MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia massiliae str. AZT80 plasmid pRMB

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016939	AT	3	6	698	703	50 %	50 %	0 %	0 %	378750099
2	NC_016939	AT	3	6	771	776	50 %	50 %	0 %	0 %	378750099
3	NC_016939	AG	3	6	954	959	50 %	0 %	50 %	0 %	378750099
4	NC_016939	TA	3	6	1314	1319	50 %	50 %	0 %	0 %	378750100
5	NC_016939	AT	3	6	1647	1652	50 %	50 %	0 %	0 %	378750101
6	NC_016939	AG	3	6	1693	1698	50 %	0 %	50 %	0 %	378750101
7	NC_016939	AT	3	6	3330	3335	50 %	50 %	0 %	0 %	378750102
8	NC_016939	AT	3	6	3382	3387	50 %	50 %	0 %	0 %	378750102
9	NC_016939	AT	3	6	4499	4504	50 %	50 %	0 %	0 %	378750102
10	NC_016939	AT	3	6	4970	4975	50 %	50 %	0 %	0 %	378750103
11	NC_016939	AT	3	6	6908	6913	50 %	50 %	0 %	0 %	378750104
12	NC_016939	CT	4	8	7419	7426	0 %	50 %	0 %	50 %	378750105
13	NC_016939	AT	3	6	7647	7652	50 %	50 %	0 %	0 %	378750105
14	NC_016939	CA	3	6	8462	8467	50 %	0 %	0 %	50 %	378750106
15	NC_016939	AG	3	6	8643	8648	50 %	0 %	50 %	0 %	378750106
16	NC_016939	AT	3	6	9221	9226	50 %	50 %	0 %	0 %	378750107
17	NC_016939	AT	3	6	9492	9497	50 %	50 %	0 %	0 %	378750107
18	NC_016939	AT	4	8	9537	9544	50 %	50 %	0 %	0 %	378750107
19	NC_016939	AT	3	6	10216	10221	50 %	50 %	0 %	0 %	378750107
20	NC_016939	AT	3	6	10363	10368	50 %	50 %	0 %	0 %	378750107
21	NC_016939	CT	3	6	10556	10561	0 %	50 %	0 %	50 %	378750107
22	NC_016939	TA	3	6	10646	10651	50 %	50 %	0 %	0 %	378750107
23	NC_016939	AT	3	6	10654	10659	50 %	50 %	0 %	0 %	378750107
24	NC_016939	TA	3	6	11050	11055	50 %	50 %	0 %	0 %	378750107
25	NC_016939	CT	3	6	12579	12584	0 %	50 %	0 %	50 %	378750109
26	NC_016939	TC	3	6	12896	12901	0 %	50 %	0 %	50 %	378750109
27	NC_016939	AT	3	6	13352	13357	50 %	50 %	0 %	0 %	378750109
28	NC_016939	AT	3	6	13476	13481	50 %	50 %	0 %	0 %	378750109
29	NC_016939	TA	3	6	13690	13695	50 %	50 %	0 %	0 %	378750109
30	NC_016939	AT	3	6	13890	13895	50 %	50 %	0 %	0 %	378750109
31	NC_016939	TA	3	6	14941	14946	50 %	50 %	0 %	0 %	378750109

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.