MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. GvV257 chromosome

Total Repeats: 13420

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017048	ATA	2	6	1447	1452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486604
2	NC_017048	ATA	2	6	1494	1499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486604
3	NC_017048	ACC	2	6	1555	1560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383486604
4	NC_017048	ACC	2	6	5369	5374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383486605
5	NC_017048	ATT	2	6	5424	5429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486605
6	NC_017048	TCT	2	6	5439	5444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383486605
7	NC_017048	CTA	2	6	5479	5484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486605
8	NC_017048	TAC	2	6	5521	5526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486605
9	NC_017048	GTT	2	6	5529	5534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383486605
10	NC_017048	ATC	2	6	5612	5617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486605
11	NC_017048	ATC	2	6	5694	5699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486605
12	NC_017048	AAT	2	6	5798	5803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486605
13	NC_017048	AAT	2	6	5909	5914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486605
14	NC_017048	GCT	2	6	6085	6090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383486605
15	NC_017048	GCT	2	6	6100	6105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383486605
16	NC_017048	TAA	2	6	6287	6292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486605
17	NC_017048	TAT	2	6	6331	6336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486605
18	NC_017048	TAT	2	6	6355	6360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486605
19	NC_017048	GCT	2	6	6369	6374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383486605
20	NC_017048	TAT	2	6	6406	6411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486605
21	NC_017048	CTA	2	6	6412	6417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486605
22	NC_017048	TAA	2	6	6428	6433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486605
23	NC_017048	CAT	2	6	6439	6444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486605
24	NC_017048	CTA	2	6	6583	6588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486605
25	NC_017048	TCA	2	6	6621	6626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486605
26	NC_017048	CTA	2	6	6775	6780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486605
27	NC_017048	TCT	2	6	6808	6813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383486605
28	NC_017048	AGC	2	6	6884	6889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383486605
29	NC_017048	TAA	2	6	7010	7015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486605
30	NC_017048	AGT	2	6	7067	7072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383486605
31	NC_017048	ATA	2	6	7083	7088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486605
32	NC_017048	GCT	2	6	7089	7094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383486605
33	NC_017048	CTA	2	6	7119	7124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486605
34	NC_017048	TTC	2	6	7437	7442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383486606
35	NC_017048	TGC	2	6	7444	7449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383486606
36	NC_017048	ATA	2	6	7489	7494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486606
37	NC_017048	GAA	2	6	7702	7707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383486607
38	NC_017048	ATT	2	6	7749	7754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486607
39	NC_017048	AAT	3	9	7771	7779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486607
40	NC_017048	GAA	2	6	7786	7791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383486607
41	NC_017048	AGA	2	6	7794	7799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383486607
42	NC_017048	TAA	2	6	7829	7834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486607
43	NC_017048	ATA	2	6	7858	7863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486607
44	NC_017048	AAT	2	6	7890	7895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486607
45	NC_017048	AGA	2	6	7917	7922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383486607
46	NC_017048	TAT	2	6	7986	7991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486607
47	NC_017048	CTT	2	6	8006	8011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383486607
48	NC_017048	ATT	2	6	8105	8110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486607
49	NC_017048	AAT	2	6	8280	8285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486607
50	NC_017048	AAT	2	6	8898	8903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486608
51	NC_017048	GCT	2	6	8950	8955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383486608
52	NC_017048	ATA	3	9	8987	8995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486608
53	NC_017048	ACC	2	6	9054	9059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383486608
54	NC_017048	TTA	2	6	9104	9109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486608
55	NC_017048	CGT	2	6	9157	9162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383486608
56	NC_017048	CTG	2	6	9188	9193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383486608
57	NC_017048	AAT	2	6	9265	9270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486608
58	NC_017048	TTA	2	6	9427	9432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486608
59	NC_017048	AAG	2	6	9608	9613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383486608
60	NC_017048	GAC	3	9	9648	9656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383486608
61	NC_017048	TCG	2	6	9716	9721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383486608
62	NC_017048	TCA	2	6	9754	9759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486608
63	NC_017048	ATC	2	6	9872	9877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486608
64	NC_017048	TGT	2	6	9909	9914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383486608
