MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Riemerella anatipestifer ATCC 11845 = DSM 15868 chromosome

Total Repeats: 1604

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017045	AGTTT	2	10	1625	1634	20 %	60 %	20 %	0 %	383484661
2	NC_017045	ATCAA	2	10	4569	4578	60 %	20 %	0 %	20 %	383484665
3	NC_017045	TTCAA	2	10	8197	8206	40 %	40 %	0 %	20 %	383484670
4	NC_017045	AAATG	2	10	11483	11492	60 %	20 %	20 %	0 %	383484672
5	NC_017045	AAGAA	2	10	11849	11858	80 %	0 %	20 %	0 %	383484672
6	NC_017045	AACGC	2	10	12445	12454	40 %	0 %	20 %	40 %	383484673
7	NC_017045	TACTT	2	10	13639	13648	20 %	60 %	0 %	20 %	383484674
8	NC_017045	AAAGA	2	10	15638	15647	80 %	0 %	20 %	0 %	383484676
9	NC_017045	AATAA	2	10	16885	16894	80 %	20 %	0 %	0 %	383484677
10	NC_017045	TTAAA	2	10	20723	20732	60 %	40 %	0 %	0 %	383484680
11	NC_017045	GTTTT	2	10	20891	20900	0 %	80 %	20 %	0 %	383484680
12	NC_017045	TGGAA	2	10	21743	21752	40 %	20 %	40 %	0 %	383484681
13	NC_017045	TAAAG	2	10	22763	22772	60 %	20 %	20 %	0 %	383484682
14	NC_017045	ACTTA	2	10	23446	23455	40 %	40 %	0 %	20 %	383484683
15	NC_017045	AAAAT	2	10	27692	27701	80 %	20 %	0 %	0 %	383484691
16	NC_017045	TCAAT	2	10	34585	34594	40 %	40 %	0 %	20 %	383484700
17	NC_017045	AAAGA	2	10	35383	35392	80 %	0 %	20 %	0 %	383484701
18	NC_017045	TTTAA	2	10	37250	37259	40 %	60 %	0 %	0 %	383484704
19	NC_017045	ATTTT	2	10	38469	38478	20 %	80 %	0 %	0 %	383484705
20	NC_017045	ACAGA	2	10	41649	41658	60 %	0 %	20 %	20 %	383484708
21	NC_017045	TAGAG	2	10	45274	45283	40 %	20 %	40 %	0 %	383484713
22	NC_017045	ATTTT	2	10	45444	45453	20 %	80 %	0 %	0 %	383484713
23	NC_017045	AGAGC	2	10	46083	46092	40 %	0 %	40 %	20 %	383484714
24	NC_017045	ATGTT	2	10	46798	46807	20 %	60 %	20 %	0 %	383484715
25	NC_017045	TTTCA	2	10	47046	47055	20 %	60 %	0 %	20 %	383484715
26	NC_017045	ACCAA	2	10	48933	48942	60 %	0 %	0 %	40 %	383484716
27	NC_017045	GGTAA	2	10	50598	50607	40 %	20 %	40 %	0 %	383484717
28	NC_017045	CCTAA	2	10	51081	51090	40 %	20 %	0 %	40 %	383484717
29	NC_017045	AGAAA	2	10	53214	53223	80 %	0 %	20 %	0 %	383484719
30	NC_017045	TTTTA	2	10	53309	53318	20 %	80 %	0 %	0 %	383484719
31	NC_017045	TCCTA	2	10	54701	54710	20 %	40 %	0 %	40 %	383484721
32	NC_017045	GTAAA	2	10	58670	58679	60 %	20 %	20 %	0 %	383484724
33	NC_017045	CATTA	2	10	59282	59291	40 %	40 %	0 %	20 %	383484725
34	NC_017045	TATTT	2	10	64672	64681	20 %	80 %	0 %	0 %	383484731
35	NC_017045	AATTT	2	10	65892	65901	40 %	60 %	0 %	0 %	383484732
36	NC_017045	AAGAA	2	10	68981	68990	80 %	0 %	20 %	0 %	383484734
37	NC_017045	ATTAT	2	10	69403	69412	40 %	60 %	0 %	0 %	383484734
38	NC_017045	TAAAA	2	10	70557	70566	80 %	20 %	0 %	0 %	383484734
39	NC_017045	TAAGA	2	10	72772	72781	60 %	20 %	20 %	0 %	383484735
40	NC_017045	AAACT	2	10	75455	75464	60 %	20 %	0 %	20 %	383484739
41	NC_017045	AAAAG	2	10	77199	77208	80 %	0 %	20 %	0 %	383484741
42	NC_017045	TGCTT	2	10	77903	77912	0 %	60 %	20 %	20 %	383484742
43	NC_017045	TTTTC	2	10	78103	78112	0 %	80 %	0 %	20 %	383484742
44	NC_017045	GTAGT	2	10	79533	79542	20 %	40 %	40 %	0 %	383484743
