MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodospirillum photometricum DSM 122

Total Repeats: 76114

< Previous12...141142143144145146147148149150151152153Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
76001	NC_017059	CGG	2	6	3867184	3867189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384263627
76002	NC_017059	CCG	2	6	3867214	3867219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384263627
76003	NC_017059	AGA	2	6	3867249	3867254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384263627
76004	NC_017059	CG	3	6	3867268	3867273	0 %	0 %	50 %	50 %	384263627
76005	NC_017059	TGG	2	6	3867277	3867282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384263627
76006	NC_017059	CTGAC	2	10	3867305	3867314	20 %	20 %	20 %	40 %	384263627
76007	NC_017059	GGA	2	6	3867408	3867413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384263627
76008	NC_017059	TG	3	6	3867427	3867432	0 %	50 %	50 %	0 %	384263627
76009	NC_017059	CGC	3	9	3867443	3867451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384263627
76010	NC_017059	CGT	2	6	3867520	3867525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384263627
76011	NC_017059	CATC	2	8	3867526	3867533	25 %	25 %	0 %	50 %	384263627
76012	NC_017059	G	7	7	3867568	3867574	0 %	0 %	100 %	0 %	384263627
76013	NC_017059	CGA	2	6	3867578	3867583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384263627
76014	NC_017059	GGGT	2	8	3867712	3867719	0 %	25 %	75 %	0 %	384263627
76015	NC_017059	GGT	2	6	3867781	3867786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384263627
76016	NC_017059	CAA	2	6	3867793	3867798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384263627
76017	NC_017059	CTC	2	6	3867907	3867912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384263627
76018	NC_017059	CTC	2	6	3867923	3867928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384263627
76019	NC_017059	GCCC	2	8	3867975	3867982	0 %	0 %	25 %	75 %	384263627
76020	NC_017059	TTG	2	6	3867984	3867989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384263627
76021	NC_017059	TCG	2	6	3868020	3868025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384263627
76022	NC_017059	ACC	2	6	3868101	3868106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384263627
76023	NC_017059	AGCCCC	2	12	3868128	3868139	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384263627
76024	NC_017059	AAC	2	6	3868364	3868369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384263627
76025	NC_017059	GAC	2	6	3868382	3868387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384263627
76026	NC_017059	GC	3	6	3868406	3868411	0 %	0 %	50 %	50 %	384263627
76027	NC_017059	CAA	2	6	3868511	3868516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384263627
76028	NC_017059	GAG	2	6	3868523	3868528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384263627
76029	NC_017059	CTGTG	2	10	3868600	3868609	0 %	40 %	40 %	20 %	384263627
76030	NC_017059	CGA	2	6	3868631	3868636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384263627
76031	NC_017059	ATCA	2	8	3868667	3868674	50 %	25 %	0 %	25 %	384263627
76032	NC_017059	GGAT	2	8	3868691	3868698	25 %	25 %	50 %	0 %	384263627
76033	NC_017059	C	7	7	3868711	3868717	0 %	0 %	0 %	100 %	384263627
76034	NC_017059	G	6	6	3868748	3868753	0 %	0 %	100 %	0 %	384263627
76035	NC_017059	CG	3	6	3868815	3868820	0 %	0 %	50 %	50 %	384263627
76036	NC_017059	TCG	2	6	3868836	3868841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384263627
76037	NC_017059	GCC	2	6	3868851	3868856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384263627
76038	NC_017059	GTTG	2	8	3868873	3868880	0 %	50 %	50 %	0 %	384263627
76039	NC_017059	GGC	2	6	3868997	3869002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384263627
76040	NC_017059	GCA	2	6	3869023	3869028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384263627
76041	NC_017059	TGG	2	6	3869058	3869063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384263627
76042	NC_017059	G	7	7	3869135	3869141	0 %	0 %	100 %	0 %	384263627
76043	NC_017059	C	6	6	3869146	3869151	0 %	0 %	0 %	100 %	384263627
76044	NC_017059	GCG	2	6	3869153	3869158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384263627
76045	NC_017059	CGG	2	6	3869168	3869173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384263627
76046	NC_017059	CT	4	8	3869190	3869197	0 %	50 %	0 %	50 %	384263627
76047	NC_017059	GTC	2	6	3869219	3869224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384263627
76048	NC_017059	GAA	2	6	3869225	3869230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384263627
76049	NC_017059	CAC	2	6	3869277	3869282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384263627
76050	NC_017059	ATCA	2	8	3869286	3869293	50 %	25 %	0 %	25 %	384263627
76051	NC_017059	TGCG	2	8	3869302	3869309	0 %	25 %	50 %	25 %	384263627
76052	NC_017059	ACC	2	6	3869371	3869376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384263627
76053	NC_017059	GGTGG	2	10	3869412	3869421	0 %	20 %	80 %	0 %	384263627
76054	NC_017059	GGC	2	6	3869450	3869455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384263629
76055	NC_017059	GTC	2	6	3869485	3869490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384263629
76056	NC_017059	GTT	2	6	3869577	3869582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384263629
