MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia massiliae str. AZT80 chromosome

Total Repeats: 23445

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016931	TGC	2	6	24651	24656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713112
502	NC_016931	A	6	6	24690	24695	100 %	0 %	0 %	0 %	379713112
503	NC_016931	AAAG	2	8	24703	24710	75 %	0 %	25 %	0 %	379713112
504	NC_016931	A	7	7	24819	24825	100 %	0 %	0 %	0 %	379713112
505	NC_016931	ATA	2	6	24881	24886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713112
506	NC_016931	TCCTTA	2	12	24888	24899	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	379713112
507	NC_016931	CTA	2	6	24977	24982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713112
508	NC_016931	GAT	2	6	24985	24990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713112
509	NC_016931	GGA	2	6	25045	25050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379713112
510	NC_016931	TAA	2	6	25086	25091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713112
511	NC_016931	TAA	2	6	25172	25177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713112
512	NC_016931	AGT	2	6	25255	25260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713112
513	NC_016931	AAT	2	6	25300	25305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713112
514	NC_016931	AAG	2	6	25312	25317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713112
515	NC_016931	CGG	2	6	25332	25337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379713112
516	NC_016931	GCT	2	6	25342	25347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713112
517	NC_016931	AATA	2	8	25348	25355	75 %	25 %	0 %	0 %	379713112
518	NC_016931	AGT	2	6	25372	25377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713112
519	NC_016931	TTAT	2	8	25403	25410	25 %	75 %	0 %	0 %	379713112
520	NC_016931	TGC	2	6	25437	25442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713112
521	NC_016931	AAT	2	6	25474	25479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713112
522	NC_016931	AGC	2	6	25726	25731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713113
523	NC_016931	T	6	6	25759	25764	0 %	100 %	0 %	0 %	379713113
524	NC_016931	TAA	2	6	25783	25788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713113
525	NC_016931	T	6	6	25812	25817	0 %	100 %	0 %	0 %	379713113
526	NC_016931	TTA	2	6	25869	25874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713113
527	NC_016931	TA	3	6	25873	25878	50 %	50 %	0 %	0 %	379713113
528	NC_016931	CAA	2	6	25887	25892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379713113
529	NC_016931	A	6	6	25928	25933	100 %	0 %	0 %	0 %	379713113
530	NC_016931	ACA	2	6	25988	25993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379713113
531	NC_016931	CTTA	2	8	26031	26038	25 %	50 %	0 %	25 %	379713113
532	NC_016931	AGA	2	6	26053	26058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713113
533	NC_016931	A	6	6	26058	26063	100 %	0 %	0 %	0 %	379713113
534	NC_016931	TAT	2	6	26067	26072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713113
535	NC_016931	CTA	2	6	26094	26099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713113
536	NC_016931	ATT	2	6	26106	26111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713113
537	NC_016931	TTA	2	6	26158	26163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713113
538	NC_016931	ATTT	2	8	26463	26470	25 %	75 %	0 %	0 %	379713114
539	NC_016931	ATT	2	6	26520	26525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713114
540	NC_016931	AAT	2	6	26597	26602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713114
541	NC_016931	TCA	2	6	26614	26619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713114
542	NC_016931	AAT	2	6	26628	26633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713114
543	NC_016931	ATT	2	6	26694	26699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713114
544	NC_016931	AAT	2	6	26716	26721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713114
545	NC_016931	CTTTA	2	10	26790	26799	20 %	60 %	0 %	20 %	379713114
546	NC_016931	TAT	2	6	26862	26867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713114
547	NC_016931	TCA	2	6	26917	26922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713114
548	NC_016931	GCA	2	6	26930	26935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713114
549	NC_016931	TCA	2	6	26971	26976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713114
550	NC_016931	AAT	2	6	26977	26982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713114
551	NC_016931	GAG	2	6	27053	27058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379713114
552	NC_016931	AT	3	6	27091	27096	50 %	50 %	0 %	0 %	379713114
553	NC_016931	TCA	2	6	27130	27135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713114
554	NC_016931	CGGT	2	8	27182	27189	0 %	25 %	50 %	25 %	379713114
555	NC_016931	TAAGAA	2	12	27192	27203	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379713114
556	NC_016931	GCGG	2	8	27212	27219	0 %	0 %	75 %	25 %	379713114
557	NC_016931	TCT	2	6	27246	27251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713114
558	NC_016931	ATA	2	6	27385	27390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713114
559	NC_016931	TAT	2	6	27434	27439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713114
560	NC_016931	TTC	2	6	27564	27569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713114
561	NC_016931	T	6	6	27705	27710	0 %	100 %	0 %	0 %	379713114
562	NC_016931	TGC	2	6	27714	27719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713114
