MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 25017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017044	GCATTA	2	12	24936	24947	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383483363
502	NC_017044	TAG	2	6	24986	24991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483363
503	NC_017044	GAA	2	6	24999	25004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483363
504	NC_017044	GAA	3	9	25029	25037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483363
505	NC_017044	TCCGAT	2	12	25053	25064	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383483363
506	NC_017044	A	7	7	25121	25127	100 %	0 %	0 %	0 %	383483363
507	NC_017044	GTT	2	6	25179	25184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383483363
508	NC_017044	ATA	2	6	25198	25203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483363
509	NC_017044	TAA	2	6	25241	25246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483363
510	NC_017044	TGA	2	6	25268	25273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483363
511	NC_017044	AGA	2	6	25274	25279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483363
512	NC_017044	TAA	2	6	25325	25330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483363
513	NC_017044	CTA	2	6	25381	25386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483363
514	NC_017044	AAT	2	6	25410	25415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483363
515	NC_017044	TTCA	2	8	25441	25448	25 %	50 %	0 %	25 %	383483363
516	NC_017044	ATTTAA	2	12	25451	25462	50 %	50 %	0 %	0 %	383483363
517	NC_017044	AAT	2	6	25473	25478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483363
518	NC_017044	TTA	2	6	25489	25494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483363
519	NC_017044	GAA	2	6	25535	25540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483363
520	NC_017044	TTA	2	6	25579	25584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483363
521	NC_017044	AAC	2	6	25592	25597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383483363
522	NC_017044	TTA	2	6	25705	25710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483363
523	NC_017044	TA	3	6	25753	25758	50 %	50 %	0 %	0 %	383483363
524	NC_017044	AAT	2	6	25806	25811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483363
525	NC_017044	AT	3	6	25810	25815	50 %	50 %	0 %	0 %	383483363
526	NC_017044	TAA	2	6	25871	25876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483363
527	NC_017044	AATA	2	8	25934	25941	75 %	25 %	0 %	0 %	383483363
528	NC_017044	GTT	2	6	25944	25949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383483363
529	NC_017044	ATA	2	6	25960	25965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483363
530	NC_017044	TAT	2	6	26027	26032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483363
531	NC_017044	TAC	2	6	26048	26053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483363
532	NC_017044	ATT	2	6	26071	26076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483363
533	NC_017044	TAAA	2	8	26080	26087	75 %	25 %	0 %	0 %	383483363
534	NC_017044	TCA	2	6	26099	26104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483363
535	NC_017044	AGAAAA	2	12	26455	26466	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383483364
536	NC_017044	AAT	2	6	26728	26733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483365
537	NC_017044	ACA	2	6	27504	27509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383483366
538	NC_017044	AGA	2	6	27513	27518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483366
539	NC_017044	TTA	2	6	27635	27640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483366
540	NC_017044	AAC	2	6	27677	27682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383483366
541	NC_017044	GAA	2	6	27721	27726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483366
542	NC_017044	ATA	2	6	27730	27735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483366
543	NC_017044	TAT	2	6	27776	27781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483366
544	NC_017044	TAAT	2	8	27836	27843	50 %	50 %	0 %	0 %	383483366
545	NC_017044	TAC	2	6	27873	27878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483366
546	NC_017044	ATA	2	6	27884	27889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483366
547	NC_017044	TGA	2	6	27897	27902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483366
548	NC_017044	ATATT	2	10	27911	27920	40 %	60 %	0 %	0 %	383483366
549	NC_017044	A	6	6	27937	27942	100 %	0 %	0 %	0 %	383483366
550	NC_017044	ATATT	2	10	27949	27958	40 %	60 %	0 %	0 %	383483366
551	NC_017044	A	6	6	27972	27977	100 %	0 %	0 %	0 %	383483366
552	NC_017044	AAGA	2	8	27988	27995	75 %	0 %	25 %	0 %	383483366
553	NC_017044	TAG	2	6	28007	28012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483366
554	NC_017044	GTA	2	6	28022	28027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483366
555	NC_017044	TGC	2	6	28032	28037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483366
556	NC_017044	AAAT	2	8	28080	28087	75 %	25 %	0 %	0 %	383483366
557	NC_017044	GAA	2	6	28250	28255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483367
558	NC_017044	GAA	2	6	28271	28276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483367
