MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA1

Total Repeats: 9998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017060	GCTGGC	2	12	263043	263054	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384527834
4502	NC_017060	TCG	2	6	263119	263124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527834
4503	NC_017060	TCA	2	6	263192	263197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527834
4504	NC_017060	ACA	2	6	263200	263205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527834
4505	NC_017060	A	7	7	263217	263223	100 %	0 %	0 %	0 %	384527834
4506	NC_017060	ATC	2	6	263226	263231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527834
4507	NC_017060	AAC	2	6	263263	263268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527834
4508	NC_017060	AAG	2	6	263274	263279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527834
4509	NC_017060	CTT	2	6	263301	263306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527834
4510	NC_017060	ATT	2	6	263310	263315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527834
4511	NC_017060	T	6	6	263335	263340	0 %	100 %	0 %	0 %	384527835
4512	NC_017060	ATT	2	6	263341	263346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527835
4513	NC_017060	AATG	2	8	263501	263508	50 %	25 %	25 %	0 %	384527835
4514	NC_017060	GCG	2	6	263629	263634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527835
4515	NC_017060	TAT	2	6	263679	263684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527835
4516	NC_017060	CAT	2	6	263701	263706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527835
4517	NC_017060	ATC	2	6	263738	263743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527835
4518	NC_017060	CCG	2	6	263789	263794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527835
4519	NC_017060	T	7	7	263878	263884	0 %	100 %	0 %	0 %	384527835
4520	NC_017060	GAA	2	6	263994	263999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527835
4521	NC_017060	CTC	2	6	264073	264078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384527835
4522	NC_017060	AGC	2	6	264095	264100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527835
4523	NC_017060	TCA	2	6	264264	264269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527835
4524	NC_017060	ACA	2	6	264336	264341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527835
4525	NC_017060	AAG	2	6	264353	264358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527835
4526	NC_017060	GCC	2	6	264394	264399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527836
4527	NC_017060	ATA	2	6	264456	264461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527836
4528	NC_017060	ATCCC	2	10	264482	264491	20 %	20 %	0 %	60 %	384527836
4529	NC_017060	TGA	2	6	264502	264507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527836
4530	NC_017060	GAT	2	6	264521	264526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527836
4531	NC_017060	AATACC	2	12	264534	264545	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384527836
4532	NC_017060	CAA	2	6	264589	264594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527836
4533	NC_017060	GCT	2	6	264638	264643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527836
4534	NC_017060	ATT	2	6	264654	264659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527836
4535	NC_017060	CAG	2	6	264716	264721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527836
4536	NC_017060	AAT	2	6	264728	264733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527836
4537	NC_017060	GCA	2	6	264757	264762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527836
4538	NC_017060	TTC	2	6	264773	264778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527836
4539	NC_017060	GCT	2	6	264782	264787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527836
4540	NC_017060	TTAA	2	8	264804	264811	50 %	50 %	0 %	0 %	384527836
4541	NC_017060	CGG	2	6	264838	264843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527836
4542	NC_017060	CAG	2	6	264929	264934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527836
4543	NC_017060	AGCAG	2	10	265083	265092	40 %	0 %	40 %	20 %	384527836
4544	NC_017060	ATA	2	6	265110	265115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527836
4545	NC_017060	GC	3	6	265207	265212	0 %	0 %	50 %	50 %	384527836
4546	NC_017060	GCA	2	6	265264	265269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527836
4547	NC_017060	GGAAA	2	10	265271	265280	60 %	0 %	40 %	0 %	384527836
4548	NC_017060	CGC	2	6	265363	265368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527836
4549	NC_017060	CAG	2	6	265370	265375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527836
4550	NC_017060	CAG	2	6	265403	265408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527836
4551	NC_017060	CGC	2	6	265415	265420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527836
4552	NC_017060	AAAT	2	8	265539	265546	75 %	25 %	0 %	0 %	384527836
4553	NC_017060	TTTC	2	8	265555	265562	0 %	75 %	0 %	25 %	384527836
4554	NC_017060	CCA	2	6	265615	265620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527836
4555	NC_017060	ATC	2	6	265623	265628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527836
4556	NC_017060	CAG	2	6	265643	265648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527836
4557	NC_017060	ATC	3	9	265781	265789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527837
4558	NC_017060	GCCC	2	8	265833	265840	0 %	0 %	25 %	75 %	384527837
4559	NC_017060	GGTT	2	8	265857	265864	0 %	50 %	50 %	0 %	384527837
4560	NC_017060	TCTG	2	8	265949	265956	0 %	50 %	25 %	25 %	384527837
4561	NC_017060	GGT	2	6	265999	266004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527837
4562	NC_017060	CG	3	6	266024	266029	0 %	0 %	50 %	50 %	384527837
4563	NC_017060	GC	3	6	266077	266082	0 %	0 %	50 %	50 %	384527837
4564	NC_017060	AAG	2	6	266088	266093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527837
4565	NC_017060	ATC	2	6	266110	266115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527837
4566	NC_017060	TGC	2	6	266138	266143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527837
4567	NC_017060	TGC	2	6	266186	266191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527837
