MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia massiliae str. AZT80 chromosome

Total Repeats: 23445

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_016931	A	6	6	182014	182019	100 %	0 %	0 %	0 %	379713253
3503	NC_016931	TCC	2	6	182066	182071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379713253
3504	NC_016931	ATG	2	6	182121	182126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713253
3505	NC_016931	AGA	2	6	182128	182133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713253
3506	NC_016931	AAG	2	6	182143	182148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713253
3507	NC_016931	TGC	2	6	182158	182163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713253
3508	NC_016931	AAG	2	6	182247	182252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713253
3509	NC_016931	TA	3	6	182253	182258	50 %	50 %	0 %	0 %	379713253
3510	NC_016931	TAT	2	6	182296	182301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713253
3511	NC_016931	AGT	2	6	182317	182322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713253
3512	NC_016931	ATG	2	6	182364	182369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713253
3513	NC_016931	TTAT	2	8	182466	182473	25 %	75 %	0 %	0 %	379713253
3514	NC_016931	AAAG	2	8	182490	182497	75 %	0 %	25 %	0 %	379713253
3515	NC_016931	TAC	2	6	182506	182511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713253
3516	NC_016931	GAA	2	6	182540	182545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713253
3517	NC_016931	TAT	2	6	182558	182563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713253
3518	NC_016931	TAG	2	6	182655	182660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713253
3519	NC_016931	A	6	6	182697	182702	100 %	0 %	0 %	0 %	379713253
3520	NC_016931	A	6	6	182720	182725	100 %	0 %	0 %	0 %	379713253
3521	NC_016931	TAA	2	6	182743	182748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713253
3522	NC_016931	TAG	2	6	182754	182759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713253
3523	NC_016931	CTG	2	6	182850	182855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713253
3524	NC_016931	TAAT	2	8	182868	182875	50 %	50 %	0 %	0 %	379713253
3525	NC_016931	TTAAAA	2	12	182880	182891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713253
3526	NC_016931	AATC	2	8	182908	182915	50 %	25 %	0 %	25 %	379713253
3527	NC_016931	AT	3	6	182929	182934	50 %	50 %	0 %	0 %	379713253
3528	NC_016931	GCA	2	6	182975	182980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713253
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3530	NC_016931	TGA	2	6	183160	183165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713253
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3532	NC_016931	AGT	2	6	183394	183399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713253
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3534	NC_016931	CAAA	2	8	183443	183450	75 %	0 %	0 %	25 %	379713253
3535	NC_016931	AAG	2	6	183475	183480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713253
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3537	NC_016931	AATA	2	8	183634	183641	75 %	25 %	0 %	0 %	379713253
3538	NC_016931	AG	3	6	183655	183660	50 %	0 %	50 %	0 %	379713253
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3542	NC_016931	TTA	2	6	183792	183797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713253
3543	NC_016931	GTA	2	6	183875	183880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713253
3544	NC_016931	CT	3	6	183892	183897	0 %	50 %	0 %	50 %	379713253
3545	NC_016931	GAT	2	6	183917	183922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713253
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3547	NC_016931	GTA	2	6	184016	184021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713253
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3550	NC_016931	GGTC	2	8	184210	184217	0 %	25 %	50 %	25 %	379713253
3551	NC_016931	TAGG	2	8	184281	184288	25 %	25 %	50 %	0 %	379713253
3552	NC_016931	GAA	2	6	184436	184441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713253
3553	NC_016931	GAA	2	6	184469	184474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713253
3554	NC_016931	TGA	2	6	184489	184494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713253
3555	NC_016931	AAT	2	6	184501	184506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713253
3556	NC_016931	TA	3	6	184508	184513	50 %	50 %	0 %	0 %	379713253
3557	NC_016931	CTA	2	6	184595	184600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713253
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3561	NC_016931	TAG	2	6	184830	184835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713253
3562	NC_016931	ATT	2	6	184844	184849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713253
3563	NC_016931	TAC	2	6	184885	184890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713253
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3565	NC_016931	A	6	6	184994	184999	100 %	0 %	0 %	0 %	379713253
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3598	NC_016931	AAT	2	6	187050	187055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713254
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3605	NC_016931	A	7	7	187332	187338	100 %	0 %	0 %	0 %	379713254
3606	NC_016931	TTTA	2	8	187362	187369	25 %	75 %	0 %	0 %	379713254
3607	NC_016931	A	7	7	187416	187422	100 %	0 %	0 %	0 %	379713254
3608	NC_016931	TGG	2	6	187423	187428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379713254
3609	NC_016931	AG	3	6	187473	187478	50 %	0 %	50 %	0 %	379713254
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3613	NC_016931	GTC	2	6	187711	187716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713254
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3617	NC_016931	TAC	2	6	187925	187930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713254
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3620	NC_016931	AACT	2	8	188002	188009	50 %	25 %	0 %	25 %	379713254
3621	NC_016931	A	6	6	188010	188015	100 %	0 %	0 %	0 %	379713254
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3623	NC_016931	GTA	2	6	188151	188156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713254
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