MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 25017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017044	AAGC	2	8	224575	224582	50 %	0 %	25 %	25 %	383483556
4502	NC_017044	CAT	2	6	224650	224655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483556
4503	NC_017044	AT	3	6	224698	224703	50 %	50 %	0 %	0 %	383483556
4504	NC_017044	AAAT	2	8	224801	224808	75 %	25 %	0 %	0 %	383483556
4505	NC_017044	ACT	2	6	224820	224825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483556
4506	NC_017044	TGC	2	6	224885	224890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483556
4507	NC_017044	TTCT	2	8	224938	224945	0 %	75 %	0 %	25 %	383483556
4508	NC_017044	AAT	2	6	225122	225127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483556
4509	NC_017044	TTC	2	6	225137	225142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483556
4510	NC_017044	ATT	2	6	225179	225184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483556
4511	NC_017044	T	6	6	225278	225283	0 %	100 %	0 %	0 %	383483556
4512	NC_017044	TA	3	6	225305	225310	50 %	50 %	0 %	0 %	383483556
4513	NC_017044	CCG	2	6	225318	225323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383483556
4514	NC_017044	CGA	2	6	225382	225387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483556
4515	NC_017044	ATA	2	6	225562	225567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483556
4516	NC_017044	TAC	2	6	225583	225588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483556
4517	NC_017044	TA	3	6	225614	225619	50 %	50 %	0 %	0 %	383483556
4518	NC_017044	AT	3	6	225678	225683	50 %	50 %	0 %	0 %	383483556
4519	NC_017044	A	8	8	225767	225774	100 %	0 %	0 %	0 %	383483556
4520	NC_017044	TAT	2	6	226239	226244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483557
4521	NC_017044	A	8	8	226269	226276	100 %	0 %	0 %	0 %	383483557
4522	NC_017044	GACC	2	8	226305	226312	25 %	0 %	25 %	50 %	383483557
4523	NC_017044	TCATAA	2	12	226317	226328	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383483557
4524	NC_017044	CCA	2	6	226416	226421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383483557
4525	NC_017044	TAATAT	2	12	226422	226433	50 %	50 %	0 %	0 %	383483557
4526	NC_017044	CAT	2	6	226459	226464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483557
4527	NC_017044	GAA	2	6	226547	226552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483557
4528	NC_017044	AAG	2	6	226559	226564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483557
4529	NC_017044	ATA	2	6	226764	226769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483558
4530	NC_017044	AGA	2	6	226828	226833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483558
4531	NC_017044	TA	4	8	226837	226844	50 %	50 %	0 %	0 %	383483558
4532	NC_017044	ACA	2	6	226875	226880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383483558
4533	NC_017044	CTT	2	6	226969	226974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483558
4534	NC_017044	AAT	2	6	227011	227016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483558
4535	NC_017044	T	7	7	227097	227103	0 %	100 %	0 %	0 %	383483558
4536	NC_017044	TAT	2	6	227125	227130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483558
4537	NC_017044	ATC	2	6	227170	227175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483558
4538	NC_017044	CAT	2	6	227180	227185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483558
4539	NC_017044	TAC	2	6	227260	227265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483558
4540	NC_017044	TAT	3	9	227304	227312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483558
4541	NC_017044	A	6	6	227330	227335	100 %	0 %	0 %	0 %	383483558
4542	NC_017044	TAA	2	6	227383	227388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483558
4543	NC_017044	A	6	6	227437	227442	100 %	0 %	0 %	0 %	383483558
4544	NC_017044	AT	3	6	227447	227452	50 %	50 %	0 %	0 %	383483558
4545	NC_017044	TA	3	6	227489	227494	50 %	50 %	0 %	0 %	383483558
4546	NC_017044	GTG	2	6	227498	227503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383483558
4547	NC_017044	TGC	2	6	227816	227821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483559
4548	NC_017044	AGG	2	6	227917	227922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383483559
4549	NC_017044	TTA	2	6	227923	227928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483559
4550	NC_017044	GAT	2	6	227948	227953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483559
4551	NC_017044	GAT	2	6	227975	227980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483559
4552	NC_017044	TAAATT	2	12	228016	228027	50 %	50 %	0 %	0 %	383483559
4553	NC_017044	GCC	2	6	228032	228037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383483559
4554	NC_017044	AGT	2	6	228087	228092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483559
4555	NC_017044	GCTT	2	8	228095	228102	0 %	50 %	25 %	25 %	383483559
