MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rhipicephali str. 3-7-female6-CWPP chromosome

Total Repeats: 24251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017042	CATG	2	8	238945	238952	25 %	25 %	25 %	25 %	383481094
4502	NC_017042	ATG	2	6	239009	239014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481094
4503	NC_017042	A	6	6	239036	239041	100 %	0 %	0 %	0 %	383481094
4504	NC_017042	GAAA	2	8	239071	239078	75 %	0 %	25 %	0 %	383481094
4505	NC_017042	CGAGG	2	10	239161	239170	20 %	0 %	60 %	20 %	383481094
4506	NC_017042	ATA	2	6	239386	239391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481095
4507	NC_017042	TAA	2	6	239405	239410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481095
4508	NC_017042	CTTTTG	2	12	239434	239445	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383481095
4509	NC_017042	TTA	2	6	239464	239469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481095
4510	NC_017042	TTA	2	6	239476	239481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481095
4511	NC_017042	TA	3	6	239538	239543	50 %	50 %	0 %	0 %	383481095
4512	NC_017042	ATT	2	6	239575	239580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481095
4513	NC_017042	T	7	7	239588	239594	0 %	100 %	0 %	0 %	383481095
4514	NC_017042	AT	3	6	239690	239695	50 %	50 %	0 %	0 %	383481095
4515	NC_017042	ATTG	2	8	239732	239739	25 %	50 %	25 %	0 %	383481095
4516	NC_017042	AT	4	8	239748	239755	50 %	50 %	0 %	0 %	383481095
4517	NC_017042	A	7	7	239763	239769	100 %	0 %	0 %	0 %	383481095
4518	NC_017042	TA	3	6	239793	239798	50 %	50 %	0 %	0 %	383481095
4519	NC_017042	TA	4	8	239891	239898	50 %	50 %	0 %	0 %	383481095
4520	NC_017042	GATA	2	8	239901	239908	50 %	25 %	25 %	0 %	383481095
4521	NC_017042	T	6	6	239923	239928	0 %	100 %	0 %	0 %	383481095
4522	NC_017042	ATA	2	6	239962	239967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481095
4523	NC_017042	TAG	2	6	239984	239989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481095
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4525	NC_017042	CAA	2	6	240052	240057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383481095
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4530	NC_017042	ACTT	2	8	240451	240458	25 %	50 %	0 %	25 %	383481096
4531	NC_017042	A	6	6	240460	240465	100 %	0 %	0 %	0 %	383481096
4532	NC_017042	TA	3	6	240467	240472	50 %	50 %	0 %	0 %	383481096
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4535	NC_017042	TA	3	6	240556	240561	50 %	50 %	0 %	0 %	383481096
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4539	NC_017042	AT	3	6	240701	240706	50 %	50 %	0 %	0 %	383481096
4540	NC_017042	GTAAAA	2	12	240758	240769	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383481096
4541	NC_017042	AACA	2	8	240777	240784	75 %	0 %	0 %	25 %	383481096
4542	NC_017042	AAG	2	6	240804	240809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383481096
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4545	NC_017042	GCC	2	6	240918	240923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383481097
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4547	NC_017042	GAAGT	2	10	240984	240993	40 %	20 %	40 %	0 %	383481097
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4553	NC_017042	ATT	2	6	241275	241280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481097
4554	NC_017042	TGA	2	6	241298	241303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481097
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4557	NC_017042	ATC	2	6	241423	241428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383481097
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4559	NC_017042	AT	3	6	241490	241495	50 %	50 %	0 %	0 %	383481097
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4563	NC_017042	TAG	2	6	241693	241698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481097
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4608	NC_017042	T	7	7	243542	243548	0 %	100 %	0 %	0 %	383481101
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4622	NC_017042	TA	3	6	244099	244104	50 %	50 %	0 %	0 %	383481102
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4624	NC_017042	ATAA	2	8	244135	244142	75 %	25 %	0 %	0 %	383481102
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4994	NC_017042	ATG	2	6	259548	259553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481118
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