4568	NC_017060	CTG	2	6	266211	266216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527837
4569	NC_017060	CGC	2	6	266232	266237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527837
4570	NC_017060	CGC	2	6	266244	266249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527837
4571	NC_017060	AAAGT	2	10	266317	266326	60 %	20 %	20 %	0 %	384527837
4572	NC_017060	CA	3	6	266343	266348	50 %	0 %	0 %	50 %	384527837
4573	NC_017060	GTG	2	6	266403	266408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527838
4574	NC_017060	TTGAT	2	10	266421	266430	20 %	60 %	20 %	0 %	384527838
4575	NC_017060	TTC	2	6	266459	266464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527838
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4578	NC_017060	GACAT	2	10	266553	266562	40 %	20 %	20 %	20 %	384527838
4579	NC_017060	CAT	2	6	266572	266577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527838
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4581	NC_017060	T	7	7	266623	266629	0 %	100 %	0 %	0 %	384527839
4582	NC_017060	ATCCCC	2	12	266653	266664	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	384527839
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4585	NC_017060	TAAA	2	8	266720	266727	75 %	25 %	0 %	0 %	384527839
4586	NC_017060	AT	3	6	266759	266764	50 %	50 %	0 %	0 %	384527839
4587	NC_017060	ATA	2	6	266904	266909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527839
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4590	NC_017060	ATT	2	6	266967	266972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527839
4591	NC_017060	CGG	2	6	266996	267001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527839
4592	NC_017060	GAG	2	6	267036	267041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384527839
4593	NC_017060	GCA	2	6	267046	267051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527839
4594	NC_017060	TAT	2	6	267071	267076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527839
4595	NC_017060	TTA	2	6	267082	267087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527839
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4600	NC_017060	TCA	2	6	267250	267255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527839
4601	NC_017060	CAG	2	6	267259	267264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527839
4602	NC_017060	TCA	2	6	267265	267270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527839
4603	NC_017060	A	7	7	267270	267276	100 %	0 %	0 %	0 %	384527839
4604	NC_017060	TAT	2	6	267278	267283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527839
4605	NC_017060	GCGTTT	2	12	267284	267295	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384527839
4606	NC_017060	TTCA	2	8	267339	267346	25 %	50 %	0 %	25 %	384527839
4607	NC_017060	CGG	2	6	267766	267771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527840
4608	NC_017060	CGG	2	6	267858	267863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527840
4609	NC_017060	CAG	2	6	267865	267870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527840
4610	NC_017060	CGA	2	6	267927	267932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527840
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4612	NC_017060	TGAC	2	8	268062	268069	25 %	25 %	25 %	25 %	384527840
4613	NC_017060	TCA	2	6	268091	268096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527840
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4617	NC_017060	GCTGGC	2	12	268237	268248	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384527840
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4852	NC_017060	TAATGA	2	12	280987	280998	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384527849
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4855	NC_017060	GCC	2	6	281201	281206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527850
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4858	NC_017060	A	7	7	281587	281593	100 %	0 %	0 %	0 %	384527851
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4863	NC_017060	GCA	2	6	281895	281900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527851
4864	NC_017060	GAT	2	6	281920	281925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527851
4865	NC_017060	GCG	2	6	281949	281954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527851
4866	NC_017060	CAGC	2	8	281958	281965	25 %	0 %	25 %	50 %	384527851
4867	NC_017060	TGCC	2	8	281993	282000	0 %	25 %	25 %	50 %	384527851
4868	NC_017060	AGA	2	6	282023	282028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527851
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4983	NC_017060	CAGTG	2	10	288615	288624	20 %	20 %	40 %	20 %	384527857
4984	NC_017060	ATG	2	6	288679	288684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527857
4985	NC_017060	TCA	2	6	288725	288730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527857
4986	NC_017060	ATC	2	6	288763	288768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527857
4987	NC_017060	ATC	2	6	288886	288891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527857
4988	NC_017060	CCTG	2	8	289072	289079	0 %	25 %	25 %	50 %	384527857
4989	NC_017060	CG	3	6	289104	289109	0 %	0 %	50 %	50 %	384527857
4990	NC_017060	T	6	6	289175	289180	0 %	100 %	0 %	0 %	384527857
4991	NC_017060	TAA	2	6	289249	289254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527858
4992	NC_017060	CGCCA	2	10	289259	289268	20 %	0 %	20 %	60 %	384527858
4993	NC_017060	GGC	2	6	289269	289274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527858
4994	NC_017060	CGC	2	6	289316	289321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527858
4995	NC_017060	CAT	2	6	289325	289330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527858
4996	NC_017060	CGG	2	6	289349	289354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527858
4997	NC_017060	CAC	2	6	289355	289360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527858
4998	NC_017060	CAC	2	6	289427	289432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527858
4999	NC_017060	GA	3	6	289533	289538	50 %	0 %	50 %	0 %	384527858
5000	NC_017060	AC	3	6	289606	289611	50 %	0 %	0 %	50 %	384527858

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