MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia philipii str. 364D chromosome

Total Repeats: 456

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016930	AAAGTA	2	12	1229	1240	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379711744
2	NC_016930	CAAAAC	2	12	5070	5081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379711747
3	NC_016930	CAAAAT	2	12	5923	5934	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	379711747
4	NC_016930	ACCGTA	2	12	7195	7206	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379711750
5	NC_016930	AGAAAA	2	12	13742	13753	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	379711757
6	NC_016930	ATTAAA	2	12	14918	14929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711759
7	NC_016930	TTTAAA	2	12	16515	16526	50 %	50 %	0 %	0 %	379711761
8	NC_016930	CTAATT	2	12	16564	16575	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379711761
9	NC_016930	CTATAT	2	12	17179	17190	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379711761
10	NC_016930	ATTTAG	2	12	20749	20760	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379711763
11	NC_016930	ATTTAG	2	12	21901	21912	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379711763
12	NC_016930	GCATTA	2	12	22884	22895	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379711763
13	NC_016930	TCCGAT	2	12	23001	23012	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379711763
14	NC_016930	AAATGC	2	12	23077	23088	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379711763
15	NC_016930	ATTTAA	2	12	23390	23401	50 %	50 %	0 %	0 %	379711763
16	NC_016930	AGAAAA	2	12	24394	24405	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	379711764
17	NC_016930	CATATA	2	12	31775	31786	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379711776
18	NC_016930	AATACA	2	12	35347	35358	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	379711781
19	NC_016930	ATATTA	2	12	43374	43385	50 %	50 %	0 %	0 %	379711789
20	NC_016930	AAAGCT	2	12	43558	43569	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379711789
21	NC_016930	ATTAAT	2	12	44120	44131	50 %	50 %	0 %	0 %	379711789
22	NC_016930	TTTTTA	2	12	45100	45111	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	379711791
23	NC_016930	ATTGCT	2	12	53950	53961	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379711798
24	NC_016930	ATTTAT	2	12	54537	54548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711799
25	NC_016930	ATAAGG	2	12	54736	54747	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379711799
26	NC_016930	TCTTGG	2	12	56185	56196	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	379711800
27	NC_016930	ATCAGA	2	12	58574	58585	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379711805
28	NC_016930	AAAACA	2	12	62356	62367	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	379711807
29	NC_016930	TAATAT	2	12	67567	67578	50 %	50 %	0 %	0 %	379711814
30	NC_016930	CAGCAA	2	12	68236	68247	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	379711815
31	NC_016930	ATAGTG	2	12	68567	68578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711815
32	NC_016930	AAAAAG	2	12	69395	69406	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	379711815
33	NC_016930	TATAGT	2	12	72596	72607	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379711819
34	NC_016930	GAAAGA	2	12	72677	72688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379711819
35	NC_016930	TACCCT	2	12	74239	74250	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	379711822
36	NC_016930	ATCCTG	2	12	74261	74272	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379711822
37	NC_016930	AAAGCT	2	12	74680	74691	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379711822
38	NC_016930	GTAATA	2	12	75319	75330	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379711822
39	NC_016930	AGTAAA	2	12	83977	83988	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379711831
40	NC_016930	TCAAAA	2	12	85582	85593	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	379711832
41	NC_016930	CGTGAT	2	12	86869	86880	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379711834
42	NC_016930	TTGATT	2	12	89329	89340	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379711835
43	NC_016930	GAAGCA	2	12	90421	90432	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	379711836
44	NC_016930	TTTTTA	2	12	95796	95807	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	379711841
45	NC_016930	CCTATA	2	12	100578	100589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711847
46	NC_016930	ACCTAT	2	12	100811	100822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711847
47	NC_016930	ACCGCT	2	12	102156	102167	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379711848
48	NC_016930	TCAAGA	2	12	111303	111314	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379711854
49	NC_016930	TAGCGG	2	12	116789	116800	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379711859
50	NC_016930	TATAAA	2	12	120610	120621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711863
51	NC_016930	TTTATT	2	12	122306	122317	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	379711865
52	NC_016930	TAAAAT	2	12	126301	126312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711871
53	NC_016930	CTTTGT	2	12	133501	133512	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	379711883
54	NC_016930	TTGCTA	2	12	135591	135602	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379711884
55	NC_016930	AAGATA	2	12	135756	135767	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379711884
56	NC_016930	CTTTAG	2	12	135918	135929	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379711884
57	NC_016930	TTTAGT	2	12	136577	136588	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379711884
58	NC_016930	TAATGC	2	12	140282	140293	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379711886
59	NC_016930	AAAGAT	2	12	141105	141116	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379711886
60	NC_016930	TAAAGA	2	12	141329	141340	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379711886
61	NC_016930	TTTATC	2	12	154053	154064	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	379711893
62	NC_016930	GATTTT	2	12	154347	154358	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379711894
63	NC_016930	TTTTGG	2	12	154802	154813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379711894
64	NC_016930	CTTTTG	2	12	156906	156917	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	379711896
65	NC_016930	GTAAAA	2	12	158230	158241	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379711897
66	NC_016930	ATTGAG	2	12	161459	161470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711902
