MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Katsinyian chromosome

Total Repeats: 22095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_017050	CGTG	2	8	75759	75766	0 %	25 %	50 %	25 %	383488342
1503	NC_017050	TTA	2	6	75793	75798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488342
1504	NC_017050	TGGT	2	8	75857	75864	0 %	50 %	50 %	0 %	383488342
1505	NC_017050	ACC	2	6	75881	75886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383488342
1506	NC_017050	TGAT	2	8	75956	75963	25 %	50 %	25 %	0 %	383488342
1507	NC_017050	GCA	2	6	76000	76005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383488342
1508	NC_017050	TTA	2	6	76048	76053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488342
1509	NC_017050	GGA	2	6	76056	76061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383488342
1510	NC_017050	ATG	2	6	76097	76102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488342
1511	NC_017050	TAA	2	6	76121	76126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488342
1512	NC_017050	TGCT	2	8	76148	76155	0 %	50 %	25 %	25 %	383488342
1513	NC_017050	CAA	2	6	76187	76192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383488342
1514	NC_017050	ACC	2	6	76197	76202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383488342
1515	NC_017050	TGG	2	6	76308	76313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383488342
1516	NC_017050	ATT	2	6	76318	76323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488342
1517	NC_017050	TTA	2	6	76337	76342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488342
1518	NC_017050	TGC	2	6	76344	76349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383488342
1519	NC_017050	TAC	2	6	76353	76358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383488342
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1521	NC_017050	A	7	7	76501	76507	100 %	0 %	0 %	0 %	383488342
1522	NC_017050	TTA	2	6	76514	76519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488342
1523	NC_017050	GGT	2	6	76554	76559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383488342
1524	NC_017050	GTA	2	6	76664	76669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488342
1525	NC_017050	A	6	6	76728	76733	100 %	0 %	0 %	0 %	383488342
1526	NC_017050	TAT	2	6	76734	76739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488342
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1528	NC_017050	TTTA	2	8	76811	76818	25 %	75 %	0 %	0 %	383488342
1529	NC_017050	TGA	2	6	76824	76829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488342
1530	NC_017050	ATT	2	6	76840	76845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488342
1531	NC_017050	ATA	2	6	76870	76875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488342
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1533	NC_017050	ATT	2	6	76963	76968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488342
1534	NC_017050	ACA	2	6	76992	76997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383488342
1535	NC_017050	A	6	6	77019	77024	100 %	0 %	0 %	0 %	383488342
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1537	NC_017050	ATA	2	6	77095	77100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488342
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1540	NC_017050	CTATTA	2	12	77180	77191	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383488342
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1542	NC_017050	ATA	2	6	77231	77236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488342
1543	NC_017050	AAG	2	6	77261	77266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383488342
1544	NC_017050	TAT	2	6	77283	77288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488342
1545	NC_017050	TAA	2	6	77315	77320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488342
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1547	NC_017050	ATA	2	6	77357	77362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488342
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1550	NC_017050	ACT	2	6	77400	77405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383488342
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1552	NC_017050	TTA	2	6	77464	77469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488342
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1554	NC_017050	CAAA	2	8	77524	77531	75 %	0 %	0 %	25 %	383488342
1555	NC_017050	TGAAA	2	10	77661	77670	60 %	20 %	20 %	0 %	383488342
1556	NC_017050	A	6	6	77668	77673	100 %	0 %	0 %	0 %	383488342
1557	NC_017050	GTA	2	6	77683	77688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488342
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1559	NC_017050	ATG	2	6	77759	77764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488342
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1562	NC_017050	ATA	2	6	77855	77860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488342
1563	NC_017050	ATA	2	6	77871	77876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488342
1564	NC_017050	TTG	2	6	78257	78262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383488343
1565	NC_017050	ATA	2	6	78282	78287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488343
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1567	NC_017050	TAA	2	6	78463	78468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488343
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1569	NC_017050	AAG	2	6	78530	78535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383488343
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1589	NC_017050	AGAA	2	8	79455	79462	75 %	0 %	25 %	0 %	383488343
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1593	NC_017050	TAT	2	6	79810	79815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488344
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1601	NC_017050	TAT	2	6	80050	80055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488344
1602	NC_017050	TAC	2	6	80224	80229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383488344
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1606	NC_017050	AT	3	6	80627	80632	50 %	50 %	0 %	0 %	383488345
1607	NC_017050	TCT	2	6	80667	80672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383488345
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1610	NC_017050	ATTTA	2	10	80834	80843	40 %	60 %	0 %	0 %	383488345
1611	NC_017050	AAC	2	6	80860	80865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383488345
1612	NC_017050	TAT	2	6	80875	80880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488345
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1625	NC_017050	TGA	2	6	81768	81773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488346
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