4556	NC_017044	ATG	2	6	228286	228291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483559
4557	NC_017044	GAT	2	6	228335	228340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483559
4558	NC_017044	GGA	2	6	228341	228346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383483559
4559	NC_017044	A	6	6	228359	228364	100 %	0 %	0 %	0 %	383483559
4560	NC_017044	AGT	2	6	228422	228427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483559
4561	NC_017044	AGT	2	6	228435	228440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483559
4562	NC_017044	G	6	6	228500	228505	0 %	0 %	100 %	0 %	383483559
4563	NC_017044	GCA	2	6	228507	228512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483559
4564	NC_017044	AT	3	6	228524	228529	50 %	50 %	0 %	0 %	383483559
4565	NC_017044	AGA	2	6	228581	228586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483559
4566	NC_017044	TTG	2	6	228643	228648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383483559
4567	NC_017044	AGC	2	6	228653	228658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483559
4568	NC_017044	TTG	2	6	228664	228669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383483559
4569	NC_017044	AGA	2	6	228674	228679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483559
4570	NC_017044	A	6	6	228685	228690	100 %	0 %	0 %	0 %	383483559
4571	NC_017044	A	6	6	228704	228709	100 %	0 %	0 %	0 %	383483559
4572	NC_017044	A	8	8	228755	228762	100 %	0 %	0 %	0 %	383483559
4573	NC_017044	ATCA	2	8	228826	228833	50 %	25 %	0 %	25 %	383483559
4574	NC_017044	AAT	2	6	228848	228853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483559
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4578	NC_017044	A	6	6	229017	229022	100 %	0 %	0 %	0 %	383483559
4579	NC_017044	CAA	2	6	229260	229265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383483560
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4581	NC_017044	AGT	2	6	229406	229411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483560
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4586	NC_017044	ATAG	2	8	230296	230303	50 %	25 %	25 %	0 %	383483561
4587	NC_017044	GGA	2	6	230306	230311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383483561
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4589	NC_017044	TCT	2	6	230342	230347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483561
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4591	NC_017044	ACA	2	6	230361	230366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383483561
4592	NC_017044	TAC	2	6	230440	230445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483561
4593	NC_017044	AGA	2	6	230574	230579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483562
4594	NC_017044	CAA	2	6	230596	230601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383483562
4595	NC_017044	GAA	2	6	230801	230806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483563
4596	NC_017044	TA	3	6	230841	230846	50 %	50 %	0 %	0 %	383483563
4597	NC_017044	T	6	6	230868	230873	0 %	100 %	0 %	0 %	383483563
4598	NC_017044	AGTC	2	8	230930	230937	25 %	25 %	25 %	25 %	383483563
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4602	NC_017044	T	6	6	231178	231183	0 %	100 %	0 %	0 %	383483565
4603	NC_017044	T	6	6	231190	231195	0 %	100 %	0 %	0 %	383483565
4604	NC_017044	TTCT	2	8	231376	231383	0 %	75 %	0 %	25 %	383483565
4605	NC_017044	TCT	2	6	231467	231472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483565
4606	NC_017044	T	6	6	231485	231490	0 %	100 %	0 %	0 %	383483565
4607	NC_017044	TA	3	6	231495	231500	50 %	50 %	0 %	0 %	383483565
4608	NC_017044	ATT	2	6	231508	231513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483565
4609	NC_017044	A	6	6	231534	231539	100 %	0 %	0 %	0 %	383483565
4610	NC_017044	T	8	8	231558	231565	0 %	100 %	0 %	0 %	383483565
4611	NC_017044	ATT	2	6	231566	231571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483565
4612	NC_017044	TAA	2	6	231573	231578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483565
4613	NC_017044	ATTAA	2	10	231584	231593	60 %	40 %	0 %	0 %	383483565
4614	NC_017044	TTTA	2	8	231598	231605	25 %	75 %	0 %	0 %	383483565
4615	NC_017044	TTTG	2	8	231904	231911	0 %	75 %	25 %	0 %	383483566
4616	NC_017044	ATT	2	6	232014	232019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483566
4617	NC_017044	AT	3	6	232028	232033	50 %	50 %	0 %	0 %	383483566
4618	NC_017044	T	8	8	232042	232049	0 %	100 %	0 %	0 %	383483566
4619	NC_017044	AAT	2	6	232094	232099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483566
4620	NC_017044	ATT	2	6	232122	232127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483566
4621	NC_017044	CAT	2	6	232165	232170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483566
4622	NC_017044	GCC	2	6	232200	232205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383483566
4623	NC_017044	A	7	7	232256	232262	100 %	0 %	0 %	0 %	383483566
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