MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 25017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017044	AAAG	2	8	200736	200743	75 %	0 %	25 %	0 %	383483531
4002	NC_017044	ATA	2	6	200822	200827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483531
4003	NC_017044	GCT	2	6	200968	200973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483531
4004	NC_017044	TA	3	6	201008	201013	50 %	50 %	0 %	0 %	383483531
4005	NC_017044	TCA	2	6	201040	201045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483531
4006	NC_017044	T	6	6	201055	201060	0 %	100 %	0 %	0 %	383483531
4007	NC_017044	ATTA	2	8	201164	201171	50 %	50 %	0 %	0 %	383483532
4008	NC_017044	ATT	2	6	201290	201295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483532
4009	NC_017044	CCA	2	6	201341	201346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383483532
4010	NC_017044	CTT	2	6	201377	201382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483532
4011	NC_017044	T	6	6	201418	201423	0 %	100 %	0 %	0 %	383483532
4012	NC_017044	AGCA	2	8	201439	201446	50 %	0 %	25 %	25 %	383483532
4013	NC_017044	CAG	2	6	201450	201455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483532
4014	NC_017044	T	6	6	201472	201477	0 %	100 %	0 %	0 %	383483532
4015	NC_017044	ATC	2	6	201514	201519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483532
4016	NC_017044	CTT	2	6	201534	201539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483532
4017	NC_017044	GCT	2	6	201608	201613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483532
4018	NC_017044	TAT	2	6	201672	201677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483532
4019	NC_017044	TAAT	3	12	201689	201700	50 %	50 %	0 %	0 %	383483532
4020	NC_017044	GAT	2	6	201730	201735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483532
4021	NC_017044	ATC	2	6	201766	201771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483532
4022	NC_017044	ATT	2	6	201775	201780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483532
4023	NC_017044	TGC	2	6	201796	201801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483532
4024	NC_017044	TC	3	6	201829	201834	0 %	50 %	0 %	50 %	383483532
4025	NC_017044	ATA	2	6	202202	202207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483533
4026	NC_017044	TATT	2	8	202235	202242	25 %	75 %	0 %	0 %	383483533
4027	NC_017044	AAG	2	6	202280	202285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483533
4028	NC_017044	TTA	2	6	202291	202296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483533
4029	NC_017044	TTA	2	6	202322	202327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483533
4030	NC_017044	TTA	2	6	202342	202347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483533
4031	NC_017044	TTA	2	6	202375	202380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483533
4032	NC_017044	T	6	6	202454	202459	0 %	100 %	0 %	0 %	383483533
4033	NC_017044	TTA	2	6	202486	202491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483533
4034	NC_017044	ATA	2	6	202499	202504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483533
4035	NC_017044	CGG	2	6	202509	202514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383483533
4036	NC_017044	TGT	2	6	202575	202580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383483533
4037	NC_017044	T	6	6	202652	202657	0 %	100 %	0 %	0 %	383483533
4038	NC_017044	T	7	7	202682	202688	0 %	100 %	0 %	0 %	383483534
4039	NC_017044	ATTA	2	8	202715	202722	50 %	50 %	0 %	0 %	383483534
4040	NC_017044	TTC	2	6	202766	202771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483534
4041	NC_017044	ATT	2	6	202796	202801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483534
4042	NC_017044	T	6	6	202811	202816	0 %	100 %	0 %	0 %	383483534
4043	NC_017044	ATA	2	6	202836	202841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483534
4044	NC_017044	TTC	2	6	202865	202870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483534
4045	NC_017044	T	8	8	202937	202944	0 %	100 %	0 %	0 %	383483534
4046	NC_017044	CTA	2	6	202969	202974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483534
4047	NC_017044	TAT	2	6	203005	203010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483534
4048	NC_017044	TA	3	6	203020	203025	50 %	50 %	0 %	0 %	383483534
4049	NC_017044	ATT	2	6	203051	203056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483534
4050	NC_017044	AT	3	6	203067	203072	50 %	50 %	0 %	0 %	383483534
4051	NC_017044	T	6	6	203163	203168	0 %	100 %	0 %	0 %	383483534
4052	NC_017044	T	6	6	203177	203182	0 %	100 %	0 %	0 %	383483534
4053	NC_017044	ATA	2	6	203208	203213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483534
4054	NC_017044	CAA	2	6	203227	203232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383483534
4055	NC_017044	TC	3	6	203233	203238	0 %	50 %	0 %	50 %	383483534
4056	NC_017044	AGG	2	6	203258	203263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383483534
4057	NC_017044	T	6	6	203293	203298	0 %	100 %	0 %	0 %	383483534
4058	NC_017044	T	8	8	203306	203313	0 %	100 %	0 %	0 %	383483534
4059	NC_017044	CCG	2	6	203674	203679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383483535
4060	NC_017044	T	7	7	203681	203687	0 %	100 %	0 %	0 %	383483535
4061	NC_017044	AAT	2	6	203713	203718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483535
4062	NC_017044	TTA	2	6	203797	203802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483535
4063	NC_017044	TCT	2	6	203827	203832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483535
4064	NC_017044	CATT	2	8	203959	203966	25 %	50 %	0 %	25 %	383483535
4065	NC_017044	TTTA	2	8	203982	203989	25 %	75 %	0 %	0 %	383483535
4066	NC_017044	AAT	2	6	203998	204003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483535
4067	NC_017044	CATT	2	8	204040	204047	25 %	50 %	0 %	25 %	383483535
4068	NC_017044	TGC	2	6	204048	204053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483535
4069	NC_017044	CTA	2	6	204086	204091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483535
