %	60 %	384527869
5228	NC_017060	GCG	4	12	305520	305531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527869
5229	NC_017060	TGC	2	6	305560	305565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527869
5230	NC_017060	CTG	2	6	305577	305582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527869
5231	NC_017060	CGC	2	6	305583	305588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527869
5232	NC_017060	ACA	2	6	305616	305621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527869
5233	NC_017060	TGAC	2	8	305717	305724	25 %	25 %	25 %	25 %	384527870
5234	NC_017060	A	7	7	305734	305740	100 %	0 %	0 %	0 %	384527870
5235	NC_017060	TGC	2	6	305799	305804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527870
5236	NC_017060	GAT	2	6	305928	305933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527870
5237	NC_017060	CGG	2	6	305946	305951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527870
5238	NC_017060	ATT	2	6	306096	306101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527870
5239	NC_017060	TGA	2	6	306102	306107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527870
5240	NC_017060	GCA	2	6	306125	306130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527870
5241	NC_017060	GCA	2	6	306155	306160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527870
5242	NC_017060	GCG	2	6	306202	306207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527870
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5484	NC_017060	TGT	2	6	320976	320981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527884
5485	NC_017060	TTC	2	6	321000	321005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527884
5486	NC_017060	TATC	2	8	321031	321038	25 %	50 %	0 %	25 %	384527884
5487	NC_017060	TC	3	6	321037	321042	0 %	50 %	0 %	50 %	384527884
5488	NC_017060	CAG	2	6	321078	321083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527884
5489	NC_017060	TAT	2	6	321107	321112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527884
5490	NC_017060	ATT	2	6	321116	321121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527884
5491	NC_017060	ATC	2	6	321122	321127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527884
5492	NC_017060	TCG	2	6	321128	321133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527884
5493	NC_017060	ATC	2	6	321194	321199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527884
5494	NC_017060	AT	3	6	321241	321246	50 %	50 %	0 %	0 %	384527884
5495	NC_017060	AT	3	6	321256	321261	50 %	50 %	0 %	0 %	384527884
5496	NC_017060	TAA	2	6	321277	321282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527884
5497	NC_017060	TTC	2	6	321369	321374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527884
5498	NC_017060	ATT	2	6	321464	321469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527884
5499	NC_017060	TTGC	2	8	321495	321502	0 %	50 %	25 %	25 %	384527884
5500	NC_017060	ATTT	2	8	321531	321538	25 %	75 %	0 %	0 %	384527884

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