76057	NC_017059	ACAA	2	8	3869584	3869591	75 %	0 %	0 %	25 %	384263629
76058	NC_017059	TCT	2	6	3869659	3869664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384263629
76059	NC_017059	TTC	2	6	3869686	3869691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384263629
76060	NC_017059	TGT	2	6	3869716	3869721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384263629
76061	NC_017059	TCG	2	6	3869722	3869727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384263629
76062	NC_017059	TTTC	2	8	3869741	3869748	0 %	75 %	0 %	25 %	384263629
76063	NC_017059	CGG	2	6	3869787	3869792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384263629
76064	NC_017059	GTC	2	6	3869856	3869861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384263629
76065	NC_017059	CGG	2	6	3870005	3870010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384263629
76066	NC_017059	GCC	2	6	3870142	3870147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384263629
76067	NC_017059	TCG	2	6	3870208	3870213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384263629
76068	NC_017059	G	9	9	3870250	3870258	0 %	0 %	100 %	0 %	384263629
76069	NC_017059	GAG	2	6	3870268	3870273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384263629
76070	NC_017059	GGTT	2	8	3870310	3870317	0 %	50 %	50 %	0 %	384263629
76071	NC_017059	A	6	6	3870356	3870361	100 %	0 %	0 %	0 %	384263629
76072	NC_017059	AAT	2	6	3870441	3870446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384263629
76073	NC_017059	T	7	7	3870446	3870452	0 %	100 %	0 %	0 %	384263629
76074	NC_017059	AAG	2	6	3870458	3870463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384263629
76075	NC_017059	AGAT	2	8	3870469	3870476	50 %	25 %	25 %	0 %	384263629
76076	NC_017059	GT	3	6	3870507	3870512	0 %	50 %	50 %	0 %	384263629
76077	NC_017059	AAGG	2	8	3870514	3870521	50 %	0 %	50 %	0 %	384263629
76078	NC_017059	A	7	7	3870603	3870609	100 %	0 %	0 %	0 %	384263629
76079	NC_017059	CGG	2	6	3870635	3870640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384263629
76080	NC_017059	G	8	8	3870722	3870729	0 %	0 %	100 %	0 %	384263629
76081	NC_017059	CGGG	2	8	3870738	3870745	0 %	0 %	75 %	25 %	384263629
76082	NC_017059	CCT	2	6	3870785	3870790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384263629
76083	NC_017059	GCAG	2	8	3870801	3870808	25 %	0 %	50 %	25 %	384263629
76084	NC_017059	TCG	2	6	3870826	3870831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384263629
76085	NC_017059	CCG	2	6	3870878	3870883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384263629
76086	NC_017059	CA	3	6	3870886	3870891	50 %	0 %	0 %	50 %	384263629
76087	NC_017059	A	6	6	3870904	3870909	100 %	0 %	0 %	0 %	384263629
76088	NC_017059	TCGA	2	8	3871020	3871027	25 %	25 %	25 %	25 %	384263629
76089	NC_017059	GCG	2	6	3871029	3871034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384263629
76090	NC_017059	CAA	2	6	3871086	3871091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384263629
76091	NC_017059	GGA	2	6	3871136	3871141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384263629
76092	NC_017059	CGG	2	6	3871211	3871216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384263629
76093	NC_017059	GAT	2	6	3871221	3871226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384263629
76094	NC_017059	CCA	2	6	3871234	3871239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384263629
76095	NC_017059	CGG	2	6	3871280	3871285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384263629
76096	NC_017059	CGT	2	6	3871343	3871348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384263629
76097	NC_017059	A	7	7	3871409	3871415	100 %	0 %	0 %	0 %	384263629
76098	NC_017059	GGA	2	6	3871435	3871440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384263629
76099	NC_017059	ACC	2	6	3871531	3871536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384263629
76100	NC_017059	CTCGC	2	10	3871546	3871555	0 %	20 %	20 %	60 %	384263629
76101	NC_017059	GCA	2	6	3871580	3871585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384263629
76102	NC_017059	T	6	6	3871601	3871606	0 %	100 %	0 %	0 %	384263629
76103	NC_017059	ATG	2	6	3871630	3871635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384263629
76104	NC_017059	GGC	2	6	3871662	3871667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384263629
76105	NC_017059	ACC	2	6	3871692	3871697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384263629
76106	NC_017059	AACC	2	8	3871779	3871786	50 %	0 %	0 %	50 %	384263629
76107	NC_017059	AGGG	2	8	3871810	3871817	25 %	0 %	75 %	0 %	384263629
76108	NC_017059	GC	3	6	3871818	3871823	0 %	0 %	50 %	50 %	384263629
76109	NC_017059	GC	3	6	3871833	3871838	0 %	0 %	50 %	50 %	384263629
76110	NC_017059	AAATT	2	10	3871896	3871905	60 %	40 %	0 %	0 %	384263629
76111	NC_017059	TC	3	6	3871915	3871920	0 %	50 %	0 %	50 %	384263629
76112	NC_017059	G	6	6	3871943	3871948	0 %	0 %	100 %	0 %	384263629
76113	NC_017059	GGC	2	6	3871994	3871999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384263629
76114	NC_017059	GAG	3	9	3873065	3873073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384263630

< Previous12...141142143144145146147148149150151152153Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.