45	NC_017045	TTATA	2	10	80856	80865	40 %	60 %	0 %	0 %	383484745
46	NC_017045	GGCTT	2	10	81860	81869	0 %	40 %	40 %	20 %	383484746
47	NC_017045	GTGTT	2	10	83032	83041	0 %	60 %	40 %	0 %	383484746
48	NC_017045	TTCCG	2	10	84302	84311	0 %	40 %	20 %	40 %	383484747
49	NC_017045	GTGAA	2	10	85061	85070	40 %	20 %	40 %	0 %	383484747
50	NC_017045	TTTAG	2	10	85288	85297	20 %	60 %	20 %	0 %	383484747
51	NC_017045	AAAAT	3	15	86879	86893	80 %	20 %	0 %	0 %	383484749
52	NC_017045	GAGTA	2	10	88522	88531	40 %	20 %	40 %	0 %	383484751
53	NC_017045	ATCAG	2	10	88770	88779	40 %	20 %	20 %	20 %	383484751
54	NC_017045	GTTTT	2	10	91038	91047	0 %	80 %	20 %	0 %	383484751
55	NC_017045	GGGAA	2	10	91270	91279	40 %	0 %	60 %	0 %	383484752
56	NC_017045	AGTTA	2	10	91424	91433	40 %	40 %	20 %	0 %	383484752
57	NC_017045	TTTTG	2	10	93114	93123	0 %	80 %	20 %	0 %	383484754
58	NC_017045	CGTTT	2	10	93165	93174	0 %	60 %	20 %	20 %	383484754
59	NC_017045	AGCAC	2	10	100535	100544	40 %	0 %	20 %	40 %	383484762
60	NC_017045	CGTGT	2	10	100578	100587	0 %	40 %	40 %	20 %	383484762
61	NC_017045	GGTTT	2	10	106055	106064	0 %	60 %	40 %	0 %	383484767
62	NC_017045	CAACC	2	10	107532	107541	40 %	0 %	0 %	60 %	383484768
63	NC_017045	CATTT	2	10	108088	108097	20 %	60 %	0 %	20 %	383484769
64	NC_017045	ATTTT	2	10	108902	108911	20 %	80 %	0 %	0 %	383484771
65	NC_017045	TCATC	2	10	109316	109325	20 %	40 %	0 %	40 %	383484771
66	NC_017045	TCTCT	2	10	109759	109768	0 %	60 %	0 %	40 %	383484771
67	NC_017045	CCTCT	2	10	111485	111494	0 %	40 %	0 %	60 %	383484771
68	NC_017045	ACCCA	2	10	113535	113544	40 %	0 %	0 %	60 %	383484772
69	NC_017045	AAATC	2	10	113963	113972	60 %	20 %	0 %	20 %	383484773
70	NC_017045	CTTTG	2	10	115303	115312	0 %	60 %	20 %	20 %	383484774
71	NC_017045	CAGAA	2	10	115425	115434	60 %	0 %	20 %	20 %	383484775
72	NC_017045	TTTTC	2	10	117116	117125	0 %	80 %	0 %	20 %	383484778
73	NC_017045	GACCC	2	10	117255	117264	20 %	0 %	20 %	60 %	383484778
74	NC_017045	GTAGG	2	10	117575	117584	20 %	20 %	60 %	0 %	383484779
75	NC_017045	TAGTT	2	10	120128	120137	20 %	60 %	20 %	0 %	383484783
76	NC_017045	CTTAT	2	10	121368	121377	20 %	60 %	0 %	20 %	383484786
77	NC_017045	ATAAA	2	10	122242	122251	80 %	20 %	0 %	0 %	383484788
78	NC_017045	GCATA	2	10	123574	123583	40 %	20 %	20 %	20 %	383484791
79	NC_017045	CTTGT	2	10	124007	124016	0 %	60 %	20 %	20 %	383484791
80	NC_017045	GAAAA	2	10	124057	124066	80 %	0 %	20 %	0 %	383484791
81	NC_017045	AAAAG	2	10	127622	127631	80 %	0 %	20 %	0 %	383484795
82	NC_017045	TGCAT	2	10	129097	129106	20 %	40 %	20 %	20 %	383484798
83	NC_017045	TTTGT	2	10	129233	129242	0 %	80 %	20 %	0 %	383484798
84	NC_017045	ATTAA	2	10	129380	129389	60 %	40 %	0 %	0 %	383484799
85	NC_017045	TTTTC	2	10	129449	129458	0 %	80 %	0 %	20 %	383484799
86	NC_017045	CAAAG	2	10	130590	130599	60 %	0 %	20 %	20 %	383484801
87	NC_017045	TTCTT	2	10	131453	131462	0 %	80 %	0 %	20 %	383484802
88	NC_017045	CTTTT	2	10	131672	131681	0 %	80 %	0 %	20 %	383484802
89	NC_017045	ATTTT	2	10	133320	133329	20 %	80 %	0 %	0 %	383484805
90	NC_017045	TTGTT	2	10	133723	133732	0 %	80 %	20 %	0 %	383484805
