MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 25017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017044	ATG	2	6	249644	249649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483582
5002	NC_017044	AAT	2	6	249655	249660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483582
5003	NC_017044	CGG	2	6	249684	249689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383483582
5004	NC_017044	T	6	6	249697	249702	0 %	100 %	0 %	0 %	383483582
5005	NC_017044	GAT	2	6	249709	249714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483582
5006	NC_017044	TAA	2	6	249723	249728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483582
5007	NC_017044	GTA	2	6	249776	249781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483582
5008	NC_017044	T	6	6	249802	249807	0 %	100 %	0 %	0 %	383483582
5009	NC_017044	TGA	2	6	249876	249881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483582
5010	NC_017044	TTA	2	6	249951	249956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483582
5011	NC_017044	TCG	2	6	249985	249990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483582
5012	NC_017044	ATG	2	6	249992	249997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483582
5013	NC_017044	TA	3	6	250042	250047	50 %	50 %	0 %	0 %	383483582
5014	NC_017044	CAT	2	6	250947	250952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483583
5015	NC_017044	TAT	2	6	251005	251010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483583
5016	NC_017044	CATGG	2	10	251031	251040	20 %	20 %	40 %	20 %	383483583
5017	NC_017044	AGA	2	6	251047	251052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483583
5018	NC_017044	GAT	2	6	251066	251071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483583
5019	NC_017044	A	6	6	251086	251091	100 %	0 %	0 %	0 %	383483583
5020	NC_017044	AAT	2	6	251101	251106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483583
5021	NC_017044	TCT	2	6	251297	251302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483584
5022	NC_017044	CAT	2	6	251340	251345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483584
5023	NC_017044	TTC	2	6	251395	251400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483584
5024	NC_017044	T	7	7	251416	251422	0 %	100 %	0 %	0 %	383483584
5025	NC_017044	TG	3	6	251560	251565	0 %	50 %	50 %	0 %	383483584
5026	NC_017044	TAA	2	6	251599	251604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483584
5027	NC_017044	AT	3	6	251772	251777	50 %	50 %	0 %	0 %	383483585
5028	NC_017044	TAA	2	6	251792	251797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483585
5029	NC_017044	TTCT	2	8	251803	251810	0 %	75 %	0 %	25 %	383483585
5030	NC_017044	TA	3	6	251837	251842	50 %	50 %	0 %	0 %	383483585
5031	NC_017044	AAT	2	6	251860	251865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483585
5032	NC_017044	ATC	2	6	251921	251926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483585
5033	NC_017044	TAAAG	2	10	251973	251982	60 %	20 %	20 %	0 %	383483585
5034	NC_017044	CAA	2	6	251990	251995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383483585
5035	NC_017044	CTA	2	6	252005	252010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483585
5036	NC_017044	A	7	7	252014	252020	100 %	0 %	0 %	0 %	383483585
5037	NC_017044	AT	3	6	252039	252044	50 %	50 %	0 %	0 %	383483585
5038	NC_017044	TTAG	2	8	252052	252059	25 %	50 %	25 %	0 %	383483585
5039	NC_017044	AATT	2	8	252065	252072	50 %	50 %	0 %	0 %	383483585
5040	NC_017044	AGC	2	6	252198	252203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483585
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5042	NC_017044	AGTTA	2	10	252248	252257	40 %	40 %	20 %	0 %	383483585
5043	NC_017044	ATTTT	2	10	252262	252271	20 %	80 %	0 %	0 %	383483586
5044	NC_017044	ATT	2	6	252286	252291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483586
5045	NC_017044	TAA	2	6	252297	252302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483586
5046	NC_017044	TA	3	6	252350	252355	50 %	50 %	0 %	0 %	383483586
5047	NC_017044	A	6	6	252357	252362	100 %	0 %	0 %	0 %	383483586
5048	NC_017044	T	7	7	252463	252469	0 %	100 %	0 %	0 %	383483586
5049	NC_017044	AATT	2	8	252480	252487	50 %	50 %	0 %	0 %	383483586
5050	NC_017044	TA	3	6	252548	252553	50 %	50 %	0 %	0 %	383483586
