MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Dachau chromosome

Total Repeats: 21713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017051	GTA	2	6	250609	250614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489316
5002	NC_017051	AT	3	6	250720	250725	50 %	50 %	0 %	0 %	383489316
5003	NC_017051	AGA	2	6	250833	250838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489316
5004	NC_017051	TTA	2	6	250845	250850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489316
5005	NC_017051	TGA	2	6	250895	250900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489316
5006	NC_017051	AGA	2	6	250934	250939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489316
5007	NC_017051	TAT	2	6	251003	251008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489316
5008	NC_017051	A	6	6	251140	251145	100 %	0 %	0 %	0 %	383489316
5009	NC_017051	GAG	2	6	251166	251171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383489316
5010	NC_017051	GAA	2	6	251181	251186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489316
5011	NC_017051	AGA	2	6	251234	251239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489316
5012	NC_017051	AAG	2	6	251276	251281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489316
5013	NC_017051	GTG	2	6	251311	251316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383489316
5014	NC_017051	TAA	2	6	251326	251331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489316
5015	NC_017051	GAT	2	6	251388	251393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489316
5016	NC_017051	GTG	2	6	251473	251478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383489316
5017	NC_017051	GAT	3	9	251496	251504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489316
5018	NC_017051	AGT	2	6	251510	251515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489316
5019	NC_017051	GAA	2	6	251550	251555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489316
5020	NC_017051	ATG	2	6	251587	251592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489316
5021	NC_017051	TAG	2	6	251601	251606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489316
5022	NC_017051	ATG	2	6	253211	253216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489317
5023	NC_017051	TTA	2	6	253220	253225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489317
5024	NC_017051	TTA	2	6	253254	253259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489317
5025	NC_017051	AGG	2	6	253282	253287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383489317
5026	NC_017051	T	6	6	253334	253339	0 %	100 %	0 %	0 %	383489317
5027	NC_017051	ATTT	2	8	253364	253371	25 %	75 %	0 %	0 %	383489317
5028	NC_017051	T	6	6	253384	253389	0 %	100 %	0 %	0 %	383489317
5029	NC_017051	TATG	2	8	253907	253914	25 %	50 %	25 %	0 %	383489318
5030	NC_017051	TGA	2	6	253941	253946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489318
5031	NC_017051	ATA	2	6	254164	254169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489318
5032	NC_017051	AGATA	2	10	254258	254267	60 %	20 %	20 %	0 %	383489318
5033	NC_017051	ATT	2	6	254369	254374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489318
5034	NC_017051	GTA	2	6	254395	254400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489318
5035	NC_017051	ATA	2	6	254426	254431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489318
5036	NC_017051	A	6	6	254484	254489	100 %	0 %	0 %	0 %	383489319
5037	NC_017051	TCA	2	6	254498	254503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489319
5038	NC_017051	ATG	2	6	254632	254637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489319
5039	NC_017051	A	6	6	254727	254732	100 %	0 %	0 %	0 %	383489319
5040	NC_017051	ATCC	3	12	254748	254759	25 %	25 %	0 %	50 %	383489319
5041	NC_017051	GAG	2	6	254776	254781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383489319
5042	NC_017051	CTC	2	6	254785	254790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383489319
5043	NC_017051	TAT	2	6	254801	254806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489319
5044	NC_017051	AGT	2	6	254823	254828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489319
5045	NC_017051	GTAT	2	8	254829	254836	25 %	50 %	25 %	0 %	383489319
5046	NC_017051	AT	3	6	254869	254874	50 %	50 %	0 %	0 %	383489319
5047	NC_017051	AGA	2	6	254882	254887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489319
5048	NC_017051	AGAA	2	8	254897	254904	75 %	0 %	25 %	0 %	383489319
5049	NC_017051	ATA	2	6	254983	254988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489319
5050	NC_017051	AATT	2	8	255056	255063	50 %	50 %	0 %	0 %	383489319
5051	NC_017051	ATTG	2	8	255084	255091	25 %	50 %	25 %	0 %	383489319
5052	NC_017051	AAT	2	6	255146	255151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489319
