MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia massiliae str. AZT80 chromosome

Total Repeats: 23445

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016931	T	6	6	236504	236509	0 %	100 %	0 %	0 %	379713297
4502	NC_016931	TGC	2	6	236530	236535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713297
4503	NC_016931	TCA	2	6	236584	236589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713297
4504	NC_016931	T	6	6	236595	236600	0 %	100 %	0 %	0 %	379713297
4505	NC_016931	TTAA	2	8	236611	236618	50 %	50 %	0 %	0 %	379713297
4506	NC_016931	TACCA	2	10	236631	236640	40 %	20 %	0 %	40 %	379713297
4507	NC_016931	GGTTT	2	10	236649	236658	0 %	60 %	40 %	0 %	379713297
4508	NC_016931	ATTT	2	8	236708	236715	25 %	75 %	0 %	0 %	379713297
4509	NC_016931	ACG	2	6	236754	236759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713297
4510	NC_016931	ATT	2	6	236773	236778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713297
4511	NC_016931	TTA	2	6	236890	236895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713298
4512	NC_016931	GCT	2	6	236923	236928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713298
4513	NC_016931	T	6	6	236940	236945	0 %	100 %	0 %	0 %	379713298
4514	NC_016931	GCT	2	6	236982	236987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713299
4515	NC_016931	CTT	2	6	237012	237017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713299
4516	NC_016931	GAT	2	6	237033	237038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713299
4517	NC_016931	TA	3	6	237052	237057	50 %	50 %	0 %	0 %	379713299
4518	NC_016931	CAT	2	6	237058	237063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713299
4519	NC_016931	GAG	2	6	237138	237143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379713299
4520	NC_016931	TAA	2	6	237147	237152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713299
4521	NC_016931	ATA	2	6	237162	237167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713299
4522	NC_016931	T	6	6	237247	237252	0 %	100 %	0 %	0 %	379713299
4523	NC_016931	ACA	2	6	237320	237325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379713299
4524	NC_016931	TA	3	6	237372	237377	50 %	50 %	0 %	0 %	379713299
4525	NC_016931	ATC	2	6	237382	237387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713299
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4528	NC_016931	CTT	2	6	237495	237500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713299
4529	NC_016931	AGT	2	6	237550	237555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713299
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4533	NC_016931	TAT	2	6	237801	237806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713299
4534	NC_016931	GCT	2	6	237854	237859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713299
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4540	NC_016931	CT	3	6	238395	238400	0 %	50 %	0 %	50 %	379713300
4541	NC_016931	ATT	2	6	238419	238424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713300
4542	NC_016931	CTT	2	6	238433	238438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713300
4543	NC_016931	TA	3	6	238464	238469	50 %	50 %	0 %	0 %	379713300
4544	NC_016931	TTC	2	6	238494	238499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713300
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4546	NC_016931	TAT	2	6	238526	238531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713300
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4548	NC_016931	T	8	8	238557	238564	0 %	100 %	0 %	0 %	379713300
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4551	NC_016931	TTGT	2	8	238675	238682	0 %	75 %	25 %	0 %	379713300
4552	NC_016931	AGT	2	6	238719	238724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713300
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4554	NC_016931	ATC	2	6	238812	238817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713300
4555	NC_016931	GTA	2	6	238858	238863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713300
4556	NC_016931	ACAT	2	8	238873	238880	50 %	25 %	0 %	25 %	379713300
4557	NC_016931	ATT	2	6	238881	238886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713300
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4561	NC_016931	T	6	6	239083	239088	0 %	100 %	0 %	0 %	379713300
4562	NC_016931	ATT	2	6	239184	239189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713300
4563	NC_016931	TA	3	6	239196	239201	50 %	50 %	0 %	0 %	379713300
4564	NC_016931	GTA	2	6	239203	239208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713300
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4567	NC_016931	CAAT	2	8	239338	239345	50 %	25 %	0 %	25 %	379713300
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4570	NC_016931	GTACGA	2	12	239491	239502	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379713300
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4606	NC_016931	TA	3	6	241028	241033	50 %	50 %	0 %	0 %	379713300
4607	NC_016931	CAA	2	6	241040	241045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379713300
4608	NC_016931	AAAT	2	8	241062	241069	75 %	25 %	0 %	0 %	379713300
4609	NC_016931	T	8	8	241076	241083	0 %	100 %	0 %	0 %	379713300
4610	NC_016931	TCT	2	6	241087	241092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713300
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4994	NC_016931	CAT	2	6	261904	261909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713322
4995	NC_016931	TAT	2	6	261910	261915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713322
4996	NC_016931	TTA	2	6	261929	261934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713322
4997	NC_016931	TAAT	2	8	261959	261966	50 %	50 %	0 %	0 %	379713322
4998	NC_016931	TA	3	6	261996	262001	50 %	50 %	0 %	0 %	379713322
4999	NC_016931	CAT	2	6	262014	262019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713322
5000	NC_016931	TAC	2	6	262029	262034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713322

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