MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 chromosome

Total Repeats: 86515

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017047	GCT	2	6	219275	219280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256093
4002	NC_017047	CGC	2	6	219285	219290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384256093
4003	NC_017047	AAG	2	6	219313	219318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384256093
4004	NC_017047	GC	3	6	219333	219338	0 %	0 %	50 %	50 %	384256093
4005	NC_017047	GGT	2	6	219359	219364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256093
4006	NC_017047	CCA	2	6	219409	219414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384256093
4007	NC_017047	CAT	2	6	219437	219442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384256093
4008	NC_017047	GC	3	6	219541	219546	0 %	0 %	50 %	50 %	384256093
4009	NC_017047	CAT	2	6	219560	219565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384256093
4010	NC_017047	CA	3	6	219631	219636	50 %	0 %	0 %	50 %	384256093
4011	NC_017047	GGC	2	6	219675	219680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256093
4012	NC_017047	GCA	2	6	219718	219723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256093
4013	NC_017047	GTG	2	6	219759	219764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256093
4014	NC_017047	CTT	2	6	219770	219775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384256093
4015	NC_017047	TTC	2	6	219828	219833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384256093
4016	NC_017047	GGT	2	6	219908	219913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256093
4017	NC_017047	ACGT	2	8	220052	220059	25 %	25 %	25 %	25 %	384256093
4018	NC_017047	CGG	2	6	220096	220101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256093
4019	NC_017047	TGCCG	2	10	220106	220115	0 %	20 %	40 %	40 %	384256093
4020	NC_017047	TGG	2	6	220208	220213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256094
4021	NC_017047	GCT	2	6	220378	220383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256094
4022	NC_017047	GTG	2	6	220449	220454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256094
4023	NC_017047	CGA	2	6	220495	220500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256094
4024	NC_017047	CGG	2	6	220573	220578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256094
4025	NC_017047	CGT	2	6	220594	220599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256094
4026	NC_017047	GGT	2	6	220681	220686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256094
4027	NC_017047	GTG	2	6	220730	220735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256094
4028	NC_017047	ATT	2	6	220835	220840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384256094
4029	NC_017047	TGG	2	6	220968	220973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256094
4030	NC_017047	CAG	2	6	221009	221014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256094
4031	NC_017047	CTG	2	6	221027	221032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256094
4032	NC_017047	GTG	2	6	221042	221047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256094
4033	NC_017047	TTC	2	6	221138	221143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384256094
4034	NC_017047	TGA	3	9	221323	221331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384256094
4035	NC_017047	ATTG	2	8	221426	221433	25 %	50 %	25 %	0 %	384256094
4036	NC_017047	GAA	2	6	221509	221514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384256094
4037	NC_017047	GCG	2	6	221517	221522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256094
4038	NC_017047	CGG	2	6	221532	221537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256094
4039	NC_017047	ACG	2	6	221590	221595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256095
4040	NC_017047	AGA	2	6	221663	221668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384256095
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4042	NC_017047	ATCA	2	8	221787	221794	50 %	25 %	0 %	25 %	384256095
4043	NC_017047	CTG	3	9	221850	221858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256095
4044	NC_017047	TGCGA	2	10	221919	221928	20 %	20 %	40 %	20 %	384256095
4045	NC_017047	ATTG	2	8	221985	221992	25 %	50 %	25 %	0 %	384256095
4046	NC_017047	GCA	2	6	222013	222018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256095
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4048	NC_017047	CTGC	2	8	222049	222056	0 %	25 %	25 %	50 %	384256095
4049	NC_017047	CCG	2	6	222118	222123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384256095
4050	NC_017047	ATC	2	6	222142	222147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384256095
4051	NC_017047	CTG	2	6	222165	222170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256095
4052	NC_017047	CGG	2	6	222180	222185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256095
4053	NC_017047	GCG	2	6	222196	222201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256095
4054	NC_017047	CTG	2	6	222219	222224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256095
4055	NC_017047	GC	3	6	222308	222313	0 %	0 %	50 %	50 %	384256095
4056	NC_017047	CTG	2	6	222370	222375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256095
4057	NC_017047	CG	3	6	222414	222419	0 %	0 %	50 %	50 %	384256095
