MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia montanensis str. OSU 85-930 chromosome

Total Repeats: 24861

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017043	GCC	2	6	278735	278740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383482402
5502	NC_017043	TGA	2	6	278829	278834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482402
5503	NC_017043	TATCT	2	10	278849	278858	20 %	60 %	0 %	20 %	383482402
5504	NC_017043	AT	3	6	278863	278868	50 %	50 %	0 %	0 %	383482402
5505	NC_017043	CTA	2	6	278892	278897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482402
5506	NC_017043	TTA	2	6	278899	278904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482402
5507	NC_017043	TGT	2	6	278948	278953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383482402
5508	NC_017043	ATC	2	6	279002	279007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482402
5509	NC_017043	AGA	3	9	279017	279025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482402
5510	NC_017043	ATA	3	9	279117	279125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482402
5511	NC_017043	CTA	2	6	280397	280402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482403
5512	NC_017043	AGA	3	9	280410	280418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482403
5513	NC_017043	AAT	2	6	280431	280436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482403
5514	NC_017043	ATGA	2	8	280486	280493	50 %	25 %	25 %	0 %	383482403
5515	NC_017043	TGC	2	6	280503	280508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482403
5516	NC_017043	TA	3	6	280521	280526	50 %	50 %	0 %	0 %	383482403
5517	NC_017043	T	6	6	280533	280538	0 %	100 %	0 %	0 %	383482403
5518	NC_017043	T	7	7	280565	280571	0 %	100 %	0 %	0 %	383482403
5519	NC_017043	TAA	2	6	280600	280605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482403
5520	NC_017043	AGC	2	6	281076	281081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383482404
5521	NC_017043	ATATTT	2	12	282242	282253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482405
5522	NC_017043	TACCC	2	10	282290	282299	20 %	20 %	0 %	60 %	383482405
5523	NC_017043	TAG	2	6	282304	282309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482405
5524	NC_017043	T	6	6	282440	282445	0 %	100 %	0 %	0 %	383482405
5525	NC_017043	TCT	2	6	282462	282467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482405
5526	NC_017043	AATA	2	8	282512	282519	75 %	25 %	0 %	0 %	383482405
5527	NC_017043	ATT	2	6	282530	282535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482405
5528	NC_017043	TA	3	6	282640	282645	50 %	50 %	0 %	0 %	383482405
5529	NC_017043	TAGT	2	8	282673	282680	25 %	50 %	25 %	0 %	383482405
5530	NC_017043	AT	3	6	282684	282689	50 %	50 %	0 %	0 %	383482405
5531	NC_017043	CTA	2	6	282714	282719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482405
5532	NC_017043	CTT	3	9	282724	282732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482405
5533	NC_017043	TA	4	8	282739	282746	50 %	50 %	0 %	0 %	383482405
5534	NC_017043	TCT	2	6	282780	282785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482405
5535	NC_017043	CAT	2	6	282793	282798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482405
5536	NC_017043	TACT	2	8	282802	282809	25 %	50 %	0 %	25 %	383482405
5537	NC_017043	A	6	6	282832	282837	100 %	0 %	0 %	0 %	383482405
5538	NC_017043	TCT	2	6	282876	282881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482405
5539	NC_017043	AGT	2	6	282935	282940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482405
5540	NC_017043	TAA	2	6	282973	282978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482405
5541	NC_017043	TAT	2	6	282998	283003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482405
5542	NC_017043	TCAT	2	8	283014	283021	25 %	50 %	0 %	25 %	383482405
5543	NC_017043	CAT	2	6	283024	283029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482405
5544	NC_017043	TAA	2	6	283037	283042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482405
5545	NC_017043	TGC	2	6	283080	283085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482405
5546	NC_017043	ATC	2	6	283107	283112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482405
5547	NC_017043	TGG	2	6	283116	283121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383482405
5548	NC_017043	TCA	2	6	283200	283205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482405
5549	NC_017043	TATC	2	8	283270	283277	25 %	50 %	0 %	25 %	383482405
5550	NC_017043	CTT	2	6	283337	283342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482405
5551	NC_017043	ATA	2	6	283440	283445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482405
5552	NC_017043	ACCT	2	8	283492	283499	25 %	25 %	0 %	50 %	383482405
5553	NC_017043	AAT	2	6	283508	283513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482405
5554	NC_017043	T	6	6	283561	283566	0 %	100 %	0 %	0 %	383482405
5555	NC_017043	TTTA	2	8	283568	283575	25 %	75 %	0 %	0 %	383482405
5556	NC_017043	TTC	2	6	283589	283594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482405