67	NC_016930	CTTCAT	2	12	161685	161696	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	379711902
68	NC_016930	TCAATT	2	12	163461	163472	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379711904
69	NC_016930	AAAGAA	2	12	164101	164112	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	379711904
70	NC_016930	TCAAGC	2	12	164118	164129	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379711904
71	NC_016930	GTTGAG	2	12	164685	164696	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	379711905
72	NC_016930	AAGTAA	2	12	166478	166489	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379711906
73	NC_016930	TAGAGC	2	12	169305	169316	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379711911
74	NC_016930	GAACAA	2	12	172827	172838	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	379711915
75	NC_016930	TGCAGT	2	12	172970	172981	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379711915
76	NC_016930	ATAAAA	2	12	174244	174255	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	379711915
77	NC_016930	TTTTTA	2	12	175307	175318	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	379711916
78	NC_016930	CTGTAG	2	12	178333	178344	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379711921
79	NC_016930	TTAAAA	2	12	180586	180597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711922
80	NC_016930	GCTATT	2	12	182433	182444	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379711922
81	NC_016930	TCCATG	2	12	189417	189428	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379711924
82	NC_016930	GATGTT	2	12	190442	190453	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	379711925
83	NC_016930	AAAAAT	2	12	192919	192930	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	379711928
84	NC_016930	AAGAAT	2	12	194730	194741	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379711928
85	NC_016930	CCCTAA	2	12	207226	207237	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	379711941
86	NC_016930	CTTTAG	2	12	211650	211661	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379711944
87	NC_016930	ATATTT	2	12	212639	212650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711944
88	NC_016930	GTTTCA	2	12	215937	215948	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379711948
89	NC_016930	AAAAGC	2	12	217113	217124	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	379711949
90	NC_016930	TTTCTT	2	12	218563	218574	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	379711951
91	NC_016930	TTTTCT	2	12	218583	218594	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	379711951
92	NC_016930	AAATTA	2	12	219742	219753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711953
93	NC_016930	AGTTAA	2	12	221684	221695	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379711954
94	NC_016930	TCATAA	2	12	223676	223687	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379711955
95	NC_016930	TAATAT	2	12	223781	223792	50 %	50 %	0 %	0 %	379711955
96	NC_016930	TAAATT	2	12	225377	225388	50 %	50 %	0 %	0 %	379711957
97	NC_016930	AAAGCA	2	12	232924	232935	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	379711969
98	NC_016930	CTTCTA	2	12	237962	237973	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	379711974
99	NC_016930	ATCTCA	2	12	240729	240740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711976
100	NC_016930	TTCTTT	2	12	242122	242133	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	379711977
101	NC_016930	TACTTC	2	12	244448	244459	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	379711981
102	NC_016930	CAATAT	2	12	253993	254004	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379711991
103	NC_016930	GCACCG	2	12	261755	261766	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379712000
104	NC_016930	GCACCG	2	12	263555	263566	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379712003
105	NC_016930	TTACTC	2	12	264470	264481	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	379712005
106	NC_016930	CATTAT	2	12	268941	268952	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379712010
107	NC_016930	TTAAAG	2	12	277157	277168	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379712016
108	NC_016930	AGGGTA	2	12	277475	277486	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	379712016
109	NC_016930	GCGGTA	2	12	278093	278104	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379712016
110	NC_016930	TAAAAA	2	12	288261	288272	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	379712028
111	NC_016930	GTCGTT	2	12	289454	289465	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	379712030
112	NC_016930	CCTGAA	2	12	291908	291919	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379712032
113	NC_016930	TTTTGC	2	12	297514	297525	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	379712038
114	NC_016930	TACTAA	2	12	300497	300508	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379712041
115	NC_016930	TATTGA	2	12	301220	301231	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379712041
116	NC_016930	GGGATA	2	12	302115	302126	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	379712042
117	NC_016930	GGCAAT	2	12	303123	303134	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379712042
118	NC_016930	TTGTTC	2	12	306995	307006	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	379712048
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234	NC_016930	CTAAAT	2	12	637972	637983	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379712405
235	NC_016930	TCACCG	2	12	642593	642604	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379712408
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303	NC_016930	CTTCTA	2	12	819556	819567	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	379712598
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334	NC_016930	AATATT	2	12	909323	909334	50 %	50 %	0 %	0 %	379712691
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339	NC_016930	GCATTG	2	12	931264	931275	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379712710
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342	NC_016930	AGGTAT	2	12	950049	950060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379712730
343	NC_016930	TTCCTT	2	12	951811	951822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379712735
344	NC_016930	TTAAAT	2	12	951979	951990	50 %	50 %	0 %	0 %	379712735
345	NC_016930	ACCTTT	2	12	954946	954957	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	379712743
346	NC_016930	ATTAAT	2	12	955665	955676	50 %	50 %	0 %	0 %	379712744
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