4058	NC_017047	GCT	2	6	222425	222430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256095
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4061	NC_017047	A	6	6	222712	222717	100 %	0 %	0 %	0 %	384256096
4062	NC_017047	GCG	2	6	222723	222728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256096
4063	NC_017047	CGA	2	6	222731	222736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256096
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4065	NC_017047	TGC	3	9	222802	222810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256096
4066	NC_017047	ACCA	2	8	222819	222826	50 %	0 %	0 %	50 %	384256096
4067	NC_017047	TGC	2	6	222841	222846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256096
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4069	NC_017047	CG	3	6	222992	222997	0 %	0 %	50 %	50 %	384256096
4070	NC_017047	GAT	2	6	223007	223012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384256096
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4072	NC_017047	GAT	2	6	223040	223045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384256096
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4076	NC_017047	CAA	2	6	223116	223121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384256096
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4093	NC_017047	ATG	2	6	224018	224023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384256097
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4100	NC_017047	CTG	2	6	224536	224541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256098
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4104	NC_017047	GGC	2	6	224931	224936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256098
4105	NC_017047	AC	3	6	224950	224955	50 %	0 %	0 %	50 %	384256098
4106	NC_017047	CGA	2	6	224993	224998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256098
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4108	NC_017047	CTG	2	6	225040	225045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256098
4109	NC_017047	GC	3	6	225082	225087	0 %	0 %	50 %	50 %	384256098
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4121	NC_017047	GCGG	2	8	225583	225590	0 %	0 %	75 %	25 %	384256098
4122	NC_017047	CCA	2	6	225611	225616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384256098
4123	NC_017047	GTT	2	6	225699	225704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384256098
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4125	NC_017047	CAT	2	6	225765	225770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384256098
4126	NC_017047	CTG	2	6	225796	225801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256098
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4149	NC_017047	TTC	2	6	227538	227543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384256102
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4229	NC_017047	TGAA	2	8	231865	231872	50 %	25 %	25 %	0 %	384256104
4230	NC_017047	TTTCG	2	10	231973	231982	0 %	60 %	20 %	20 %	384256104
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4234	NC_017047	TG	3	6	232325	232330	0 %	50 %	50 %	0 %	384256104
4235	NC_017047	CGA	2	6	232334	232339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256104
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4240	NC_017047	GAA	2	6	232578	232583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384256104
4241	NC_017047	CAG	2	6	232611	232616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256104
4242	NC_017047	CAGC	2	8	232625	232632	25 %	0 %	25 %	50 %	384256104
4243	NC_017047	TGA	2	6	232688	232693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384256104
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4245	NC_017047	GC	3	6	232798	232803	0 %	0 %	50 %	50 %	384256104
4246	NC_017047	TGCGC	2	10	232808	232817	0 %	20 %	40 %	40 %	384256104
4247	NC_017047	TGG	2	6	232848	232853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256104
4248	NC_017047	GCA	2	6	232931	232936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256104
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4272	NC_017047	ATCTGG	2	12	234039	234050	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384256105
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4274	NC_017047	TGG	2	6	234177	234182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256105
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4355	NC_017047	A	6	6	237572	237577	100 %	0 %	0 %	0 %	384256107
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4357	NC_017047	AATG	2	8	237679	237686	50 %	25 %	25 %	0 %	384256107
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4485	NC_017047	CCA	2	6	244689	244694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384256113
4486	NC_017047	CAC	2	6	244696	244701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384256113
4487	NC_017047	T	6	6	244709	244714	0 %	100 %	0 %	0 %	384256113
4488	NC_017047	GCA	2	6	244776	244781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256113
4489	NC_017047	CAC	2	6	244789	244794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384256113
4490	NC_017047	GCC	2	6	244804	244809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384256113
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