MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia montanensis str. OSU 85-930 chromosome

Total Repeats: 24861

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017043	A	6	6	25662	25667	100 %	0 %	0 %	0 %	383482149
502	NC_017043	AAAT	2	8	25682	25689	75 %	25 %	0 %	0 %	383482149
503	NC_017043	ATT	2	6	25702	25707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482149
504	NC_017043	TAA	2	6	26438	26443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482150
505	NC_017043	ATTT	2	8	26513	26520	25 %	75 %	0 %	0 %	383482150
506	NC_017043	TAA	2	6	26527	26532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482150
507	NC_017043	ATT	2	6	26555	26560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482150
508	NC_017043	TTAGT	2	10	26587	26596	20 %	60 %	20 %	0 %	383482150
509	NC_017043	CAG	2	6	26635	26640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383482150
510	NC_017043	TGCT	2	8	26737	26744	0 %	50 %	25 %	25 %	383482150
511	NC_017043	GTC	2	6	26752	26757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482150
512	NC_017043	T	6	6	26780	26785	0 %	100 %	0 %	0 %	383482150
513	NC_017043	AT	3	6	26797	26802	50 %	50 %	0 %	0 %	383482151
514	NC_017043	ATA	2	6	26816	26821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482151
515	NC_017043	AAC	2	6	26836	26841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383482151
516	NC_017043	A	7	7	26873	26879	100 %	0 %	0 %	0 %	383482151
517	NC_017043	TTC	2	6	27028	27033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482151
518	NC_017043	CTA	2	6	27079	27084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482151
519	NC_017043	ATT	2	6	27090	27095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482151
520	NC_017043	TAT	2	6	27100	27105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482151
521	NC_017043	ATTC	2	8	27139	27146	25 %	50 %	0 %	25 %	383482151
522	NC_017043	CAA	2	6	27181	27186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383482151
523	NC_017043	ATA	2	6	27187	27192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482151
524	NC_017043	ATT	2	6	27372	27377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482152
525	NC_017043	T	6	6	27400	27405	0 %	100 %	0 %	0 %	383482152
526	NC_017043	ATT	2	6	27425	27430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482152
527	NC_017043	TAT	2	6	27475	27480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482152
528	NC_017043	ATT	2	6	27496	27501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482152
529	NC_017043	AAT	2	6	27510	27515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482152
530	NC_017043	TAA	2	6	27596	27601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482152
531	NC_017043	AT	3	6	27602	27607	50 %	50 %	0 %	0 %	383482152
532	NC_017043	CTA	2	6	27631	27636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482152
533	NC_017043	AT	3	6	27637	27642	50 %	50 %	0 %	0 %	383482152
534	NC_017043	TAT	2	6	27675	27680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482152
535	NC_017043	TTAA	2	8	27762	27769	50 %	50 %	0 %	0 %	383482152
536	NC_017043	T	7	7	27805	27811	0 %	100 %	0 %	0 %	383482152
537	NC_017043	T	6	6	27817	27822	0 %	100 %	0 %	0 %	383482152
538	NC_017043	A	6	6	27828	27833	100 %	0 %	0 %	0 %	383482152
539	NC_017043	CGT	2	6	27863	27868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482152
540	NC_017043	ATGA	2	8	28027	28034	50 %	25 %	25 %	0 %	383482153
541	NC_017043	ATGATA	2	12	28040	28051	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383482153
542	NC_017043	T	6	6	28070	28075	0 %	100 %	0 %	0 %	383482153
543	NC_017043	GTA	2	6	28094	28099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482153
544	NC_017043	TAA	2	6	28164	28169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482153
545	NC_017043	AGAT	2	8	28178	28185	50 %	25 %	25 %	0 %	383482153
546	NC_017043	TTC	2	6	28248	28253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482153
547	NC_017043	ATT	2	6	28273	28278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482153
548	NC_017043	TAG	2	6	28374	28379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482153
549	NC_017043	ACT	2	6	28410	28415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482153
550	NC_017043	TTA	2	6	28448	28453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482153
551	NC_017043	CTA	2	6	28457	28462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482153
552	NC_017043	ACT	2	6	28483	28488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482153
553	NC_017043	TTATT	2	10	28491	28500	20 %	80 %	0 %	0 %	383482153
554	NC_017043	ATT	2	6	28574	28579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482153
555	NC_017043	TTCA	2	8	29398	29405	25 %	50 %	0 %	25 %	383482154
556	NC_017043	CAG	2	6	29415	29420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383482154
557	NC_017043	ATTG	2	8	29427	29434	25 %	50 %	25 %	0 %	383482154
558	NC_017043	AT	3	6	29444	29449	50 %	50 %	0 %	0 %	383482154
559	NC_017043	ATTTA	2	10	29506	29515	40 %	60 %	0 %	0 %	383482154
560	NC_017043	GTG	2	6	29807	29812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383482155
561	NC_017043	TTA	2	6	29822	29827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482155
562	NC_017043	TCA	2	6	29830	29835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482155
563	NC_017043	T	6	6	29838	29843	0 %	100 %	0 %	0 %	383482155
564	NC_017043	AGCA	2	8	29847	29854	50 %	0 %	25 %	25 %	383482155
565	NC_017043	TCT	2	6	29887	29892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482155
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569	NC_017043	CTA	2	6	30060	30065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482156
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572	NC_017043	ATTA	2	8	30181	30188	50 %	50 %	0 %	0 %	383482156
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593	NC_017043	AAG	2	6	31079	31084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482158
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598	NC_017043	AAT	2	6	31282	31287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482158
599	NC_017043	T	7	7	31295	31301	0 %	100 %	0 %	0 %	383482158
600	NC_017043	ATA	2	6	31311	31316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482158
601	NC_017043	TATTT	2	10	31352	31361	20 %	80 %	0 %	0 %	383482158
602	NC_017043	TCA	2	6	31459	31464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482159
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609	NC_017043	TAG	2	6	31667	31672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482159
610	NC_017043	TAC	3	9	31752	31760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482159
611	NC_017043	T	6	6	31773	31778	0 %	100 %	0 %	0 %	383482159
612	NC_017043	GTA	2	6	31841	31846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482159
613	NC_017043	AAAT	2	8	31847	31854	75 %	25 %	0 %	0 %	383482159
614	NC_017043	ACTC	2	8	31888	31895	25 %	25 %	0 %	50 %	383482159
615	NC_017043	GCAA	2	8	31908	31915	50 %	0 %	25 %	25 %	383482159
616	NC_017043	A	6	6	31990	31995	100 %	0 %	0 %	0 %	383482159
617	NC_017043	GAG	2	6	32002	32007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383482159
618	NC_017043	TTGT	2	8	32045	32052	0 %	75 %	25 %	0 %	383482159
619	NC_017043	TAA	2	6	32070	32075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482159
620	NC_017043	TAG	2	6	32114	32119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482159
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625	NC_017043	ATG	2	6	32254	32259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482159
626	NC_017043	TGC	2	6	32262	32267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482159
627	NC_017043	CTC	2	6	32297	32302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383482159
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629	NC_017043	GAA	2	6	32338	32343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482159
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