91	NC_017045	TTTGG	2	10	136924	136933	0 %	60 %	40 %	0 %	383484815
92	NC_017045	TAAAA	2	10	137867	137876	80 %	20 %	0 %	0 %	383484816
93	NC_017045	GTTTT	2	10	138520	138529	0 %	80 %	20 %	0 %	383484817
94	NC_017045	TTTAG	2	10	138642	138651	20 %	60 %	20 %	0 %	383484817
95	NC_017045	AGGTA	2	10	139984	139993	40 %	20 %	40 %	0 %	383484821
96	NC_017045	CTCTT	2	10	142102	142111	0 %	60 %	0 %	40 %	383484827
97	NC_017045	AGGGG	2	10	143395	143404	20 %	0 %	80 %	0 %	383484829
98	NC_017045	TATTT	2	10	145477	145486	20 %	80 %	0 %	0 %	383484832
99	NC_017045	TTGGA	2	10	145900	145909	20 %	40 %	40 %	0 %	383484832
100	NC_017045	TTAAT	2	10	147475	147484	40 %	60 %	0 %	0 %	383484833
101	NC_017045	AAAAT	2	10	147663	147672	80 %	20 %	0 %	0 %	383484833
102	NC_017045	TAATC	2	10	148402	148411	40 %	40 %	0 %	20 %	383484834
103	NC_017045	ATCAA	2	10	148412	148421	60 %	20 %	0 %	20 %	383484834
104	NC_017045	GAATA	2	10	148512	148521	60 %	20 %	20 %	0 %	383484834
105	NC_017045	TTTTA	2	10	149288	149297	20 %	80 %	0 %	0 %	383484835
106	NC_017045	TCTTG	2	10	149511	149520	0 %	60 %	20 %	20 %	383484836
107	NC_017045	TTGGA	2	10	150920	150929	20 %	40 %	40 %	0 %	383484838
108	NC_017045	AGTTT	2	10	151542	151551	20 %	60 %	20 %	0 %	383484838
109	NC_017045	GTATT	2	10	152101	152110	20 %	60 %	20 %	0 %	383484839
110	NC_017045	CAAAC	2	10	153858	153867	60 %	0 %	0 %	40 %	383484842
111	NC_017045	TTTTC	2	10	154166	154175	0 %	80 %	0 %	20 %	383484842
112	NC_017045	AAGTA	2	10	155085	155094	60 %	20 %	20 %	0 %	383484842
113	NC_017045	AATGG	2	10	157701	157710	40 %	20 %	40 %	0 %	383484843
114	NC_017045	GATAG	2	10	158666	158675	40 %	20 %	40 %	0 %	383484843
115	NC_017045	CAGGG	2	10	159881	159890	20 %	0 %	60 %	20 %	383484845
116	NC_017045	TATCA	2	10	160248	160257	40 %	40 %	0 %	20 %	383484845
117	NC_017045	TTCTG	2	10	164063	164072	0 %	60 %	20 %	20 %	383484851
118	NC_017045	TAGAA	2	10	165123	165132	60 %	20 %	20 %	0 %	383484852
119	NC_017045	CTAGG	2	10	166223	166232	20 %	20 %	40 %	20 %	383484852
120	NC_017045	TATAA	2	10	166734	166743	60 %	40 %	0 %	0 %	383484852
121	NC_017045	TACCA	2	10	167295	167304	40 %	20 %	0 %	40 %	383484852
122	NC_017045	AAATC	2	10	167806	167815	60 %	20 %	0 %	20 %	383484852
123	NC_017045	AAATT	2	10	167957	167966	60 %	40 %	0 %	0 %	383484852
124	NC_017045	TATCA	2	10	171621	171630	40 %	40 %	0 %	20 %	383484855
125	NC_017045	AAAAC	2	10	173057	173066	80 %	0 %	0 %	20 %	383484857
126	NC_017045	AATTT	2	10	176203	176212	40 %	60 %	0 %	0 %	383484859
127	NC_017045	CAAAA	2	10	176537	176546	80 %	0 %	0 %	20 %	383484859
128	NC_017045	TACAA	2	10	177346	177355	60 %	20 %	0 %	20 %	383484860
129	NC_017045	CTTAT	2	10	177850	177859	20 %	60 %	0 %	20 %	383484861
130	NC_017045	AAAAG	2	10	178214	178223	80 %	0 %	20 %	0 %	383484862
131	NC_017045	ACATC	2	10	181078	181087	40 %	20 %	0 %	40 %	383484865
132	NC_017045	GTAGT	2	10	182231	182240	20 %	40 %	40 %	0 %	383484866
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134	NC_017045	GAAAA	2	10	184198	184207	80 %	0 %	20 %	0 %	383484867
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