5051	NC_017044	GAA	2	6	252575	252580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483586
5052	NC_017044	T	6	6	252608	252613	0 %	100 %	0 %	0 %	383483586
5053	NC_017044	GAA	2	6	252620	252625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483586
5054	NC_017044	AGC	2	6	252631	252636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483586
5055	NC_017044	ATG	3	9	252651	252659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483586
5056	NC_017044	ATT	2	6	252677	252682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483586
5057	NC_017044	A	6	6	252696	252701	100 %	0 %	0 %	0 %	383483586
5058	NC_017044	TAA	2	6	252703	252708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483586
5059	NC_017044	AAG	2	6	252720	252725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483586
5060	NC_017044	AAAT	3	12	252780	252791	75 %	25 %	0 %	0 %	383483586
5061	NC_017044	AT	3	6	252794	252799	50 %	50 %	0 %	0 %	383483586
5062	NC_017044	ACG	2	6	252807	252812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483586
5063	NC_017044	ACG	2	6	252831	252836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483586
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5065	NC_017044	AT	3	6	252933	252938	50 %	50 %	0 %	0 %	383483586
5066	NC_017044	A	7	7	252940	252946	100 %	0 %	0 %	0 %	383483586
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5070	NC_017044	TA	4	8	253002	253009	50 %	50 %	0 %	0 %	383483586
5071	NC_017044	A	6	6	253024	253029	100 %	0 %	0 %	0 %	383483586
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5075	NC_017044	AT	3	6	253490	253495	50 %	50 %	0 %	0 %	383483587
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5082	NC_017044	CAT	2	6	253620	253625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483587
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5091	NC_017044	TAAG	2	8	253906	253913	50 %	25 %	25 %	0 %	383483587
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5097	NC_017044	CATG	2	8	254606	254613	25 %	25 %	25 %	25 %	383483588
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5104	NC_017044	T	6	6	254799	254804	0 %	100 %	0 %	0 %	383483588
5105	NC_017044	CTT	2	6	254806	254811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483588
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5107	NC_017044	TAC	2	6	254938	254943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483588
5108	NC_017044	AGA	2	6	254984	254989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483588
5109	NC_017044	A	7	7	254989	254995	100 %	0 %	0 %	0 %	383483588
5110	NC_017044	T	6	6	255045	255050	0 %	100 %	0 %	0 %	383483588
5111	NC_017044	GCG	2	6	255081	255086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383483588
5112	NC_017044	TA	3	6	255104	255109	50 %	50 %	0 %	0 %	383483588
5113	NC_017044	TTTA	2	8	255121	255128	25 %	75 %	0 %	0 %	383483588
5114	NC_017044	TAC	2	6	255212	255217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483588
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5118	NC_017044	AT	3	6	255307	255312	50 %	50 %	0 %	0 %	383483588
5119	NC_017044	GAA	2	6	255506	255511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483589
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5121	NC_017044	TAT	3	9	255565	255573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483589
5122	NC_017044	TAA	2	6	255595	255600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483589
5123	NC_017044	ATTAT	2	10	255764	255773	40 %	60 %	0 %	0 %	383483589
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5493	NC_017044	AGC	2	6	278229	278234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483616
5494	NC_017044	AAT	2	6	278259	278264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483616
5495	NC_017044	TCT	3	9	278644	278652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483617
5496	NC_017044	AGATG	2	10	278676	278685	40 %	20 %	40 %	0 %	383483617
5497	NC_017044	TATCT	2	10	278690	278699	20 %	60 %	0 %	20 %	383483617
5498	NC_017044	AGTA	2	8	278721	278728	50 %	25 %	25 %	0 %	383483617
5499	NC_017044	CATG	2	8	278787	278794	25 %	25 %	25 %	25 %	383483617
5500	NC_017044	GATG	2	8	278967	278974	25 %	25 %	50 %	0 %	383483617

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