MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. RpGvF24 chromosome

Total Repeats: 21948

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017057	CAT	2	6	179530	179535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500235
3502	NC_017057	TTA	2	6	179536	179541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500235
3503	NC_017057	TTA	2	6	179556	179561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500235
3504	NC_017057	TTA	2	6	179589	179594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500235
3505	NC_017057	TAC	2	6	179686	179691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500235
3506	NC_017057	ATA	2	6	179713	179718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500235
3507	NC_017057	GTT	2	6	179777	179782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383500235
3508	NC_017057	T	6	6	179866	179871	0 %	100 %	0 %	0 %	383500235
3509	NC_017057	TTA	2	6	179879	179884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500236
3510	NC_017057	T	7	7	179896	179902	0 %	100 %	0 %	0 %	383500236
3511	NC_017057	ATTA	2	8	179929	179936	50 %	50 %	0 %	0 %	383500236
3512	NC_017057	TTC	2	6	179980	179985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383500236
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3514	NC_017057	ATA	2	6	180050	180055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500236
3515	NC_017057	TTC	2	6	180079	180084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383500236
3516	NC_017057	TG	3	6	180132	180137	0 %	50 %	50 %	0 %	383500236
3517	NC_017057	T	8	8	180151	180158	0 %	100 %	0 %	0 %	383500236
3518	NC_017057	CTA	2	6	180183	180188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500236
3519	NC_017057	TAT	2	6	180192	180197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500236
3520	NC_017057	TAT	2	6	180219	180224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500236
3521	NC_017057	TA	3	6	180234	180239	50 %	50 %	0 %	0 %	383500236
3522	NC_017057	AT	3	6	180281	180286	50 %	50 %	0 %	0 %	383500236
3523	NC_017057	TGC	2	6	180313	180318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383500236
3524	NC_017057	TGC	2	6	180349	180354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383500236
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3528	NC_017057	ATA	2	6	180422	180427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500236
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3533	NC_017057	T	7	7	180520	180526	0 %	100 %	0 %	0 %	383500236
3534	NC_017057	TAA	2	6	180538	180543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500236
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3537	NC_017057	A	7	7	180825	180831	100 %	0 %	0 %	0 %	383500237
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3539	NC_017057	TAT	2	6	180920	180925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500237
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3541	NC_017057	CTA	2	6	180953	180958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500237
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3543	NC_017057	CATT	2	8	181162	181169	25 %	50 %	0 %	25 %	383500237
3544	NC_017057	TGC	2	6	181170	181175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383500237
3545	NC_017057	TAT	2	6	181212	181217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500237
3546	NC_017057	CAT	2	6	181223	181228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500237
3547	NC_017057	TA	3	6	181251	181256	50 %	50 %	0 %	0 %	383500237
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3552	NC_017057	ATT	2	6	181438	181443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500237
3553	NC_017057	ATG	2	6	181501	181506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500237
3554	NC_017057	TA	3	6	181629	181634	50 %	50 %	0 %	0 %	383500237
3555	NC_017057	T	7	7	181653	181659	0 %	100 %	0 %	0 %	383500237
3556	NC_017057	GCT	2	6	181669	181674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383500237
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3558	NC_017057	AAT	2	6	181925	181930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500237
3559	NC_017057	ATTT	3	12	181952	181963	25 %	75 %	0 %	0 %	383500237
3560	NC_017057	TTTA	2	8	182010	182017	25 %	75 %	0 %	0 %	383500237
3561	NC_017057	TGC	2	6	182040	182045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383500237
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3564	NC_017057	AT	3	6	182182	182187	50 %	50 %	0 %	0 %	383500237
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3571	NC_017057	TGC	2	6	182600	182605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383500238
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3591	NC_017057	ACC	2	6	183359	183364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383500238
3592	NC_017057	TAT	2	6	183391	183396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500238
3593	NC_017057	CAT	2	6	183397	183402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500238
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3606	NC_017057	ATA	2	6	184046	184051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500239
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3614	NC_017057	TCTT	2	8	184933	184940	0 %	75 %	0 %	25 %	383500240
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3619	NC_017057	AGC	2	6	185580	185585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383500241
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3621	NC_017057	T	6	6	185643	185648	0 %	100 %	0 %	0 %	383500241
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3992	NC_017057	TAT	2	6	203199	203204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500257
3993	NC_017057	ATA	2	6	203303	203308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500257
3994	NC_017057	TTA	2	6	203321	203326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500257
3995	NC_017057	TAC	2	6	203334	203339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500257
3996	NC_017057	TTA	2	6	203383	203388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500257
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3999	NC_017057	TAC	2	6	203486	203491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500257
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