MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Chernikova chromosome

Total Repeats: 22170

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017049	ATTGCA	2	12	247402	247413	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383487626
5002	NC_017049	A	6	6	247425	247430	100 %	0 %	0 %	0 %	383487626
5003	NC_017049	AT	3	6	247438	247443	50 %	50 %	0 %	0 %	383487626
5004	NC_017049	TGA	2	6	247449	247454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487626
5005	NC_017049	CAAG	2	8	247495	247502	50 %	0 %	25 %	25 %	383487626
5006	NC_017049	TAC	2	6	247527	247532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487626
5007	NC_017049	ATC	2	6	247537	247542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487626
5008	NC_017049	TTG	2	6	247562	247567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383487626
5009	NC_017049	TA	3	6	247600	247605	50 %	50 %	0 %	0 %	383487626
5010	NC_017049	A	6	6	247635	247640	100 %	0 %	0 %	0 %	383487626
5011	NC_017049	CAG	2	6	247672	247677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383487626
5012	NC_017049	ATA	2	6	247714	247719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487626
5013	NC_017049	TGAT	2	8	248883	248890	25 %	50 %	25 %	0 %	383487627
5014	NC_017049	TTC	2	6	248896	248901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383487627
5015	NC_017049	AGATG	2	10	248926	248935	40 %	20 %	40 %	0 %	383487627
5016	NC_017049	TATCT	2	10	248940	248949	20 %	60 %	0 %	20 %	383487627
5017	NC_017049	ATC	2	6	249114	249119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487627
5018	NC_017049	ATGG	2	8	249218	249225	25 %	25 %	50 %	0 %	383487627
5019	NC_017049	AGA	2	6	249289	249294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487627
5020	NC_017049	ATTA	2	8	249323	249330	50 %	50 %	0 %	0 %	383487627
5021	NC_017049	GAA	2	6	249341	249346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487627
5022	NC_017049	CTGC	2	8	249359	249366	0 %	25 %	25 %	50 %	383487627
5023	NC_017049	ATT	2	6	249452	249457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487627
5024	NC_017049	TA	4	8	249471	249478	50 %	50 %	0 %	0 %	383487627
5025	NC_017049	GTA	2	6	249597	249602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487627
5026	NC_017049	GTC	2	6	249645	249650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383487627
5027	NC_017049	ATT	3	9	249656	249664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487627
5028	NC_017049	TAAA	2	8	249684	249691	75 %	25 %	0 %	0 %	383487627
5029	NC_017049	TTG	2	6	249699	249704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383487627
5030	NC_017049	A	6	6	249705	249710	100 %	0 %	0 %	0 %	383487627
5031	NC_017049	AAAG	2	8	249802	249809	75 %	0 %	25 %	0 %	383487627
5032	NC_017049	AGT	2	6	249823	249828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487627
5033	NC_017049	TGCT	2	8	249882	249889	0 %	50 %	25 %	25 %	383487627
5034	NC_017049	TGA	2	6	249912	249917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487627
5035	NC_017049	AAG	2	6	249924	249929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487627
5036	NC_017049	TA	3	6	249979	249984	50 %	50 %	0 %	0 %	383487627
5037	NC_017049	TAAA	2	8	249990	249997	75 %	25 %	0 %	0 %	383487627
5038	NC_017049	ATA	2	6	250058	250063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487627
5039	NC_017049	TA	3	6	250062	250067	50 %	50 %	0 %	0 %	383487627
5040	NC_017049	TTA	2	6	250068	250073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487627
5041	NC_017049	AGTT	2	8	250155	250162	25 %	50 %	25 %	0 %	383487627
5042	NC_017049	GAT	2	6	250163	250168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487627
5043	NC_017049	GAAA	2	8	250264	250271	75 %	0 %	25 %	0 %	383487627
5044	NC_017049	AGA	2	6	250363	250368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487627
5045	NC_017049	TTAAAG	2	12	250374	250385	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383487627
5046	NC_017049	AGA	2	6	250444	250449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487627
5047	NC_017049	GAA	2	6	250463	250468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487627
5048	NC_017049	CGTAAC	2	12	250474	250485	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383487627
5049	NC_017049	TGG	2	6	250489	250494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383487627
5050	NC_017049	GTA	2	6	250605	250610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487627
5051	NC_017049	AT	3	6	250716	250721	50 %	50 %	0 %	0 %	383487627
5052	NC_017049	AGA	2	6	250829	250834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487627
5053	NC_017049	TTA	2	6	250841	250846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487627
5054	NC_017049	TGA	2	6	250891	250896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487627
5055	NC_017049	AGA	2	6	250930	250935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487627
5056	NC_017049	TAT	2	6	250999	251004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487627
5057	NC_017049	A	6	6	251136	251141	100 %	0 %	0 %	0 %	383487627
5058	NC_017049	GAG	2	6	251162	251167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383487627
5059	NC_017049	GAA	2	6	251177	251182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487627
5060	NC_017049	AGA	2	6	251230	251235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487627
5061	NC_017049	AAG	2	6	251272	251277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487627
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5065	NC_017049	GTG	2	6	251469	251474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383487627
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5095	NC_017049	AT	3	6	254865	254870	50 %	50 %	0 %	0 %	383487630
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5104	NC_017049	AG	3	6	255268	255273	50 %	0 %	50 %	0 %	383487630
5105	NC_017049	A	6	6	255275	255280	100 %	0 %	0 %	0 %	383487630
5106	NC_017049	AGA	2	6	255292	255297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487630
5107	NC_017049	TA	3	6	259384	259389	50 %	50 %	0 %	0 %	383487631
5108	NC_017049	TAAT	2	8	259400	259407	50 %	50 %	0 %	0 %	383487631
5109	NC_017049	ATT	2	6	259419	259424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487631
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5111	NC_017049	TTCAT	2	10	259444	259453	20 %	60 %	0 %	20 %	383487631
5112	NC_017049	TATTT	2	10	259506	259515	20 %	80 %	0 %	0 %	383487631
5113	NC_017049	CTA	2	6	259523	259528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487631
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5119	NC_017049	TA	3	6	259674	259679	50 %	50 %	0 %	0 %	383487631
5120	NC_017049	AAT	2	6	259696	259701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487631
5121	NC_017049	TA	3	6	259730	259735	50 %	50 %	0 %	0 %	383487631
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