MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia rhipicephali str. 3-7-female6-CWPP plasmid pMCC_1

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017055	T	7	7	2923	2929	0 %	100 %	0 %	0 %	381356296
2	NC_017055	T	6	6	3447	3452	0 %	100 %	0 %	0 %	381356296
3	NC_017055	T	6	6	3701	3706	0 %	100 %	0 %	0 %	381356296
4	NC_017055	T	6	6	3947	3952	0 %	100 %	0 %	0 %	381356296
5	NC_017055	T	6	6	4468	4473	0 %	100 %	0 %	0 %	381356296
6	NC_017055	A	7	7	4940	4946	100 %	0 %	0 %	0 %	381356296
7	NC_017055	T	6	6	5002	5007	0 %	100 %	0 %	0 %	381356296
8	NC_017055	A	6	6	5016	5021	100 %	0 %	0 %	0 %	381356296
9	NC_017055	A	6	6	6639	6644	100 %	0 %	0 %	0 %	381356298
10	NC_017055	T	8	8	7686	7693	0 %	100 %	0 %	0 %	381356299
11	NC_017055	T	6	6	8040	8045	0 %	100 %	0 %	0 %	381356299
12	NC_017055	T	6	6	8079	8084	0 %	100 %	0 %	0 %	381356299
13	NC_017055	T	6	6	11760	11765	0 %	100 %	0 %	0 %	381356304
14	NC_017055	A	6	6	12410	12415	100 %	0 %	0 %	0 %	381356305
15	NC_017055	A	6	6	12591	12596	100 %	0 %	0 %	0 %	381356305
16	NC_017055	A	7	7	12600	12606	100 %	0 %	0 %	0 %	381356305
17	NC_017055	A	7	7	12710	12716	100 %	0 %	0 %	0 %	381356305
18	NC_017055	T	7	7	13215	13221	0 %	100 %	0 %	0 %	381356306
19	NC_017055	T	6	6	13229	13234	0 %	100 %	0 %	0 %	381356306
20	NC_017055	T	6	6	13511	13516	0 %	100 %	0 %	0 %	381356307
21	NC_017055	T	6	6	13829	13834	0 %	100 %	0 %	0 %	381356307
22	NC_017055	A	6	6	14295	14300	100 %	0 %	0 %	0 %	381356308

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.