MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia rhipicephali str. 3-7-female6-CWPP chromosome

Total Repeats: 15044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017042	CGC	2	6	225	230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383480871
2	NC_017042	ATC	2	6	268	273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480871
3	NC_017042	ACA	2	6	356	361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383480871
4	NC_017042	TAT	2	6	372	377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480872
5	NC_017042	TAA	2	6	448	453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480872
6	NC_017042	AAT	2	6	593	598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480872
7	NC_017042	AGA	2	6	599	604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383480872
8	NC_017042	TAT	2	6	625	630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480872
9	NC_017042	TAA	2	6	646	651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480872
10	NC_017042	ATA	2	6	664	669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480872
11	NC_017042	ATA	2	6	673	678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480872
12	NC_017042	CCA	2	6	710	715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383480872
13	NC_017042	TAG	2	6	817	822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480872
14	NC_017042	TGC	2	6	851	856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383480872
15	NC_017042	AAG	2	6	886	891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383480872
16	NC_017042	ATC	2	6	978	983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480872
17	NC_017042	TAT	2	6	1013	1018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480872
18	NC_017042	ATA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480872
19	NC_017042	TCA	2	6	1108	1113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480873
20	NC_017042	ACT	2	6	1221	1226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480873
21	NC_017042	CAT	2	6	1355	1360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480873
22	NC_017042	AGA	2	6	1377	1382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383480873
23	NC_017042	AAT	2	6	1410	1415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480873
24	NC_017042	TAT	3	9	1451	1459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480873
25	NC_017042	AAT	2	6	1470	1475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480873
26	NC_017042	TTA	2	6	1573	1578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480873
27	NC_017042	CTT	2	6	1586	1591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383480873
28	NC_017042	TTC	2	6	1624	1629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383480874
29	NC_017042	TGG	2	6	1646	1651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383480874
30	NC_017042	ATT	2	6	1655	1660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480874
31	NC_017042	TTA	2	6	1826	1831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480874
32	NC_017042	CTA	2	6	1878	1883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480874
33	NC_017042	AAG	2	6	1914	1919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383480874
34	NC_017042	AAT	2	6	1952	1957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480874
35	NC_017042	AAT	2	6	1974	1979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480874
36	NC_017042	AAT	2	6	2031	2036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480874
37	NC_017042	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480874
38	NC_017042	AGT	2	6	2137	2142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480874
39	NC_017042	GAA	2	6	2192	2197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383480874
40	NC_017042	GAT	4	12	2280	2291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480874
41	NC_017042	CGG	2	6	2293	2298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383480874
42	NC_017042	TAA	2	6	2328	2333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480874
43	NC_017042	AGG	2	6	2334	2339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383480874
44	NC_017042	AAG	2	6	2367	2372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383480874
45	NC_017042	AAC	2	6	2395	2400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383480874
46	NC_017042	GTA	2	6	2438	2443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480874
47	NC_017042	TTA	2	6	2466	2471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480874
48	NC_017042	TAT	2	6	2705	2710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480875
49	NC_017042	CTT	2	6	2797	2802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383480875
50	NC_017042	TTG	2	6	2858	2863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383480875
51	NC_017042	TGG	2	6	2898	2903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383480875
52	NC_017042	AGA	2	6	2935	2940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383480875
53	NC_017042	GTA	2	6	2987	2992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480875
54	NC_017042	TAA	2	6	3042	3047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480875
55	NC_017042	ACA	2	6	3114	3119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383480875
56	NC_017042	GAT	2	6	3443	3448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480876
57	NC_017042	CAT	2	6	3491	3496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480876
58	NC_017042	ATA	2	6	3573	3578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480876
59	NC_017042	CGG	2	6	3598	3603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383480876
60	NC_017042	TAA	2	6	3885	3890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480877
61	NC_017042	ACT	2	6	3937	3942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480877
62	NC_017042	GCG	2	6	4013	4018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383480877
63	NC_017042	TAA	2	6	4134	4139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480877
64	NC_017042	AGG	2	6	4209	4214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383480877
65	NC_017042	TAA	2	6	4251	4256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480877
66	NC_017042	ATT	2	6	4267	4272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480877
67	NC_017042	CAA	2	6	4309	4314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383480877
68	NC_017042	TTA	2	6	4328	4333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480877
69	NC_017042	TAA	2	6	4394	4399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480877
70	NC_017042	CAC	2	6	4516	4521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383480877
71	NC_017042	ATT	2	6	6233	6238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480879
72	NC_017042	TAA	2	6	6276	6281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480879