4070	NC_017044	CAT	2	6	204101	204106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483535
4071	NC_017044	TCA	2	6	204193	204198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483535
4072	NC_017044	TAA	2	6	204213	204218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483535
4073	NC_017044	CTT	3	9	204251	204259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483535
4074	NC_017044	CGC	2	6	204281	204286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383483535
4075	NC_017044	ATT	2	6	204316	204321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483535
4076	NC_017044	CAAG	2	8	204335	204342	50 %	0 %	25 %	25 %	383483535
4077	NC_017044	ATG	2	6	204379	204384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483535
4078	NC_017044	GAATT	2	10	204389	204398	40 %	40 %	20 %	0 %	383483535
4079	NC_017044	CGC	2	6	204434	204439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383483535
4080	NC_017044	T	6	6	204532	204537	0 %	100 %	0 %	0 %	383483535
4081	NC_017044	GCT	2	6	204547	204552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483535
4082	NC_017044	TGA	2	6	204561	204566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483535
4083	NC_017044	TGAT	2	8	204639	204646	25 %	50 %	25 %	0 %	383483535
4084	NC_017044	AAT	2	6	204803	204808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483535
4085	NC_017044	ATTT	3	12	204830	204841	25 %	75 %	0 %	0 %	383483535
4086	NC_017044	AAGCCC	2	12	204849	204860	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	383483535
4087	NC_017044	TGC	2	6	204918	204923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483535
4088	NC_017044	TGC	2	6	204954	204959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483535
4089	NC_017044	TAC	2	6	204968	204973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483535
4090	NC_017044	A	6	6	204980	204985	100 %	0 %	0 %	0 %	383483535
4091	NC_017044	AT	3	6	205060	205065	50 %	50 %	0 %	0 %	383483535
4092	NC_017044	CAG	2	6	205207	205212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483536
4093	NC_017044	TAAA	2	8	205255	205262	75 %	25 %	0 %	0 %	383483536
4094	NC_017044	ATA	2	6	205275	205280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483536
4095	NC_017044	TAA	2	6	205334	205339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483536
4096	NC_017044	ATT	2	6	205364	205369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483536
4097	NC_017044	ACG	2	6	205388	205393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483536
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4099	NC_017044	GAT	2	6	205434	205439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483536
4100	NC_017044	ATA	2	6	205458	205463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483536
4101	NC_017044	TCC	2	6	205476	205481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383483536
4102	NC_017044	GAA	2	6	205584	205589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483536
4103	NC_017044	TAA	2	6	205611	205616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483536
4104	NC_017044	AGT	2	6	205680	205685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483536
4105	NC_017044	ATA	2	6	205710	205715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483536
4106	NC_017044	AAT	2	6	205724	205729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483536
4107	NC_017044	CAT	2	6	205850	205855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483536
4108	NC_017044	GCC	2	6	206012	206017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383483536
4109	NC_017044	AGC	2	6	206033	206038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483536
4110	NC_017044	CTG	2	6	206059	206064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483536
4111	NC_017044	GAA	2	6	206079	206084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483536
4112	NC_017044	ATC	2	6	206108	206113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483536
4113	NC_017044	AAC	2	6	206146	206151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383483536
4114	NC_017044	GCT	2	6	206382	206387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483536
4115	NC_017044	T	6	6	206502	206507	0 %	100 %	0 %	0 %	383483536
4116	NC_017044	GTTT	2	8	206536	206543	0 %	75 %	25 %	0 %	383483536
4117	NC_017044	ATT	2	6	206556	206561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483537
4118	NC_017044	CAA	2	6	206562	206567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383483537
4119	NC_017044	CTT	2	6	206592	206597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483537
4120	NC_017044	ATA	2	6	206759	206764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483537
4121	NC_017044	A	6	6	206779	206784	100 %	0 %	0 %	0 %	383483537
4122	NC_017044	TCT	2	6	206798	206803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483537
4123	NC_017044	CTT	3	9	206841	206849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483537
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4491	NC_017044	TAA	2	6	224230	224235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483556
4492	NC_017044	ATG	3	9	224248	224256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483556
4493	NC_017044	AAT	2	6	224258	224263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483556
4494	NC_017044	AT	3	6	224310	224315	50 %	50 %	0 %	0 %	383483556
4495	NC_017044	TAT	2	6	224374	224379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483556
4496	NC_017044	CAT	2	6	224402	224407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483556
4497	NC_017044	AGTTAA	2	12	224411	224422	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383483556
4498	NC_017044	CAA	2	6	224425	224430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383483556
4499	NC_017044	AATA	2	8	224474	224481	75 %	25 %	0 %	0 %	383483556
4500	NC_017044	GCA	2	6	224526	224531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483556

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