MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia australis str. Cutlack plasmid pMC5_1

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017041	TCAT	2	8	1050	1057	25 %	50 %	0 %	25 %	383479186
2	NC_017041	GAAA	2	8	1583	1590	75 %	0 %	25 %	0 %	383479188
3	NC_017041	AGAA	2	8	1736	1743	75 %	0 %	25 %	0 %	383479188
4	NC_017041	AGGA	2	8	2440	2447	50 %	0 %	50 %	0 %	383479188
5	NC_017041	AAGG	2	8	3399	3406	50 %	0 %	50 %	0 %	383479188
6	NC_017041	AGAT	2	8	3838	3845	50 %	25 %	25 %	0 %	383479188
7	NC_017041	TAAA	2	8	3952	3959	75 %	25 %	0 %	0 %	383479188
8	NC_017041	TTAA	2	8	3984	3991	50 %	50 %	0 %	0 %	383479188
9	NC_017041	TTGC	2	8	4050	4057	0 %	50 %	25 %	25 %	383479188
10	NC_017041	TGAT	2	8	4423	4430	25 %	50 %	25 %	0 %	383479188
11	NC_017041	AAGG	2	8	4794	4801	50 %	0 %	50 %	0 %	383479188
12	NC_017041	AGCC	2	8	5593	5600	25 %	0 %	25 %	50 %	383479188
13	NC_017041	TAAA	2	8	5899	5906	75 %	25 %	0 %	0 %	383479188
14	NC_017041	TTTA	2	8	7652	7659	25 %	75 %	0 %	0 %	383479192
15	NC_017041	TTCA	2	8	7705	7712	25 %	50 %	0 %	25 %	383479192
16	NC_017041	TGAA	2	8	8819	8826	50 %	25 %	25 %	0 %	383479194
17	NC_017041	AAAT	2	8	8865	8872	75 %	25 %	0 %	0 %	383479194
18	NC_017041	TCTT	2	8	9177	9184	0 %	75 %	0 %	25 %	383479195
19	NC_017041	TATT	2	8	9272	9279	25 %	75 %	0 %	0 %	383479195
20	NC_017041	TACC	2	8	9497	9504	25 %	25 %	0 %	50 %	383479195
21	NC_017041	AAAC	2	8	9925	9932	75 %	0 %	0 %	25 %	383479195
22	NC_017041	GAAA	2	8	11026	11033	75 %	0 %	25 %	0 %	383479195
23	NC_017041	GCAA	2	8	14263	14270	50 %	0 %	25 %	25 %	383479196
24	NC_017041	AATA	2	8	14371	14378	75 %	25 %	0 %	0 %	383479196
25	NC_017041	GGTA	2	8	14854	14861	25 %	25 %	50 %	0 %	383479196
26	NC_017041	TTGC	2	8	15513	15520	0 %	50 %	25 %	25 %	383479197
27	NC_017041	TAAA	2	8	15648	15655	75 %	25 %	0 %	0 %	383479197
28	NC_017041	TGCC	2	8	17710	17717	0 %	25 %	25 %	50 %	383479200
29	NC_017041	AATC	2	8	17859	17866	50 %	25 %	0 %	25 %	383479200
30	NC_017041	CTTT	2	8	18181	18188	0 %	75 %	0 %	25 %	383479201
31	NC_017041	GTAT	2	8	18189	18196	25 %	50 %	25 %	0 %	383479201
32	NC_017041	AAAT	2	8	18341	18348	75 %	25 %	0 %	0 %	383479201
33	NC_017041	TTCA	2	8	18405	18412	25 %	50 %	0 %	25 %	383479201
34	NC_017041	AAAG	2	8	19855	19862	75 %	0 %	25 %	0 %	383479205
35	NC_017041	AAAG	2	8	19899	19906	75 %	0 %	25 %	0 %	383479205
36	NC_017041	GTCA	2	8	22083	22090	25 %	25 %	25 %	25 %	383479205
37	NC_017041	GCAT	2	8	22304	22311	25 %	25 %	25 %	25 %	383479205
38	NC_017041	CAAG	2	8	23439	23446	50 %	0 %	25 %	25 %	383479205
39	NC_017041	GCAG	2	8	23880	23887	25 %	0 %	50 %	25 %	383479205
40	NC_017041	ATGG	2	8	24364	24371	25 %	25 %	50 %	0 %	383479206
41	NC_017041	TAAA	2	8	24489	24496	75 %	25 %	0 %	0 %	383479206

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.