5557	NC_017043	CAA	2	6	283618	283623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383482405
5558	NC_017043	CAT	2	6	283672	283677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482405
5559	NC_017043	T	6	6	283685	283690	0 %	100 %	0 %	0 %	383482405
5560	NC_017043	TCA	2	6	283707	283712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482405
5561	NC_017043	TAT	2	6	283732	283737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482405
5562	NC_017043	TA	4	8	283765	283772	50 %	50 %	0 %	0 %	383482405
5563	NC_017043	AAT	2	6	283840	283845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482405
5564	NC_017043	TCA	2	6	283968	283973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482405
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5568	NC_017043	ATT	2	6	284405	284410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482405
5569	NC_017043	GGC	2	6	284438	284443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383482405
5570	NC_017043	A	6	6	284496	284501	100 %	0 %	0 %	0 %	383482405
5571	NC_017043	ACA	2	6	284559	284564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383482405
5572	NC_017043	TAAG	2	8	284591	284598	50 %	25 %	25 %	0 %	383482405
5573	NC_017043	GCC	2	6	284672	284677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383482405
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5577	NC_017043	T	7	7	284885	284891	0 %	100 %	0 %	0 %	383482405
5578	NC_017043	T	7	7	284921	284927	0 %	100 %	0 %	0 %	383482405
5579	NC_017043	TGA	2	6	285340	285345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482406
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5582	NC_017043	TAA	2	6	285388	285393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482406
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5584	NC_017043	CTT	2	6	285432	285437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482406
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5586	NC_017043	CAA	2	6	285485	285490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383482406
5587	NC_017043	TGA	2	6	285538	285543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482406
5588	NC_017043	ATA	2	6	285549	285554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482406
5589	NC_017043	AAG	2	6	285621	285626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482406
5590	NC_017043	AGA	2	6	285679	285684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482406
5591	NC_017043	AGCTTC	2	12	285700	285711	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383482406
5592	NC_017043	CGG	2	6	285715	285720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383482406
5593	NC_017043	CTA	2	6	285737	285742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482406
5594	NC_017043	AAAG	2	8	285775	285782	75 %	0 %	25 %	0 %	383482406
5595	NC_017043	A	6	6	285860	285865	100 %	0 %	0 %	0 %	383482406
5596	NC_017043	CAA	2	6	285879	285884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383482406
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5599	NC_017043	AT	3	6	285940	285945	50 %	50 %	0 %	0 %	383482406
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5602	NC_017043	GA	3	6	286317	286322	50 %	0 %	50 %	0 %	383482407
5603	NC_017043	GTTT	2	8	286323	286330	0 %	75 %	25 %	0 %	383482407
5604	NC_017043	CTA	2	6	286350	286355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482407
5605	NC_017043	ATT	2	6	286372	286377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482407
5606	NC_017043	TAGTA	2	10	286378	286387	40 %	40 %	20 %	0 %	383482407
5607	NC_017043	AGC	2	6	286450	286455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383482407
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5609	NC_017043	GCA	2	6	286475	286480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383482407
5610	NC_017043	CAA	2	6	286495	286500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383482407
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5612	NC_017043	TCA	2	6	286652	286657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482408
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5620	NC_017043	CTTTT	2	10	286876	286885	0 %	80 %	0 %	20 %	383482408
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5993	NC_017043	TTA	2	6	304907	304912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482427
5994	NC_017043	TTC	2	6	304933	304938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482427
5995	NC_017043	A	8	8	304953	304960	100 %	0 %	0 %	0 %	383482427
5996	NC_017043	CA	3	6	305005	305010	50 %	0 %	0 %	50 %	383482427
5997	NC_017043	AAG	2	6	305334	305339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482428
5998	NC_017043	GAA	2	6	305367	305372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482428
5999	NC_017043	CGC	2	6	305384	305389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383482428
6000	NC_017043	CAC	2	6	305411	305416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383482428

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