MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 chromosome

Total Repeats: 86515

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017047	CAT	2	6	271786	271791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384256142
5002	NC_017047	GGA	2	6	271800	271805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384256142
5003	NC_017047	GAC	2	6	271825	271830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256142
5004	NC_017047	CGG	2	6	271841	271846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256142
5005	NC_017047	ACA	2	6	271923	271928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384256142
5006	NC_017047	TTGA	2	8	271989	271996	25 %	50 %	25 %	0 %	384256142
5007	NC_017047	T	6	6	272409	272414	0 %	100 %	0 %	0 %	384256143
5008	NC_017047	GCG	2	6	272422	272427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256143
5009	NC_017047	CTG	2	6	272456	272461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256143
5010	NC_017047	GTTT	2	8	272483	272490	0 %	75 %	25 %	0 %	384256143
5011	NC_017047	GAA	2	6	272536	272541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384256143
5012	NC_017047	GC	3	6	272544	272549	0 %	0 %	50 %	50 %	384256143
5013	NC_017047	ACTTTG	2	12	272623	272634	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384256143
5014	NC_017047	CAC	2	6	272652	272657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384256143
5015	NC_017047	TG	3	6	272658	272663	0 %	50 %	50 %	0 %	384256143
5016	NC_017047	CGA	2	6	272672	272677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256143
5017	NC_017047	CGA	2	6	272732	272737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256143
5018	NC_017047	GCA	2	6	272945	272950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256143
5019	NC_017047	CGC	2	6	272991	272996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384256143
5020	NC_017047	TCG	2	6	273160	273165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256143
5021	NC_017047	CAT	2	6	273189	273194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384256143
5022	NC_017047	CAG	2	6	273219	273224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256143
5023	NC_017047	T	6	6	273291	273296	0 %	100 %	0 %	0 %	384256143
5024	NC_017047	CGT	2	6	273317	273322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256143
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5026	NC_017047	CCG	2	6	273515	273520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384256143
5027	NC_017047	GAA	2	6	273543	273548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384256143
5028	NC_017047	CCA	2	6	273587	273592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384256143
5029	NC_017047	TGT	2	6	273628	273633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384256143
5030	NC_017047	CCA	2	6	273680	273685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384256143
5031	NC_017047	GC	3	6	273754	273759	0 %	0 %	50 %	50 %	384256143
5032	NC_017047	CGG	2	6	273764	273769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256143
5033	NC_017047	GGC	2	6	273771	273776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256143
5034	NC_017047	GCA	3	9	273869	273877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256143
5035	NC_017047	ACG	2	6	273909	273914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256143
5036	NC_017047	CAG	2	6	273923	273928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256143
5037	NC_017047	GTT	2	6	273933	273938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384256143
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5040	NC_017047	GTT	2	6	273968	273973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384256143
5041	NC_017047	CTTT	2	8	273982	273989	0 %	75 %	0 %	25 %	384256143
5042	NC_017047	GGC	2	6	273991	273996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256143
5043	NC_017047	TGC	2	6	274003	274008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256143
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5045	NC_017047	CCA	2	6	274151	274156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384256143
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5050	NC_017047	CAG	2	6	274653	274658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256143
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5052	NC_017047	TCAT	2	8	274726	274733	25 %	50 %	0 %	25 %	384256143
5053	NC_017047	GTCGC	2	10	274879	274888	0 %	20 %	40 %	40 %	384256144
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5057	NC_017047	T	6	6	274926	274931	0 %	100 %	0 %	0 %	384256144
5058	NC_017047	GC	5	10	274937	274946	0 %	0 %	50 %	50 %	384256144
5059	NC_017047	CGT	2	6	275027	275032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256144
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5064	NC_017047	CAGTT	2	10	275265	275274	20 %	40 %	20 %	20 %	384256144
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5088	NC_017047	GTGAA	2	10	277193	277202	40 %	20 %	40 %	0 %	384256145
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5100	NC_017047	GTGC	2	8	277843	277850	0 %	25 %	50 %	25 %	384256145
5101	NC_017047	CG	3	6	277865	277870	0 %	0 %	50 %	50 %	384256145
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5103	NC_017047	GAATG	2	10	277960	277969	40 %	20 %	40 %	0 %	384256145
5104	NC_017047	TATCTG	2	12	277972	277983	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384256145
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5119	NC_017047	TGA	2	6	279645	279650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384256145
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5121	NC_017047	CCG	2	6	279733	279738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384256145
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5151	NC_017047	GTG	2	6	281011	281016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256145
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5210	NC_017047	GTG	2	6	284580	284585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256147
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5230	NC_017047	ATCA	2	8	285596	285603	50 %	25 %	0 %	25 %	384256148
5231	NC_017047	CCG	2	6	285663	285668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384256148
5232	NC_017047	CTG	2	6	285699	285704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256148
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5234	NC_017047	AAG	2	6	285745	285750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384256148
5235	NC_017047	TGC	2	6	285760	285765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256148
5236	NC_017047	CTGAA	2	10	285797	285806	40 %	20 %	20 %	20 %	384256148
5237	NC_017047	CGA	2	6	285816	285821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256148
5238	NC_017047	GA	3	6	285880	285885	50 %	0 %	50 %	0 %	384256148
5239	NC_017047	CAAC	2	8	285911	285918	50 %	0 %	0 %	50 %	384256148
5240	NC_017047	ATCCTG	2	12	285962	285973	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384256148
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5242	NC_017047	GA	3	6	286038	286043	50 %	0 %	50 %	0 %	384256148
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5366	NC_017047	CTT	3	9	292557	292565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384256154
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5369	NC_017047	CAT	3	9	292614	292622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384256154
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5373	NC_017047	CAT	2	6	292969	292974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384256155
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