MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rhipicephali str. 3-7-female6-CWPP chromosome

Total Repeats: 24251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_017042	CAA	2	6	285903	285908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383481135
5503	NC_017042	CTT	2	6	285933	285938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383481135
5504	NC_017042	ATA	2	6	286100	286105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481135
5505	NC_017042	TCT	2	6	286139	286144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383481135
5506	NC_017042	CTT	3	9	286182	286190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383481135
5507	NC_017042	AT	3	6	286515	286520	50 %	50 %	0 %	0 %	383481136
5508	NC_017042	CTT	2	6	286562	286567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383481136
5509	NC_017042	ATTT	2	8	286574	286581	25 %	75 %	0 %	0 %	383481136
5510	NC_017042	T	6	6	286579	286584	0 %	100 %	0 %	0 %	383481136
5511	NC_017042	AAT	2	6	286585	286590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481136
5512	NC_017042	CCTG	2	8	286632	286639	0 %	25 %	25 %	50 %	383481136
5513	NC_017042	CTAA	2	8	286669	286676	50 %	25 %	0 %	25 %	383481136
5514	NC_017042	ATT	2	6	287016	287021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481137
5515	NC_017042	TTA	2	6	287038	287043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481137
5516	NC_017042	TAC	2	6	287056	287061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383481137
5517	NC_017042	ATC	2	6	287066	287071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383481137
5518	NC_017042	ATG	2	6	287102	287107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481137
5519	NC_017042	TTC	2	6	287150	287155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383481137
5520	NC_017042	TCT	2	6	287165	287170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383481137
5521	NC_017042	TCTT	2	8	287237	287244	0 %	75 %	0 %	25 %	383481137
5522	NC_017042	CCGT	2	8	287280	287287	0 %	25 %	25 %	50 %	383481137
5523	NC_017042	GAT	2	6	287334	287339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481137
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5525	NC_017042	TAT	2	6	287860	287865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481138
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5527	NC_017042	T	6	6	288039	288044	0 %	100 %	0 %	0 %	383481138
5528	NC_017042	T	8	8	288055	288062	0 %	100 %	0 %	0 %	383481138
5529	NC_017042	TAA	2	6	288102	288107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481138
5530	NC_017042	GCG	2	6	288142	288147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383481138
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5532	NC_017042	TAC	2	6	288192	288197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383481138
5533	NC_017042	T	7	7	288202	288208	0 %	100 %	0 %	0 %	383481138
5534	NC_017042	GCG	2	6	288228	288233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383481138
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5538	NC_017042	CCG	2	6	288418	288423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383481138
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5541	NC_017042	T	6	6	288555	288560	0 %	100 %	0 %	0 %	383481138
5542	NC_017042	GTT	2	6	288603	288608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383481139
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5544	NC_017042	GAT	2	6	288663	288668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481139
5545	NC_017042	TGCA	2	8	288677	288684	25 %	25 %	25 %	25 %	383481139
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5548	NC_017042	ATT	2	6	288753	288758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481139
5549	NC_017042	TCT	2	6	288768	288773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383481139
5550	NC_017042	TCTT	2	8	288817	288824	0 %	75 %	0 %	25 %	383481139
5551	NC_017042	ATT	2	6	288831	288836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481139
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5553	NC_017042	TAA	3	9	288869	288877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481139
5554	NC_017042	ATATA	2	10	288887	288896	60 %	40 %	0 %	0 %	383481139
5555	NC_017042	AATTT	2	10	288897	288906	40 %	60 %	0 %	0 %	383481139
5556	NC_017042	TAG	2	6	288957	288962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481140
5557	NC_017042	AT	3	6	288998	289003	50 %	50 %	0 %	0 %	383481140
5558	NC_017042	TATT	2	8	289004	289011	25 %	75 %	0 %	0 %	383481140
5559	NC_017042	CAT	2	6	289025	289030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383481140
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5561	NC_017042	TAA	2	6	289047	289052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481140
5562	NC_017042	ATG	2	6	289058	289063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481140
5563	NC_017042	TAA	2	6	289092	289097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481140
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5566	NC_017042	ATT	2	6	289204	289209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481140
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5580	NC_017042	AGAT	2	8	291401	291408	50 %	25 %	25 %	0 %	383481143
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5591	NC_017042	TATG	2	8	293282	293289	25 %	50 %	25 %	0 %	383481144
5592	NC_017042	TA	3	6	293325	293330	50 %	50 %	0 %	0 %	383481144
5593	NC_017042	TG	3	6	293362	293367	0 %	50 %	50 %	0 %	383481144
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5605	NC_017042	CTTTAG	2	12	293897	293908	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383481144
5606	NC_017042	AGCTA	2	10	293913	293922	40 %	20 %	20 %	20 %	383481144
5607	NC_017042	AAT	2	6	293939	293944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481144
5608	NC_017042	AT	3	6	293977	293982	50 %	50 %	0 %	0 %	383481144
5609	NC_017042	ATTA	2	8	293988	293995	50 %	50 %	0 %	0 %	383481144
5610	NC_017042	CTT	2	6	294002	294007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383481144
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5619	NC_017042	TTA	2	6	294262	294267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481144
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5622	NC_017042	CT	3	6	294438	294443	0 %	50 %	0 %	50 %	383481144
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5995	NC_017042	TA	3	6	316241	316246	50 %	50 %	0 %	0 %	383481162
5996	NC_017042	ATA	2	6	316253	316258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481162
5997	NC_017042	ATTT	2	8	316338	316345	25 %	75 %	0 %	0 %	383481163
5998	NC_017042	ATT	2	6	316346	316351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481163
5999	NC_017042	ATTT	2	8	316394	316401	25 %	75 %	0 %	0 %	383481163
6000	NC_017042	TTA	2	6	316402	316407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481163

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