MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia australis str. Cutlack chromosome

Total Repeats: 24412

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_017058	TAT	2	6	319565	319570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501225
6003	NC_017058	CTTT	2	8	319630	319637	0 %	75 %	0 %	25 %	383501225
6004	NC_017058	TAC	2	6	319644	319649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501225
6005	NC_017058	T	8	8	319654	319661	0 %	100 %	0 %	0 %	383501225
6006	NC_017058	A	6	6	319709	319714	100 %	0 %	0 %	0 %	383501225
6007	NC_017058	TATC	2	8	319729	319736	25 %	50 %	0 %	25 %	383501226
6008	NC_017058	CAC	2	6	319770	319775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383501226
6009	NC_017058	TTGC	2	8	319847	319854	0 %	50 %	25 %	25 %	383501226
6010	NC_017058	ATT	2	6	319867	319872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501226
6011	NC_017058	AT	3	6	319981	319986	50 %	50 %	0 %	0 %	383501226
6012	NC_017058	ATC	2	6	319996	320001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501226
6013	NC_017058	TCT	2	6	320012	320017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501226
6014	NC_017058	ATTGT	2	10	320084	320093	20 %	60 %	20 %	0 %	383501226
6015	NC_017058	TTG	2	6	320103	320108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383501226
6016	NC_017058	TGT	2	6	320153	320158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383501226
6017	NC_017058	T	6	6	320164	320169	0 %	100 %	0 %	0 %	383501226
6018	NC_017058	TAAC	2	8	320246	320253	50 %	25 %	0 %	25 %	383501226
6019	NC_017058	CAA	2	6	320313	320318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383501226
6020	NC_017058	TCG	2	6	320385	320390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501226
6021	NC_017058	GT	3	6	320446	320451	0 %	50 %	50 %	0 %	383501226
6022	NC_017058	GGA	2	6	320582	320587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383501226
6023	NC_017058	CTG	2	6	320601	320606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501226
6024	NC_017058	ATC	2	6	320635	320640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501226
6025	NC_017058	TTA	4	12	320729	320740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501226
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6027	NC_017058	TGC	2	6	320838	320843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501226
6028	NC_017058	TTG	3	9	320906	320914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383501226
6029	NC_017058	ATT	2	6	320947	320952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501226
6030	NC_017058	AT	3	6	321053	321058	50 %	50 %	0 %	0 %	383501226
6031	NC_017058	TC	3	6	321180	321185	0 %	50 %	0 %	50 %	383501226
6032	NC_017058	AT	3	6	321203	321208	50 %	50 %	0 %	0 %	383501226
6033	NC_017058	AGA	2	6	321256	321261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501226
6034	NC_017058	GGAGGT	2	12	321314	321325	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	383501226
6035	NC_017058	TGTT	2	8	321388	321395	0 %	75 %	25 %	0 %	383501226
6036	NC_017058	TAA	2	6	321434	321439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501226
6037	NC_017058	TTA	2	6	321455	321460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501226
6038	NC_017058	CT	3	6	321525	321530	0 %	50 %	0 %	50 %	383501226
6039	NC_017058	ATT	2	6	321571	321576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501226
6040	NC_017058	GTA	2	6	321672	321677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501226
6041	NC_017058	ATC	2	6	321799	321804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501226
6042	NC_017058	TAA	2	6	321809	321814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501226
6043	NC_017058	TTAA	2	8	321956	321963	50 %	50 %	0 %	0 %	383501226
6044	NC_017058	GAAA	2	8	322001	322008	75 %	0 %	25 %	0 %	383501226
6045	NC_017058	TAT	2	6	322098	322103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501226
6046	NC_017058	TAA	2	6	322104	322109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501226
6047	NC_017058	TTG	2	6	322112	322117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383501226
6048	NC_017058	TAC	2	6	322129	322134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501226
6049	NC_017058	T	6	6	322199	322204	0 %	100 %	0 %	0 %	383501226
6050	NC_017058	AT	3	6	322212	322217	50 %	50 %	0 %	0 %	383501226
6051	NC_017058	AGCATT	2	12	322222	322233	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383501226
6052	NC_017058	TGG	3	9	322264	322272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383501226
6053	NC_017058	TTA	2	6	322356	322361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501226
6054	NC_017058	A	6	6	322373	322378	100 %	0 %	0 %	0 %	383501226
6055	NC_017058	ATTG	2	8	322406	322413	25 %	50 %	25 %	0 %	383501226
6056	NC_017058	ATC	2	6	322445	322450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501226
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6058	NC_017058	TAA	2	6	322465	322470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501226
6059	NC_017058	TGA	2	6	322547	322552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501226
6060	NC_017058	TTA	2	6	322694	322699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501226
6061	NC_017058	ATA	2	6	322857	322862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501226
6062	NC_017058	CAA	2	6	322901	322906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383501226
6063	NC_017058	AGTAA	2	10	322948	322957	60 %	20 %	20 %	0 %	383501226
6064	NC_017058	CTA	2	6	322958	322963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501226
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6073	NC_017058	TAAT	2	8	323513	323520	50 %	50 %	0 %	0 %	383501227
6074	NC_017058	GGA	2	6	323531	323536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383501227
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6081	NC_017058	ATAA	2	8	323833	323840	75 %	25 %	0 %	0 %	383501227
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6107	NC_017058	TCT	2	6	324830	324835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501227
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6112	NC_017058	T	6	6	325063	325068	0 %	100 %	0 %	0 %	383501227
6113	NC_017058	TTA	3	9	325092	325100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501227
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6118	NC_017058	TA	3	6	325314	325319	50 %	50 %	0 %	0 %	383501227
6119	NC_017058	A	6	6	325335	325340	100 %	0 %	0 %	0 %	383501227
6120	NC_017058	ATT	2	6	325405	325410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501227
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6122	NC_017058	TAAT	2	8	325467	325474	50 %	50 %	0 %	0 %	383501227
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6497	NC_017058	GGCG	2	8	343919	343926	0 %	0 %	75 %	25 %	383501239
6498	NC_017058	ATG	2	6	343951	343956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501239
6499	NC_017058	CGC	2	6	343971	343976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383501239
6500	NC_017058	TAC	2	6	343984	343989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501239

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