MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Chernikova chromosome

Total Repeats: 22170

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_017049	ATT	2	6	280929	280934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487645
5503	NC_017049	TAC	2	6	280943	280948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487645
5504	NC_017049	T	7	7	280982	280988	0 %	100 %	0 %	0 %	383487645
5505	NC_017049	T	6	6	281004	281009	0 %	100 %	0 %	0 %	383487645
5506	NC_017049	A	7	7	281017	281023	100 %	0 %	0 %	0 %	383487645
5507	NC_017049	AT	3	6	281029	281034	50 %	50 %	0 %	0 %	383487645
5508	NC_017049	AGAT	2	8	281086	281093	50 %	25 %	25 %	0 %	383487645
5509	NC_017049	AG	3	6	281097	281102	50 %	0 %	50 %	0 %	383487645
5510	NC_017049	AATGAA	2	12	281106	281117	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383487645
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5512	NC_017049	ACA	2	6	281252	281257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383487645
5513	NC_017049	CAA	2	6	281320	281325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383487645
5514	NC_017049	GTA	2	6	281451	281456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487645
5515	NC_017049	GCA	2	6	281462	281467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383487645
5516	NC_017049	AT	3	6	281478	281483	50 %	50 %	0 %	0 %	383487645
5517	NC_017049	CTA	2	6	281488	281493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487645
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5519	NC_017049	A	7	7	281554	281560	100 %	0 %	0 %	0 %	383487645
5520	NC_017049	ACT	2	6	281586	281591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487645
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5524	NC_017049	AG	3	6	281843	281848	50 %	0 %	50 %	0 %	383487645
5525	NC_017049	A	7	7	281852	281858	100 %	0 %	0 %	0 %	383487645
5526	NC_017049	AAAT	2	8	281903	281910	75 %	25 %	0 %	0 %	383487645
5527	NC_017049	CTTTAG	2	12	281923	281934	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383487645
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5541	NC_017049	A	6	6	282211	282216	100 %	0 %	0 %	0 %	383487645
5542	NC_017049	AG	3	6	282227	282232	50 %	0 %	50 %	0 %	383487645
5543	NC_017049	TTA	2	6	282235	282240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487645
5544	NC_017049	ATG	3	9	282244	282252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487645
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5546	NC_017049	TTA	2	6	282290	282295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487645
5547	NC_017049	A	7	7	282328	282334	100 %	0 %	0 %	0 %	383487645
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5551	NC_017049	A	6	6	282488	282493	100 %	0 %	0 %	0 %	383487645
5552	NC_017049	TGA	2	6	282494	282499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487645
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5554	NC_017049	AAAGA	2	10	282803	282812	80 %	0 %	20 %	0 %	383487646
5555	NC_017049	CAT	2	6	282929	282934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487646
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5564	NC_017049	TTAT	2	8	283411	283418	25 %	75 %	0 %	0 %	383487646
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5615	NC_017049	ATCAA	2	10	284953	284962	60 %	20 %	0 %	20 %	383487647
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