65	NC_017048	ATA	2	6	10016	10021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486608
66	NC_017048	ATA	3	9	10087	10095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486608
67	NC_017048	CAT	2	6	10196	10201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486608
68	NC_017048	GAT	2	6	10375	10380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383486608
69	NC_017048	AGA	2	6	10416	10421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383486608
70	NC_017048	GAT	2	6	10498	10503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383486608
71	NC_017048	GAT	2	6	10534	10539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383486608
72	NC_017048	CTG	2	6	10631	10636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383486608
73	NC_017048	CCA	2	6	10717	10722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383486608
74	NC_017048	TGT	2	6	10866	10871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383486608
75	NC_017048	GAA	2	6	11077	11082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383486608
76	NC_017048	ATA	2	6	11309	11314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486608
77	NC_017048	ACA	2	6	11393	11398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383486608
78	NC_017048	TAT	2	6	11556	11561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486608
79	NC_017048	ATA	3	9	11570	11578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486608
80	NC_017048	TGA	2	6	11640	11645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383486608
81	NC_017048	TGC	2	6	11733	11738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383486608
82	NC_017048	CTA	2	6	11759	11764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486608
83	NC_017048	ATA	2	6	11861	11866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486608
84	NC_017048	AGA	2	6	11913	11918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383486608
85	NC_017048	AAG	2	6	11963	11968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383486608
86	NC_017048	ATA	2	6	12004	12009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486608
87	NC_017048	TTA	2	6	12053	12058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486608
88	NC_017048	TAA	2	6	12849	12854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486609
89	NC_017048	ACA	2	6	12868	12873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383486609
90	NC_017048	CTT	2	6	12992	12997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383486609
91	NC_017048	GCA	2	6	13009	13014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383486609
92	NC_017048	TCT	2	6	13051	13056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383486609
93	NC_017048	ACT	2	6	13060	13065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486609
94	NC_017048	ATA	2	6	13142	13147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486609
95	NC_017048	TCT	2	6	13184	13189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383486609
96	NC_017048	TAC	2	6	13235	13240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486609
97	NC_017048	ATC	2	6	13317	13322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486609
98	NC_017048	TAC	2	6	13329	13334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486609
99	NC_017048	ATT	2	6	13362	13367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486609
100	NC_017048	TTC	2	6	13488	13493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383486609
101	NC_017048	CAC	2	6	13691	13696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383486609
102	NC_017048	CTG	2	6	13871	13876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383486609
103	NC_017048	TTC	2	6	13890	13895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383486609
104	NC_017048	AAT	2	6	14015	14020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486609
105	NC_017048	TAA	2	6	14081	14086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486609
106	NC_017048	CTT	2	6	14099	14104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383486609
107	NC_017048	ATC	2	6	14238	14243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486609
108	NC_017048	AGC	2	6	14256	14261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383486609
109	NC_017048	ATT	2	6	14304	14309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486609
110	NC_017048	CAC	2	6	14310	14315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383486609
111	NC_017048	CCA	3	9	14329	14337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383486609
112	NC_017048	ACT	2	6	14521	14526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486609
113	NC_017048	AAT	2	6	14818	14823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486609
114	NC_017048	TTC	2	6	14949	14954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383486610
115	NC_017048	ATC	2	6	15035	15040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486610
116	NC_017048	TGC	2	6	15056	15061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383486610
117	NC_017048	ACT	2	6	15078	15083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486610
118	NC_017048	TTC	2	6	15131	15136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383486610
119	NC_017048	TCA	2	6	15232	15237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486610
120	NC_017048	TAA	2	6	15331	15336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486610
121	NC_017048	GCT	2	6	15435	15440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383486610
122	NC_017048	ATA	3	9	15534	15542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486610
123	NC_017048	TCA	2	6	15582	15587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486610
124	NC_017048	CAA	2	6	15598	15603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383486610
125	NC_017048	TTA	2	6	15624	15629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486610
126	NC_017048	CAG	2	6	15673	15678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383486610
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128	NC_017048	TAG	2	6	15802	15807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383486610
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