559	NC_017044	TCA	2	6	29424	29429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483368
560	NC_017044	T	6	6	29498	29503	0 %	100 %	0 %	0 %	383483368
561	NC_017044	TTC	2	6	29516	29521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483368
562	NC_017044	T	6	6	29533	29538	0 %	100 %	0 %	0 %	383483368
563	NC_017044	TCT	2	6	29571	29576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483368
564	NC_017044	GT	3	6	29622	29627	0 %	50 %	50 %	0 %	383483368
565	NC_017044	AGC	2	6	29639	29644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483368
566	NC_017044	TCT	2	6	29646	29651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483368
567	NC_017044	T	7	7	29723	29729	0 %	100 %	0 %	0 %	383483368
568	NC_017044	ATC	2	6	29786	29791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483368
569	NC_017044	ATT	2	6	29802	29807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483368
570	NC_017044	GTA	2	6	29823	29828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483369
571	NC_017044	T	6	6	29856	29861	0 %	100 %	0 %	0 %	383483369
572	NC_017044	AAT	2	6	29863	29868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483369
573	NC_017044	TGC	2	6	29890	29895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483369
574	NC_017044	TTA	2	6	29900	29905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483369
575	NC_017044	AGC	2	6	29920	29925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483369
576	NC_017044	T	6	6	29960	29965	0 %	100 %	0 %	0 %	383483369
577	NC_017044	T	8	8	29984	29991	0 %	100 %	0 %	0 %	383483369
578	NC_017044	T	6	6	30021	30026	0 %	100 %	0 %	0 %	383483369
579	NC_017044	T	7	7	30028	30034	0 %	100 %	0 %	0 %	383483369
580	NC_017044	TCTA	2	8	30037	30044	25 %	50 %	0 %	25 %	383483369
581	NC_017044	TTTGT	2	10	30053	30062	0 %	80 %	20 %	0 %	383483369
582	NC_017044	ATTT	2	8	30081	30088	25 %	75 %	0 %	0 %	383483369
583	NC_017044	TGTC	2	8	30145	30152	0 %	50 %	25 %	25 %	383483369
584	NC_017044	TAT	2	6	30153	30158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483369
585	NC_017044	TTC	2	6	30166	30171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483369
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587	NC_017044	AAT	2	6	30246	30251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483369
588	NC_017044	A	6	6	30300	30305	100 %	0 %	0 %	0 %	383483370
589	NC_017044	A	6	6	30330	30335	100 %	0 %	0 %	0 %	383483370
590	NC_017044	AG	3	6	30425	30430	50 %	0 %	50 %	0 %	383483370
591	NC_017044	AT	3	6	30435	30440	50 %	50 %	0 %	0 %	383483370
592	NC_017044	TAA	2	6	30594	30599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483371
593	NC_017044	A	6	6	30643	30648	100 %	0 %	0 %	0 %	383483371
594	NC_017044	TAA	2	6	30726	30731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483372
595	NC_017044	CAT	2	6	30732	30737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483372
596	NC_017044	AC	3	6	30744	30749	50 %	0 %	0 %	50 %	383483372
597	NC_017044	CAA	2	6	30786	30791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383483372
598	NC_017044	ATA	2	6	30818	30823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483372
599	NC_017044	TAA	2	6	30883	30888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483372
600	NC_017044	CAT	2	6	30901	30906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483372
601	NC_017044	ATC	2	6	30971	30976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483372
602	NC_017044	A	7	7	31010	31016	100 %	0 %	0 %	0 %	383483372
603	NC_017044	A	6	6	31022	31027	100 %	0 %	0 %	0 %	383483372
604	NC_017044	ATA	2	6	31100	31105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483372
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607	NC_017044	CACT	2	8	31260	31267	25 %	25 %	0 %	50 %	383483372
608	NC_017044	T	6	6	31405	31410	0 %	100 %	0 %	0 %	383483372
609	NC_017044	TAT	2	6	31456	31461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483373
610	NC_017044	T	6	6	31466	31471	0 %	100 %	0 %	0 %	383483373
611	NC_017044	TAT	2	6	31502	31507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483373
612	NC_017044	ATA	2	6	31515	31520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483373
613	NC_017044	GTT	2	6	31659	31664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383483373
614	NC_017044	TCATT	2	10	31830	31839	20 %	60 %	0 %	20 %	383483374
615	NC_017044	T	6	6	31838	31843	0 %	100 %	0 %	0 %	383483374
616	NC_017044	CTC	2	6	31858	31863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383483374
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621	NC_017044	TAA	2	6	32071	32076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483374
622	NC_017044	TATT	2	8	32084	32091	25 %	75 %	0 %	0 %	383483374
623	NC_017044	TTG	2	6	32110	32115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383483374
624	NC_017044	GCA	2	6	32180	32185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483374
625	NC_017044	TAG	2	6	32199	32204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483374
626	NC_017044	AT	3	6	32246	32251	50 %	50 %	0 %	0 %	383483374
627	NC_017044	T	6	6	32251	32256	0 %	100 %	0 %	0 %	383483374
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