5053	NC_017051	ATC	2	6	255184	255189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489319
5054	NC_017051	TTA	2	6	255208	255213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489319
5055	NC_017051	AG	3	6	255272	255277	50 %	0 %	50 %	0 %	383489319
5056	NC_017051	A	6	6	255279	255284	100 %	0 %	0 %	0 %	383489319
5057	NC_017051	AGA	2	6	255296	255301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489319
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5059	NC_017051	TAAT	2	8	259404	259411	50 %	50 %	0 %	0 %	383489320
5060	NC_017051	ATT	2	6	259423	259428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489320
5061	NC_017051	TAA	2	6	259429	259434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489320
5062	NC_017051	TTCAT	2	10	259448	259457	20 %	60 %	0 %	20 %	383489320
5063	NC_017051	TATTT	2	10	259510	259519	20 %	80 %	0 %	0 %	383489320
5064	NC_017051	CTA	2	6	259527	259532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489320
5065	NC_017051	ATAA	2	8	259538	259545	75 %	25 %	0 %	0 %	383489320
5066	NC_017051	AAC	2	6	259591	259596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383489320
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5070	NC_017051	TA	3	6	259678	259683	50 %	50 %	0 %	0 %	383489320
5071	NC_017051	AAT	2	6	259700	259705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489320
5072	NC_017051	TA	3	6	259734	259739	50 %	50 %	0 %	0 %	383489320
5073	NC_017051	ATT	2	6	259792	259797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489320
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5075	NC_017051	TTTATT	2	12	259828	259839	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383489320
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5083	NC_017051	TTA	2	6	260070	260075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489320
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5087	NC_017051	TAAA	2	8	260314	260321	75 %	25 %	0 %	0 %	383489320
5088	NC_017051	T	6	6	260327	260332	0 %	100 %	0 %	0 %	383489320
5089	NC_017051	ATG	2	6	260335	260340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489320
5090	NC_017051	TAAA	2	8	260355	260362	75 %	25 %	0 %	0 %	383489320
5091	NC_017051	CTT	2	6	260379	260384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489320
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5093	NC_017051	GTTT	2	8	260417	260424	0 %	75 %	25 %	0 %	383489320
5094	NC_017051	ATGA	2	8	260435	260442	50 %	25 %	25 %	0 %	383489320
5095	NC_017051	ATC	2	6	260456	260461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489320
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5097	NC_017051	T	6	6	261093	261098	0 %	100 %	0 %	0 %	383489321
5098	NC_017051	TA	3	6	261114	261119	50 %	50 %	0 %	0 %	383489321
5099	NC_017051	GCAT	2	8	261122	261129	25 %	25 %	25 %	25 %	383489321
5100	NC_017051	AATA	2	8	261160	261167	75 %	25 %	0 %	0 %	383489321
5101	NC_017051	GAAAAT	2	12	261180	261191	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383489321
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5105	NC_017051	CTTC	2	8	261335	261342	0 %	50 %	0 %	50 %	383489321
5106	NC_017051	TTGTT	2	10	261343	261352	0 %	80 %	20 %	0 %	383489321
5107	NC_017051	GTA	2	6	261377	261382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489321
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5109	NC_017051	TGC	2	6	261544	261549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383489321
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5111	NC_017051	CTAT	2	8	261605	261612	25 %	50 %	0 %	25 %	383489321
5112	NC_017051	TAT	2	6	261648	261653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489321
5113	NC_017051	TG	3	6	261675	261680	0 %	50 %	50 %	0 %	383489321
5114	NC_017051	TTGAT	2	10	261684	261693	20 %	60 %	20 %	0 %	383489321
5115	NC_017051	GT	3	6	261699	261704	0 %	50 %	50 %	0 %	383489321
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5118	NC_017051	TCA	2	6	261899	261904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489321
5119	NC_017051	ATTTA	2	10	261910	261919	40 %	60 %	0 %	0 %	383489321
5120	NC_017051	CAA	2	6	261944	261949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383489321
5121	NC_017051	T	6	6	261961	261966	0 %	100 %	0 %	0 %	383489321
5122	NC_017051	TAA	2	6	262011	262016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489321
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5124	NC_017051	TAA	2	6	262036	262041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489321
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5497	NC_017051	TTA	2	6	282294	282299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489334
5498	NC_017051	A	7	7	282332	282338	100 %	0 %	0 %	0 %	383489334
5499	NC_017051	ATT	2	6	282411	282416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489334
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