MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia massiliae str. AZT80 chromosome

Total Repeats: 23445

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_016931	GTT	2	6	55470	55475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379713136
1003	NC_016931	TGC	2	6	55547	55552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713136
1004	NC_016931	CTT	2	6	55594	55599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713136
1005	NC_016931	CATATA	2	12	55642	55653	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379713136
1006	NC_016931	GTTA	2	8	55736	55743	25 %	50 %	25 %	0 %	379713136
1007	NC_016931	A	6	6	55790	55795	100 %	0 %	0 %	0 %	379713136
1008	NC_016931	ATT	2	6	55805	55810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713136
1009	NC_016931	TGA	2	6	55842	55847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713136
1010	NC_016931	ATA	2	6	55849	55854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713136
1011	NC_016931	AT	3	6	55890	55895	50 %	50 %	0 %	0 %	379713136
1012	NC_016931	CTG	2	6	55936	55941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713136
1013	NC_016931	GAT	2	6	56002	56007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713136
1014	NC_016931	T	7	7	56007	56013	0 %	100 %	0 %	0 %	379713136
1015	NC_016931	ATA	2	6	56101	56106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713136
1016	NC_016931	TGA	2	6	56167	56172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713136
1017	NC_016931	TAT	2	6	56284	56289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713136
1018	NC_016931	TTA	2	6	56325	56330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713136
1019	NC_016931	CTT	2	6	56356	56361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713136
1020	NC_016931	TCA	2	6	56418	56423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713136
1021	NC_016931	T	6	6	56457	56462	0 %	100 %	0 %	0 %	379713136
1022	NC_016931	T	7	7	56482	56488	0 %	100 %	0 %	0 %	379713136
1023	NC_016931	TCA	2	6	56703	56708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713136
1024	NC_016931	TTA	2	6	56718	56723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713136
1025	NC_016931	ATA	3	9	56866	56874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713137
1026	NC_016931	T	6	6	56885	56890	0 %	100 %	0 %	0 %	379713137
1027	NC_016931	AAG	2	6	56910	56915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713137
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1029	NC_016931	GTT	2	6	57010	57015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379713137
1030	NC_016931	A	6	6	57170	57175	100 %	0 %	0 %	0 %	379713138
1031	NC_016931	GTC	2	6	57200	57205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713138
1032	NC_016931	TTAG	2	8	57249	57256	25 %	50 %	25 %	0 %	379713138
1033	NC_016931	GAT	2	6	57284	57289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713138
1034	NC_016931	CTT	2	6	57417	57422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713138
1035	NC_016931	TAA	2	6	57442	57447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713138
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1037	NC_016931	T	6	6	57478	57483	0 %	100 %	0 %	0 %	379713138
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1040	NC_016931	ATT	2	6	57578	57583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713138
1041	NC_016931	AAT	2	6	57620	57625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713138
1042	NC_016931	ATC	2	6	57638	57643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713138
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1045	NC_016931	ACTA	2	8	57698	57705	50 %	25 %	0 %	25 %	379713138
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1047	NC_016931	ACTGCT	2	12	57764	57775	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379713138
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1049	NC_016931	ATT	2	6	57836	57841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713138
1050	NC_016931	GGT	2	6	57899	57904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379713138
1051	NC_016931	TCT	2	6	57957	57962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713138
1052	NC_016931	AT	3	6	57973	57978	50 %	50 %	0 %	0 %	379713138
1053	NC_016931	ATT	2	6	58074	58079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713138
1054	NC_016931	TAT	2	6	58084	58089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713138
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1057	NC_016931	AT	3	6	60431	60436	50 %	50 %	0 %	0 %	379713139
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1059	NC_016931	TAT	2	6	60532	60537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713139
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1082	NC_016931	TA	4	8	62466	62473	50 %	50 %	0 %	0 %	379713142
1083	NC_016931	ATTG	2	8	62476	62483	25 %	50 %	25 %	0 %	379713142
1084	NC_016931	T	6	6	62548	62553	0 %	100 %	0 %	0 %	379713142
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1091	NC_016931	T	6	6	62782	62787	0 %	100 %	0 %	0 %	379713142
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1093	NC_016931	TAA	2	6	62840	62845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713142
1094	NC_016931	T	6	6	63440	63445	0 %	100 %	0 %	0 %	379713143
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1097	NC_016931	T	8	8	63575	63582	0 %	100 %	0 %	0 %	379713143
1098	NC_016931	TCT	2	6	63661	63666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713143
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1101	NC_016931	ATTA	2	8	63738	63745	50 %	50 %	0 %	0 %	379713143
1102	NC_016931	TCT	2	6	63811	63816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713143
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1109	NC_016931	T	6	6	63999	64004	0 %	100 %	0 %	0 %	379713143
1110	NC_016931	TAAT	2	8	64049	64056	50 %	50 %	0 %	0 %	379713143
1111	NC_016931	ATA	2	6	64203	64208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713144
1112	NC_016931	TAT	2	6	64222	64227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713144
1113	NC_016931	ATA	2	6	64262	64267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713144
1114	NC_016931	TTC	2	6	64279	64284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713144
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1117	NC_016931	ATTT	2	8	64418	64425	25 %	75 %	0 %	0 %	379713144
1118	NC_016931	TAC	2	6	64429	64434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713144
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1120	NC_016931	TAT	2	6	64477	64482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713144
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1124	NC_016931	A	7	7	64564	64570	100 %	0 %	0 %	0 %	379713144
1125	NC_016931	A	6	6	64578	64583	100 %	0 %	0 %	0 %	379713144
1126	NC_016931	GAT	2	6	64586	64591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713144
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1251	NC_016931	TAC	3	9	74597	74605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713156
1252	NC_016931	A	6	6	74679	74684	100 %	0 %	0 %	0 %	379713156
1253	NC_016931	GTC	2	6	74685	74690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713156
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