MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 25017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017044	ATG	2	6	151734	151739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483488
3002	NC_017044	GATA	2	8	151790	151797	50 %	25 %	25 %	0 %	383483488
3003	NC_017044	AT	3	6	151838	151843	50 %	50 %	0 %	0 %	383483488
3004	NC_017044	TCG	2	6	151844	151849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483488
3005	NC_017044	GAT	2	6	151935	151940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483488
3006	NC_017044	GAA	2	6	151950	151955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483488
3007	NC_017044	CCG	2	6	151990	151995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383483488
3008	NC_017044	AGA	2	6	152024	152029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483488
3009	NC_017044	TAA	2	6	152033	152038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483488
3010	NC_017044	TAAA	2	8	152083	152090	75 %	25 %	0 %	0 %	383483488
3011	NC_017044	AAGC	2	8	152103	152110	50 %	0 %	25 %	25 %	383483488
3012	NC_017044	TAA	2	6	152147	152152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483488
3013	NC_017044	AGA	2	6	152225	152230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483488
3014	NC_017044	TGA	2	6	152315	152320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483489
3015	NC_017044	GAA	2	6	152344	152349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483489
3016	NC_017044	ATC	2	6	152361	152366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483489
3017	NC_017044	GAA	2	6	152397	152402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483489
3018	NC_017044	G	6	6	155136	155141	0 %	0 %	100 %	0 %	383483490
3019	NC_017044	T	6	6	155158	155163	0 %	100 %	0 %	0 %	383483490
3020	NC_017044	AAAG	2	8	155169	155176	75 %	0 %	25 %	0 %	383483490
3021	NC_017044	ATA	2	6	155204	155209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483490
3022	NC_017044	ATG	2	6	155225	155230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483490
3023	NC_017044	GAA	2	6	155235	155240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483490
3024	NC_017044	GCA	3	9	155289	155297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483491
3025	NC_017044	AGC	2	6	155323	155328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483491
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3027	NC_017044	TAAA	2	8	155694	155701	75 %	25 %	0 %	0 %	383483492
3028	NC_017044	TTA	2	6	155721	155726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483492
3029	NC_017044	TGA	3	9	155764	155772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483492
3030	NC_017044	GGT	2	6	155783	155788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383483492
3031	NC_017044	A	6	6	155923	155928	100 %	0 %	0 %	0 %	383483492
3032	NC_017044	CGG	2	6	156031	156036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383483492
3033	NC_017044	TACC	2	8	156042	156049	25 %	25 %	0 %	50 %	383483492
3034	NC_017044	ACT	2	6	156076	156081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483492
3035	NC_017044	TCT	2	6	156113	156118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483492
3036	NC_017044	GAA	2	6	156128	156133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483492
3037	NC_017044	GGGC	2	8	156148	156155	0 %	0 %	75 %	25 %	383483492
3038	NC_017044	TA	3	6	156168	156173	50 %	50 %	0 %	0 %	383483492
3039	NC_017044	TAAT	2	8	156237	156244	50 %	50 %	0 %	0 %	383483492
3040	NC_017044	A	6	6	156251	156256	100 %	0 %	0 %	0 %	383483492
3041	NC_017044	A	6	6	156326	156331	100 %	0 %	0 %	0 %	383483493
3042	NC_017044	ATT	2	6	156337	156342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483493
3043	NC_017044	A	7	7	156385	156391	100 %	0 %	0 %	0 %	383483493
3044	NC_017044	ATT	2	6	156436	156441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483493
3045	NC_017044	TCTT	2	8	156541	156548	0 %	75 %	0 %	25 %	383483493
3046	NC_017044	GTA	2	6	156625	156630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483493
3047	NC_017044	AGT	2	6	156639	156644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483493
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3051	NC_017044	GCA	2	6	156733	156738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483493
3052	NC_017044	TTTATC	2	12	156971	156982	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383483494
3053	NC_017044	GAA	2	6	157035	157040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483494
3054	NC_017044	CTT	2	6	157063	157068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483494
3055	NC_017044	TA	3	6	157112	157117	50 %	50 %	0 %	0 %	383483494
3056	NC_017044	TAC	3	9	157136	157144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483494
