MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Dachau chromosome

Total Repeats: 21713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_017051	ATTA	2	8	23427	23434	50 %	50 %	0 %	0 %	383489145
503	NC_017051	TAA	2	6	24457	24462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489146
504	NC_017051	GTT	2	6	24666	24671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383489146
505	NC_017051	AGA	2	6	24762	24767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489146
506	NC_017051	TAA	2	6	24953	24958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489146
507	NC_017051	AG	3	6	25286	25291	50 %	0 %	50 %	0 %	383489147
508	NC_017051	TA	3	6	25300	25305	50 %	50 %	0 %	0 %	383489147
509	NC_017051	CAA	2	6	25308	25313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383489147
510	NC_017051	TAA	2	6	25321	25326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489147
511	NC_017051	TAT	2	6	25353	25358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489147
512	NC_017051	T	6	6	25386	25391	0 %	100 %	0 %	0 %	383489147
513	NC_017051	ATC	2	6	25411	25416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489147
514	NC_017051	AT	3	6	25448	25453	50 %	50 %	0 %	0 %	383489147
515	NC_017051	ATT	2	6	25519	25524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489147
516	NC_017051	TAG	2	6	25584	25589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489147
517	NC_017051	AAAT	2	8	25635	25642	75 %	25 %	0 %	0 %	383489147
518	NC_017051	CTT	2	6	25710	25715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489147
519	NC_017051	CATATA	2	12	25758	25769	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383489147
520	NC_017051	ATA	2	6	25825	25830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489147
521	NC_017051	ATT	2	6	25852	25857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489147
522	NC_017051	TGA	2	6	25958	25963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489147
523	NC_017051	TAA	2	6	25995	26000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489147
524	NC_017051	AT	3	6	26006	26011	50 %	50 %	0 %	0 %	383489147
525	NC_017051	CTG	2	6	26052	26057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383489147
526	NC_017051	TAG	2	6	26061	26066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489147
527	NC_017051	T	7	7	26123	26129	0 %	100 %	0 %	0 %	383489147
528	NC_017051	TGA	2	6	26147	26152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489147
529	NC_017051	CTT	2	6	26229	26234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489147
530	NC_017051	CAT	3	9	26353	26361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489147
531	NC_017051	TAT	2	6	26400	26405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489147
532	NC_017051	CTT	2	6	26472	26477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489147
533	NC_017051	TA	3	6	26509	26514	50 %	50 %	0 %	0 %	383489147
534	NC_017051	TCA	2	6	26534	26539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489147
535	NC_017051	T	6	6	26573	26578	0 %	100 %	0 %	0 %	383489147
536	NC_017051	T	7	7	26598	26604	0 %	100 %	0 %	0 %	383489147
537	NC_017051	TGG	2	6	26776	26781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383489147
538	NC_017051	GGA	2	6	26804	26809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383489147
539	NC_017051	TCA	2	6	26819	26824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489147
540	NC_017051	T	8	8	26841	26848	0 %	100 %	0 %	0 %	383489147
541	NC_017051	AT	3	6	26852	26857	50 %	50 %	0 %	0 %	383489147
542	NC_017051	TTAA	2	8	27111	27118	50 %	50 %	0 %	0 %	383489148
543	NC_017051	A	7	7	27194	27200	100 %	0 %	0 %	0 %	383489148
544	NC_017051	TAGT	2	8	27274	27281	25 %	50 %	25 %	0 %	383489148
545	NC_017051	ATTT	2	8	27293	27300	25 %	75 %	0 %	0 %	383489148
546	NC_017051	ATT	2	6	27309	27314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489148
547	NC_017051	TCT	2	6	27370	27375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489148
548	NC_017051	A	6	6	27387	27392	100 %	0 %	0 %	0 %	383489148
549	NC_017051	AGT	2	6	27426	27431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489148
550	NC_017051	CTT	2	6	27441	27446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489148
551	NC_017051	TAA	3	9	27463	27471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489148
552	NC_017051	T	6	6	27502	27507	0 %	100 %	0 %	0 %	383489148
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555	NC_017051	ATT	2	6	27602	27607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489148
556	NC_017051	AAT	2	6	27644	27649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489148
557	NC_017051	ATT	2	6	27659	27664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489148
558	NC_017051	TCT	2	6	27675	27680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489148
559	NC_017051	TC	3	6	27695	27700	0 %	50 %	0 %	50 %	383489148
560	NC_017051	ATTT	2	8	27718	27725	25 %	75 %	0 %	0 %	383489148
561	NC_017051	TGC	2	6	27731	27736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383489148
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563	NC_017051	CTG	2	6	27792	27797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383489148
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565	NC_017051	CCATA	2	10	27830	27839	40 %	20 %	0 %	40 %	383489148
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617	NC_017051	TTTTA	2	10	33612	33621	20 %	80 %	0 %	0 %	383489151
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626	NC_017051	T	6	6	33938	33943	0 %	100 %	0 %	0 %	383489152
627	NC_017051	AT	3	6	33998	34003	50 %	50 %	0 %	0 %	383489152
628	NC_017051	AT	3	6	34022	34027	50 %	50 %	0 %	0 %	383489152
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