MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Dachau chromosome

Total Repeats: 21713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017051	GCT	2	6	149910	149915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383489240
3002	NC_017051	TAG	2	6	150184	150189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489240
3003	NC_017051	CAG	2	6	150241	150246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383489240
3004	NC_017051	AAGAA	2	10	150251	150260	80 %	0 %	20 %	0 %	383489240
3005	NC_017051	TGA	2	6	150338	150343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489240
3006	NC_017051	CCA	2	6	150414	150419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383489240
3007	NC_017051	ATTA	3	12	150433	150444	50 %	50 %	0 %	0 %	383489240
3008	NC_017051	TATT	2	8	150566	150573	25 %	75 %	0 %	0 %	383489241
3009	NC_017051	TAT	2	6	150598	150603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489241
3010	NC_017051	CTT	2	6	150671	150676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489241
3011	NC_017051	TAT	2	6	150772	150777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489241
3012	NC_017051	TGC	2	6	150784	150789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383489241
3013	NC_017051	GCT	2	6	150920	150925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383489241
3014	NC_017051	TAA	2	6	150951	150956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489241
3015	NC_017051	ATT	2	6	151043	151048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489241
3016	NC_017051	ATT	2	6	151110	151115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489241
3017	NC_017051	T	7	7	151114	151120	0 %	100 %	0 %	0 %	383489241
3018	NC_017051	GTT	2	6	151140	151145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383489241
3019	NC_017051	AAT	2	6	151183	151188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489241
3020	NC_017051	A	7	7	151193	151199	100 %	0 %	0 %	0 %	383489241
3021	NC_017051	TTAA	2	8	151206	151213	50 %	50 %	0 %	0 %	383489241
3022	NC_017051	TAA	2	6	151548	151553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489242
3023	NC_017051	AT	3	6	151569	151574	50 %	50 %	0 %	0 %	383489242
3024	NC_017051	AGG	2	6	151623	151628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383489242
3025	NC_017051	A	7	7	151755	151761	100 %	0 %	0 %	0 %	383489242
3026	NC_017051	CGT	2	6	151804	151809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383489243
3027	NC_017051	ATA	2	6	151850	151855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489243
3028	NC_017051	TAT	2	6	151862	151867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489243
3029	NC_017051	AAT	2	6	151879	151884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489243
3030	NC_017051	GAAA	2	8	151898	151905	75 %	0 %	25 %	0 %	383489243
3031	NC_017051	A	7	7	151949	151955	100 %	0 %	0 %	0 %	383489243
3032	NC_017051	TAA	2	6	151983	151988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489243
3033	NC_017051	GGA	2	6	152038	152043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383489243
3034	NC_017051	ATT	2	6	152107	152112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489243
3035	NC_017051	TGC	2	6	152115	152120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383489243
3036	NC_017051	A	6	6	152135	152140	100 %	0 %	0 %	0 %	383489243
3037	NC_017051	TGA	2	6	152141	152146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489243
3038	NC_017051	GTT	2	6	152166	152171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383489243
3039	NC_017051	TAA	2	6	152181	152186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489243
3040	NC_017051	AAG	2	6	152203	152208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489243
3041	NC_017051	AGA	2	6	152211	152216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489243
3042	NC_017051	TAA	2	6	152238	152243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489243
3043	NC_017051	A	7	7	152266	152272	100 %	0 %	0 %	0 %	383489243
3044	NC_017051	ATAA	2	8	152301	152308	75 %	25 %	0 %	0 %	383489244
3045	NC_017051	AACTAC	2	12	152360	152371	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	383489244
3046	NC_017051	TAT	2	6	152385	152390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489244
3047	NC_017051	GGT	2	6	152427	152432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383489244
3048	NC_017051	CTA	2	6	152434	152439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489244
3049	NC_017051	TGGAT	2	10	152440	152449	20 %	40 %	40 %	0 %	383489244
3050	NC_017051	GCT	2	6	152487	152492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383489244
3051	NC_017051	ACT	2	6	152493	152498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489244
3052	NC_017051	TAAT	2	8	152518	152525	50 %	50 %	0 %	0 %	383489244
3053	NC_017051	ATT	2	6	152526	152531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489244
3054	NC_017051	AGGC	2	8	152652	152659	25 %	0 %	50 %	25 %	383489244
3055	NC_017051	TAA	2	6	152693	152698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489244
3056	NC_017051	TTA	2	6	152770	152775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489244
3057	NC_017051	GAA	2	6	152796	152801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489244
3058	NC_017051	GAA	2	6	152880	152885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489244
3059	NC_017051	GTT	2	6	152946	152951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383489244
3060	NC_017051	AGA	2	6	153002	153007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489244
3061	NC_017051	TAA	2	6	153022	153027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489244
3062	NC_017051	AAGT	2	8	153166	153173	50 %	25 %	25 %	0 %	383489244
3063	NC_017051	GAA	2	6	153180	153185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489244
3064	NC_017051	ATGA	2	8	153240	153247	50 %	25 %	25 %	0 %	383489244
3065	NC_017051	AT	3	6	153279	153284	50 %	50 %	0 %	0 %	383489244
3066	NC_017051	TTA	2	6	153313	153318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489244
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3068	NC_017051	A	6	6	153340	153345	100 %	0 %	0 %	0 %	383489244
3069	NC_017051	TTA	2	6	153357	153362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489244
3070	NC_017051	ATGC	2	8	153363	153370	25 %	25 %	25 %	25 %	383489244
3071	NC_017051	TAA	2	6	153371	153376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489244
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3074	NC_017051	TAG	2	6	153412	153417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489244
3075	NC_017051	AGAA	2	8	153485	153492	75 %	0 %	25 %	0 %	383489244
3076	NC_017051	CAG	2	6	153541	153546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383489244
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3091	NC_017051	ATA	2	6	153955	153960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489244
3092	NC_017051	TGAT	2	8	153994	154001	25 %	50 %	25 %	0 %	383489244
3093	NC_017051	ATG	2	6	154033	154038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489244
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3098	NC_017051	AGT	2	6	154238	154243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489244
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3100	NC_017051	T	6	6	154781	154786	0 %	100 %	0 %	0 %	383489245
3101	NC_017051	TAG	4	12	154854	154865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489245
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3104	NC_017051	ACAGA	2	10	154973	154982	60 %	0 %	20 %	20 %	383489246
3105	NC_017051	ATA	2	6	154989	154994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489246
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3107	NC_017051	GTA	2	6	155033	155038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489246
3108	NC_017051	T	7	7	155113	155119	0 %	100 %	0 %	0 %	383489246
3109	NC_017051	AT	3	6	155124	155129	50 %	50 %	0 %	0 %	383489246
3110	NC_017051	A	8	8	155184	155191	100 %	0 %	0 %	0 %	383489246
3111	NC_017051	TAA	2	6	155211	155216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489246
3112	NC_017051	A	6	6	155251	155256	100 %	0 %	0 %	0 %	383489246
3113	NC_017051	AAT	2	6	155336	155341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489246
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3120	NC_017051	TAG	2	6	155875	155880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489247
3121	NC_017051	CTT	2	6	155910	155915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489247
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3249	NC_017051	TAC	2	6	162030	162035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489251
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3492	NC_017051	GTA	2	6	176182	176187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489257
3493	NC_017051	TCA	2	6	176401	176406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489258
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