MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rhipicephali str. 3-7-female6-CWPP chromosome

Total Repeats: 24251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24002	NC_017042	ATT	2	6	1278208	1278213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482114
24003	NC_017042	TAC	2	6	1278270	1278275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482114
24004	NC_017042	ATT	2	6	1278289	1278294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482114
24005	NC_017042	TCG	2	6	1278332	1278337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482114
24006	NC_017042	CTA	2	6	1278414	1278419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482114
24007	NC_017042	CCA	2	6	1278449	1278454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383482114
24008	NC_017042	CTA	2	6	1278489	1278494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482114
24009	NC_017042	GCT	2	6	1278500	1278505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482114
24010	NC_017042	AAT	2	6	1278506	1278511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482114
24011	NC_017042	AT	3	6	1278510	1278515	50 %	50 %	0 %	0 %	383482114
24012	NC_017042	T	6	6	1278515	1278520	0 %	100 %	0 %	0 %	383482114
24013	NC_017042	ACTCCG	2	12	1278521	1278532	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	383482114
24014	NC_017042	ATA	2	6	1278751	1278756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482114
24015	NC_017042	ACC	3	9	1278769	1278777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383482114
24016	NC_017042	TAT	2	6	1278825	1278830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482114
24017	NC_017042	TCC	2	6	1278844	1278849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383482114
24018	NC_017042	TGC	2	6	1278892	1278897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482114
24019	NC_017042	ATT	2	6	1278952	1278957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482114
24020	NC_017042	TAT	2	6	1278969	1278974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482114
24021	NC_017042	CAC	2	6	1278988	1278993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383482114
24022	NC_017042	CTG	2	6	1279014	1279019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482114
24023	NC_017042	CTTGTA	2	12	1279065	1279076	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383482114
24024	NC_017042	TGC	2	6	1279108	1279113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482114
24025	NC_017042	ATT	2	6	1279168	1279173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482114
24026	NC_017042	TAT	2	6	1279185	1279190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482114
24027	NC_017042	CAC	2	6	1279204	1279209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383482114
24028	NC_017042	CTG	2	6	1279230	1279235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482114
24029	NC_017042	GCA	2	6	1279238	1279243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383482114
24030	NC_017042	GTA	2	6	1279259	1279264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482114
24031	NC_017042	TAA	2	6	1279269	1279274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482114
24032	NC_017042	ATTTAA	2	12	1279369	1279380	50 %	50 %	0 %	0 %	383482114
24033	NC_017042	TGCATT	2	12	1279432	1279443	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383482114
24034	NC_017042	GCA	2	6	1279463	1279468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383482114
24035	NC_017042	GTA	2	6	1279484	1279489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482114
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24037	NC_017042	ATTTAA	2	12	1279594	1279605	50 %	50 %	0 %	0 %	383482114
24038	NC_017042	ATCA	2	8	1279636	1279643	50 %	25 %	0 %	25 %	383482114
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24041	NC_017042	GTA	2	6	1279709	1279714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482114
24042	NC_017042	TAA	2	6	1279719	1279724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482114
24043	NC_017042	ATTTAA	2	12	1279819	1279830	50 %	50 %	0 %	0 %	383482114
24044	NC_017042	TGCATT	2	12	1279882	1279893	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383482114
24045	NC_017042	GCA	2	6	1279913	1279918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383482114
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24047	NC_017042	TAA	2	6	1279944	1279949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482114
24048	NC_017042	ATTTAA	2	12	1280044	1280055	50 %	50 %	0 %	0 %	383482114
24049	NC_017042	TGCATT	2	12	1280107	1280118	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383482114
24050	NC_017042	GCA	2	6	1280138	1280143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383482114
24051	NC_017042	GTA	2	6	1280159	1280164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482114
24052	NC_017042	TAA	2	6	1280169	1280174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482114
24053	NC_017042	ATTTAA	2	12	1280269	1280280	50 %	50 %	0 %	0 %	383482114
24054	NC_017042	TGCATT	2	12	1280332	1280343	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383482114
24055	NC_017042	GCA	2	6	1280363	1280368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383482114
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24058	NC_017042	ATTTAA	2	12	1280494	1280505	50 %	50 %	0 %	0 %	383482114
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24111	NC_017042	ATTA	2	8	1282988	1282995	50 %	50 %	0 %	0 %	383482115
24112	NC_017042	TAA	2	6	1283030	1283035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482115
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