MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 chromosome

Total Repeats: 86515

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017047	CGC	2	6	26936	26941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384255928
502	NC_017047	ACC	2	6	26957	26962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384255928
503	NC_017047	CGGA	2	8	26963	26970	25 %	0 %	50 %	25 %	384255928
504	NC_017047	ACGG	2	8	26981	26988	25 %	0 %	50 %	25 %	384255928
505	NC_017047	CGG	2	6	26998	27003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384255928
506	NC_017047	CAG	2	6	27082	27087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255928
507	NC_017047	AAC	2	6	27113	27118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384255928
508	NC_017047	ACC	3	9	27257	27265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384255928
509	NC_017047	CAC	2	6	27301	27306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384255928
510	NC_017047	GAC	3	9	27317	27325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255928
511	NC_017047	ACC	2	6	27398	27403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384255928
512	NC_017047	CCT	2	6	27426	27431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384255928
513	NC_017047	GCC	2	6	27566	27571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384255929
514	NC_017047	AGGCGA	2	12	27616	27627	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384255929
515	NC_017047	AGA	2	6	27709	27714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384255929
516	NC_017047	TTGAA	2	10	27717	27726	40 %	40 %	20 %	0 %	384255929
517	NC_017047	GAA	2	6	27752	27757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384255929
518	NC_017047	T	6	6	27794	27799	0 %	100 %	0 %	0 %	384255930
519	NC_017047	AGA	2	6	27977	27982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384255930
520	NC_017047	ATC	2	6	27990	27995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384255930
521	NC_017047	ATT	2	6	28235	28240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384255931
522	NC_017047	GCA	2	6	28245	28250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255931
523	NC_017047	GC	3	6	28320	28325	0 %	0 %	50 %	50 %	384255931
524	NC_017047	CCGA	2	8	28375	28382	25 %	0 %	25 %	50 %	384255931
525	NC_017047	GCA	2	6	28413	28418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255931
526	NC_017047	TAT	2	6	28420	28425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384255931
527	NC_017047	TGA	2	6	28436	28441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384255931
528	NC_017047	ACTT	2	8	28618	28625	25 %	50 %	0 %	25 %	384255931
529	NC_017047	CAG	2	6	28627	28632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255931
530	NC_017047	CGG	2	6	28635	28640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384255931
531	NC_017047	ACC	2	6	28759	28764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384255931
532	NC_017047	AAG	2	6	28865	28870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384255931
533	NC_017047	CTG	2	6	28879	28884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255931
534	NC_017047	CTGC	2	8	28906	28913	0 %	25 %	25 %	50 %	384255931
535	NC_017047	CG	3	6	28959	28964	0 %	0 %	50 %	50 %	384255931
536	NC_017047	A	6	6	29114	29119	100 %	0 %	0 %	0 %	384255932
537	NC_017047	TGG	2	6	29126	29131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384255932
538	NC_017047	GAA	2	6	29143	29148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384255932
539	NC_017047	GCG	2	6	29215	29220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384255932
540	NC_017047	GC	3	6	29483	29488	0 %	0 %	50 %	50 %	384255932
541	NC_017047	AAC	2	6	29489	29494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384255932
542	NC_017047	TGC	2	6	29495	29500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255932
543	NC_017047	GAT	2	6	29505	29510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384255932
544	NC_017047	CTG	2	6	29602	29607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255932
545	NC_017047	CTG	2	6	29731	29736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255932
546	NC_017047	AGC	2	6	29765	29770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255932
547	NC_017047	CTG	2	6	29845	29850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255932
548	NC_017047	GAA	2	6	29851	29856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384255932
549	NC_017047	GGT	2	6	29880	29885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384255932
550	NC_017047	ACG	2	6	29978	29983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255932
551	NC_017047	ATCGA	2	10	30025	30034	40 %	20 %	20 %	20 %	384255932
552	NC_017047	GCA	2	6	30042	30047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255932
553	NC_017047	GTG	2	6	30070	30075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384255932
554	NC_017047	TTC	3	9	30100	30108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384255932
555	NC_017047	ACCG	2	8	30112	30119	25 %	0 %	25 %	50 %	384255932
556	NC_017047	ACCG	2	8	30199	30206	25 %	0 %	25 %	50 %	384255932
557	NC_017047	CTGG	2	8	30221	30228	0 %	25 %	50 %	25 %	384255932
558	NC_017047	CTG	2	6	30277	30282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255932
559	NC_017047	TGA	2	6	30296	30301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384255932
560	NC_017047	GCAT	2	8	30344	30351	25 %	25 %	25 %	25 %	384255932
561	NC_017047	ACG	2	6	30362	30367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255932
562	NC_017047	GAA	2	6	30376	30381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384255932
563	NC_017047	CGA	2	6	30426	30431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255932
564	NC_017047	GC	3	6	30455	30460	0 %	0 %	50 %	50 %	384255932
565	NC_017047	TAT	2	6	30573	30578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384255932
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567	NC_017047	GTA	2	6	30664	30669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384255932
568	NC_017047	GAT	2	6	30670	30675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384255932
569	NC_017047	CG	3	6	30703	30708	0 %	0 %	50 %	50 %	384255932
570	NC_017047	GAA	2	6	30718	30723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384255932
571	NC_017047	CGT	2	6	30760	30765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255932
572	NC_017047	GC	3	6	30790	30795	0 %	0 %	50 %	50 %	384255932
573	NC_017047	GGC	3	9	30843	30851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384255932
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581	NC_017047	TGG	2	6	31019	31024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384255932
582	NC_017047	GTGATG	2	12	31069	31080	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384255932
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593	NC_017047	CAT	2	6	31608	31613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384255933
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601	NC_017047	CAG	2	6	31954	31959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255933
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605	NC_017047	ATG	2	6	32032	32037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384255933
606	NC_017047	TGG	2	6	32045	32050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384255933
607	NC_017047	CAG	2	6	32056	32061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255933
608	NC_017047	TGA	2	6	32285	32290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384255934
609	NC_017047	GAT	2	6	32298	32303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384255934
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611	NC_017047	GCG	2	6	32407	32412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384255934
612	NC_017047	GCA	2	6	32424	32429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255934
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619	NC_017047	GAAA	2	8	32754	32761	75 %	0 %	25 %	0 %	384255934
620	NC_017047	CGC	2	6	32916	32921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384255934
621	NC_017047	GTG	2	6	32971	32976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384255934
622	NC_017047	GCG	2	6	32987	32992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384255934
623	NC_017047	CTG	2	6	33032	33037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255934
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