MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia australis str. Cutlack chromosome

Total Repeats: 24412

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017058	GCT	2	6	167664	167669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501080
3002	NC_017058	CCG	2	6	167695	167700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383501080
3003	NC_017058	TC	3	6	167722	167727	0 %	50 %	0 %	50 %	383501080
3004	NC_017058	TAA	2	6	167736	167741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501080
3005	NC_017058	A	6	6	167740	167745	100 %	0 %	0 %	0 %	383501080
3006	NC_017058	A	6	6	167749	167754	100 %	0 %	0 %	0 %	383501080
3007	NC_017058	A	6	6	167809	167814	100 %	0 %	0 %	0 %	383501080
3008	NC_017058	T	6	6	167874	167879	0 %	100 %	0 %	0 %	383501080
3009	NC_017058	A	8	8	167882	167889	100 %	0 %	0 %	0 %	383501080
3010	NC_017058	TTG	3	9	167913	167921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383501081
3011	NC_017058	TAA	2	6	167979	167984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501081
3012	NC_017058	TCT	2	6	168016	168021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501081
3013	NC_017058	TGA	2	6	168022	168027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501081
3014	NC_017058	TAT	2	6	168033	168038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501081
3015	NC_017058	ATTAA	2	10	168070	168079	60 %	40 %	0 %	0 %	383501081
3016	NC_017058	TCA	2	6	168121	168126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501081
3017	NC_017058	T	6	6	168199	168204	0 %	100 %	0 %	0 %	383501081
3018	NC_017058	TTA	2	6	168220	168225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501081
3019	NC_017058	ATT	2	6	168285	168290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501081
3020	NC_017058	GCA	2	6	168364	168369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383501081
3021	NC_017058	AT	3	6	168408	168413	50 %	50 %	0 %	0 %	383501081
3022	NC_017058	AG	3	6	168433	168438	50 %	0 %	50 %	0 %	383501081
3023	NC_017058	T	6	6	168473	168478	0 %	100 %	0 %	0 %	383501081
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3025	NC_017058	GAGAAA	2	12	168527	168538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501081
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3028	NC_017058	TTA	2	6	168666	168671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501082
3029	NC_017058	AG	3	6	168684	168689	50 %	0 %	50 %	0 %	383501082
3030	NC_017058	T	7	7	168690	168696	0 %	100 %	0 %	0 %	383501082
3031	NC_017058	TAC	2	6	168757	168762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501082
3032	NC_017058	GAA	2	6	168777	168782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501082
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3034	NC_017058	TACTTT	2	12	168815	168826	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383501082
3035	NC_017058	TAT	2	6	168854	168859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501082
3036	NC_017058	CGTTA	2	10	168956	168965	20 %	40 %	20 %	20 %	383501082
3037	NC_017058	TATT	2	8	169219	169226	25 %	75 %	0 %	0 %	383501083
3038	NC_017058	ATTT	2	8	169229	169236	25 %	75 %	0 %	0 %	383501083
3039	NC_017058	T	6	6	169234	169239	0 %	100 %	0 %	0 %	383501083
3040	NC_017058	TAT	2	6	169241	169246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501083
3041	NC_017058	AT	3	6	169248	169253	50 %	50 %	0 %	0 %	383501083
3042	NC_017058	ATT	2	6	169258	169263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501083
3043	NC_017058	GCT	2	6	169267	169272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501083
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3052	NC_017058	GCAG	2	8	170499	170506	25 %	0 %	50 %	25 %	383501084
3053	NC_017058	A	6	6	170523	170528	100 %	0 %	0 %	0 %	383501084
3054	NC_017058	ACA	2	6	170538	170543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383501084
3055	NC_017058	A	6	6	170543	170548	100 %	0 %	0 %	0 %	383501084
3056	NC_017058	ATG	2	6	170566	170571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501084
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3058	NC_017058	T	6	6	170635	170640	0 %	100 %	0 %	0 %	383501084
3059	NC_017058	AT	3	6	170644	170649	50 %	50 %	0 %	0 %	383501084
3060	NC_017058	AAG	2	6	170728	170733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501084
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3062	NC_017058	ATA	2	6	170787	170792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501084
3063	NC_017058	A	7	7	170792	170798	100 %	0 %	0 %	0 %	383501084
3064	NC_017058	AAG	2	6	170803	170808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501084
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3070	NC_017058	AAAAT	2	10	170926	170935	80 %	20 %	0 %	0 %	383501084
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3090	NC_017058	AT	3	6	171573	171578	50 %	50 %	0 %	0 %	383501085
3091	NC_017058	AAT	2	6	171588	171593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501085
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3093	NC_017058	A	6	6	171620	171625	100 %	0 %	0 %	0 %	383501085
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3100	NC_017058	ATC	2	6	171855	171860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501085
3101	NC_017058	T	6	6	171870	171875	0 %	100 %	0 %	0 %	383501085
3102	NC_017058	TTGATA	2	12	171884	171895	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383501085
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3105	NC_017058	TAT	2	6	171995	172000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501085
3106	NC_017058	A	7	7	172021	172027	100 %	0 %	0 %	0 %	383501085
3107	NC_017058	TAA	2	6	172028	172033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501085
3108	NC_017058	AGTAG	2	10	172132	172141	40 %	20 %	40 %	0 %	383501085
3109	NC_017058	A	7	7	172200	172206	100 %	0 %	0 %	0 %	383501085
3110	NC_017058	TAG	2	6	172256	172261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501085
3111	NC_017058	TTA	2	6	172346	172351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501085
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3118	NC_017058	AT	3	6	172572	172577	50 %	50 %	0 %	0 %	383501086
3119	NC_017058	TAT	2	6	172655	172660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501086
3120	NC_017058	TAA	2	6	172696	172701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501086
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3122	NC_017058	TAA	2	6	172894	172899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501086
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3495	NC_017058	TAAT	2	8	191721	191728	50 %	50 %	0 %	0 %	383501104
3496	NC_017058	ATT	2	6	191746	191751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501104
3497	NC_017058	ATAGAT	2	12	191752	191763	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383501104
3498	NC_017058	TTA	2	6	191778	191783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501104
3499	NC_017058	AATA	2	8	191794	191801	75 %	25 %	0 %	0 %	383501104
3500	NC_017058	GAA	2	6	191833	191838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501104

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