563	NC_016931	AAT	2	6	27738	27743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713114
564	NC_016931	ACG	2	6	27744	27749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713114
565	NC_016931	TCA	2	6	27757	27762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713114
566	NC_016931	TCA	2	6	27811	27816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713114
567	NC_016931	ATCAA	2	10	27817	27826	60 %	20 %	0 %	20 %	379713114
568	NC_016931	GCT	2	6	27877	27882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713114
569	NC_016931	ATG	2	6	27915	27920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713114
570	NC_016931	CTCA	2	8	27978	27985	25 %	25 %	0 %	50 %	379713114
571	NC_016931	ACG	2	6	28002	28007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713114
572	NC_016931	TGC	2	6	28014	28019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713114
573	NC_016931	AT	3	6	28030	28035	50 %	50 %	0 %	0 %	379713114
574	NC_016931	AGT	2	6	28053	28058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713114
575	NC_016931	CAC	2	6	28079	28084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379713114
576	NC_016931	AGCA	2	8	28086	28093	50 %	0 %	25 %	25 %	379713114
577	NC_016931	ATAA	2	8	28168	28175	75 %	25 %	0 %	0 %	379713114
578	NC_016931	AAT	2	6	28176	28181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713114
579	NC_016931	AAT	2	6	28284	28289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713114
580	NC_016931	TAA	2	6	28298	28303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713114
581	NC_016931	TAT	2	6	28350	28355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713114
582	NC_016931	ATT	2	6	28395	28400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713114
583	NC_016931	CGT	2	6	28408	28413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713114
584	NC_016931	TTC	2	6	28430	28435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713114
585	NC_016931	TCA	2	6	28444	28449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713114
586	NC_016931	T	6	6	28554	28559	0 %	100 %	0 %	0 %	379713114
587	NC_016931	CTA	2	6	28586	28591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713114
588	NC_016931	T	7	7	28592	28598	0 %	100 %	0 %	0 %	379713114
589	NC_016931	ATT	2	6	28599	28604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713114
590	NC_016931	ATT	2	6	28611	28616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713114
591	NC_016931	TAT	2	6	28640	28645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713114
592	NC_016931	CAG	2	6	28742	28747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713114
593	NC_016931	C	6	6	28761	28766	0 %	0 %	0 %	100 %	379713114
594	NC_016931	TTTA	2	8	28791	28798	25 %	75 %	0 %	0 %	379713114
595	NC_016931	TAA	2	6	28821	28826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713114
596	NC_016931	CCG	2	6	28837	28842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379713114
597	NC_016931	TAT	2	6	28844	28849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713114
598	NC_016931	TAA	2	6	28850	28855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713114
599	NC_016931	TTC	2	6	28875	28880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713114
600	NC_016931	ATA	2	6	28895	28900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713114
601	NC_016931	TGA	2	6	28921	28926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713114
602	NC_016931	AGC	2	6	28935	28940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713114
603	NC_016931	CTA	2	6	28951	28956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713114
604	NC_016931	TG	3	6	30520	30525	0 %	50 %	50 %	0 %	379713115
605	NC_016931	ATA	2	6	30559	30564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713115
606	NC_016931	GA	3	6	32150	32155	50 %	0 %	50 %	0 %	379713116
607	NC_016931	TAG	2	6	32156	32161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713116
608	NC_016931	TAA	3	9	32177	32185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713116
609	NC_016931	ATA	2	6	32199	32204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713116
610	NC_016931	TAA	2	6	32230	32235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713116
611	NC_016931	ATA	2	6	32238	32243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713116
612	NC_016931	GCAA	2	8	32276	32283	50 %	0 %	25 %	25 %	379713116
613	NC_016931	A	7	7	32294	32300	100 %	0 %	0 %	0 %	379713116
614	NC_016931	AAC	2	6	32339	32344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379713116
615	NC_016931	AGA	2	6	32380	32385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713117
616	NC_016931	ATGT	2	8	32418	32425	25 %	50 %	25 %	0 %	379713117
617	NC_016931	TGC	2	6	32428	32433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713117
618	NC_016931	TAG	2	6	32454	32459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713117
619	NC_016931	CTCTT	2	10	32495	32504	0 %	60 %	0 %	40 %	379713117
620	NC_016931	AGC	2	6	32534	32539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713117
621	NC_016931	T	6	6	32546	32551	0 %	100 %	0 %	0 %	379713117
622	NC_016931	ATG	2	6	32589	32594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713117
623	NC_016931	ATA	2	6	32601	32606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713117
624	NC_016931	GAA	2	6	32621	32626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713117
625	NC_016931	A	6	6	32625	32630	100 %	0 %	0 %	0 %	379713117
626	NC_016931	TAG	2	6	32633	32638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713117
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