3057	NC_017044	AAT	2	6	157222	157227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483495
3058	NC_017044	TAA	2	6	157255	157260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483495
3059	NC_017044	GATTTT	2	12	157265	157276	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383483495
3060	NC_017044	A	6	6	157286	157291	100 %	0 %	0 %	0 %	383483495
3061	NC_017044	GTTA	2	8	157292	157299	25 %	50 %	25 %	0 %	383483495
3062	NC_017044	ATT	2	6	157310	157315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483495
3063	NC_017044	TA	4	8	157345	157352	50 %	50 %	0 %	0 %	383483495
3064	NC_017044	AATTT	2	10	157353	157362	40 %	60 %	0 %	0 %	383483495
3065	NC_017044	CGG	2	6	157378	157383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383483495
3066	NC_017044	AGGTG	2	10	157459	157468	20 %	20 %	60 %	0 %	383483495
3067	NC_017044	GTA	3	9	157515	157523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483495
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3069	NC_017044	TTAA	2	8	157553	157560	50 %	50 %	0 %	0 %	383483495
3070	NC_017044	TCTT	2	8	157673	157680	0 %	75 %	0 %	25 %	383483495
3071	NC_017044	TGC	2	6	157816	157821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483495
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3073	NC_017044	GTA	2	6	157859	157864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483495
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3075	NC_017044	A	8	8	157904	157911	100 %	0 %	0 %	0 %	383483495
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3089	NC_017044	TTGC	3	12	158637	158648	0 %	50 %	25 %	25 %	383483496
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3092	NC_017044	ATTT	2	8	158797	158804	25 %	75 %	0 %	0 %	383483496
3093	NC_017044	GAA	2	6	158836	158841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483496
3094	NC_017044	A	6	6	158869	158874	100 %	0 %	0 %	0 %	383483496
3095	NC_017044	GCC	2	6	158892	158897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383483496
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3098	NC_017044	AGT	2	6	158961	158966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483496
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3101	NC_017044	GTG	2	6	159128	159133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383483496
3102	NC_017044	GTG	2	6	159137	159142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383483496
3103	NC_017044	TTC	2	6	159177	159182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483496
3104	NC_017044	CAG	2	6	159242	159247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483496
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3106	NC_017044	TAT	2	6	159270	159275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483496
3107	NC_017044	CATG	2	8	159333	159340	25 %	25 %	25 %	25 %	383483496
3108	NC_017044	ATG	2	6	159397	159402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483496
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3110	NC_017044	GAAA	2	8	159459	159466	75 %	0 %	25 %	0 %	383483496
3111	NC_017044	ATA	2	6	159776	159781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483497
3112	NC_017044	TAA	2	6	159795	159800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483497
3113	NC_017044	CTTTTG	2	12	159824	159835	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383483497
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3115	NC_017044	TTA	2	6	159866	159871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483497
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3117	NC_017044	ATT	2	6	159965	159970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483497
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3119	NC_017044	AT	3	6	160080	160085	50 %	50 %	0 %	0 %	383483497
3120	NC_017044	ATTG	2	8	160122	160129	25 %	50 %	25 %	0 %	383483497
3121	NC_017044	AT	4	8	160138	160145	50 %	50 %	0 %	0 %	383483497
3122	NC_017044	A	7	7	160153	160159	100 %	0 %	0 %	0 %	383483497
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3493	NC_017044	A	7	7	175632	175638	100 %	0 %	0 %	0 %	383483515
3494	NC_017044	ATAA	2	8	175667	175674	75 %	25 %	0 %	0 %	383483516
3495	NC_017044	TAT	2	6	175751	175756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483516
3496	NC_017044	TGGAT	2	10	175806	175815	20 %	40 %	40 %	0 %	383483516
3497	NC_017044	GAACAA	2	12	175817	175828	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383483516
3498	NC_017044	GCT	2	6	175853	175858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483516
3499	NC_017044	ACT	2	6	175859	175864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483516
3500	NC_017044	TAAT	2	8	175884	175891	50 %	50 %	0 %	0 %	383483516

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