73	NC_017042	CAT	2	6	6338	6343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480879
74	NC_017042	ATT	2	6	6363	6368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480879
75	NC_017042	TAA	2	6	6372	6377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480879
76	NC_017042	TTA	2	6	6403	6408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480879
77	NC_017042	AAT	2	6	6442	6447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480879
78	NC_017042	TCT	2	6	6510	6515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383480880
79	NC_017042	TTC	2	6	6600	6605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383480880
80	NC_017042	TTC	2	6	6626	6631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383480880
81	NC_017042	TAA	2	6	6638	6643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480880
82	NC_017042	AAT	2	6	6974	6979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480881
83	NC_017042	CAA	2	6	7042	7047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383480881
84	NC_017042	TTA	2	6	7071	7076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480881
85	NC_017042	TCG	2	6	7080	7085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383480881
86	NC_017042	TCA	2	6	7107	7112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480881
87	NC_017042	CAC	2	6	7180	7185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383480881
88	NC_017042	GTA	2	6	7194	7199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480881
89	NC_017042	TCA	3	9	7306	7314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480881
90	NC_017042	TAT	2	6	7363	7368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480881
91	NC_017042	TTA	2	6	7432	7437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480881
92	NC_017042	GAG	2	6	7588	7593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383480881
93	NC_017042	ATC	2	6	7728	7733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480881
94	NC_017042	TTG	2	6	7815	7820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383480881
95	NC_017042	TAT	2	6	7849	7854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480881
96	NC_017042	GAC	2	6	7894	7899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383480881
97	NC_017042	TTC	2	6	7925	7930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383480881
98	NC_017042	TTC	2	6	7943	7948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383480881
99	NC_017042	CCG	2	6	7974	7979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383480881
100	NC_017042	AAT	2	6	8006	8011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480881
101	NC_017042	TTC	2	6	8033	8038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383480881
102	NC_017042	TAT	2	6	8107	8112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480881
103	NC_017042	TGA	2	6	8118	8123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480881
104	NC_017042	TCA	2	6	8139	8144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480881
105	NC_017042	TAT	2	6	8552	8557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480881
106	NC_017042	GTT	2	6	8569	8574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383480881
107	NC_017042	TTA	2	6	8575	8580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480881
108	NC_017042	AGA	2	6	8741	8746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383480881
109	NC_017042	TAC	2	6	8749	8754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480881
110	NC_017042	CGG	2	6	8987	8992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383480881
111	NC_017042	TAT	2	6	9112	9117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480881
112	NC_017042	CTT	2	6	9119	9124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383480881
113	NC_017042	ATC	2	6	9146	9151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480881
114	NC_017042	ATA	2	6	9376	9381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480881
115	NC_017042	AGT	2	6	9440	9445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480881
116	NC_017042	AGA	2	6	9593	9598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383480881
117	NC_017042	AAC	2	6	9626	9631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383480881
118	NC_017042	CAA	2	6	9927	9932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383480882
119	NC_017042	AGT	2	6	9991	9996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480882
120	NC_017042	TGT	2	6	10021	10026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383480882
121	NC_017042	ATT	2	6	10159	10164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480882
122	NC_017042	TAA	2	6	10180	10185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480882
123	NC_017042	GAC	2	6	10262	10267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383480882
124	NC_017042	AAT	2	6	10314	10319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480883
125	NC_017042	CTA	2	6	10346	10351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480883
126	NC_017042	ATG	2	6	10355	10360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480883
127	NC_017042	GGT	2	6	10429	10434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383480883
128	NC_017042	ATT	2	6	10664	10669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480883
129	NC_017042	GGC	2	6	10771	10776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383480883
130	NC_017042	TAA	2	6	10929	10934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480883
131	NC_017042	AGC	2	6	10989	10994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383480883
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139	NC_017042	CTT	2	6	11997	12002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383480886
140	NC_017042	CTT	2	6	12021	12026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383480886
141	NC_017042	AAT	2	6	12190	12195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480886
142	NC_017042	TTA	2	6	12227	12232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480886
143	NC_017042	TGA	2	6	12268	12273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480886
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153	NC_017042	ATT	2	6	13100	13105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480887
154	NC_017042	TAA	2	6	13341	13346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480888
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159	NC_017042	GAA	2	6	13969	13974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383480888
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162	NC_017042	TGA	2	6	14163	14168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480888
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166	NC_017042	TAA	2	6	14355	14360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480888
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