MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia philipii str. 364D chromosome

Total Repeats: 2869

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016930	TTAT	2	8	2697	2704	25 %	75 %	0 %	0 %	379711746
2	NC_016930	TTAT	2	8	2919	2926	25 %	75 %	0 %	0 %	379711746
3	NC_016930	AACT	2	8	3302	3309	50 %	25 %	0 %	25 %	379711747
4	NC_016930	CAAA	2	8	3348	3355	75 %	0 %	0 %	25 %	379711747
5	NC_016930	TATT	2	8	3615	3622	25 %	75 %	0 %	0 %	379711747
6	NC_016930	TTGC	2	8	3745	3752	0 %	50 %	25 %	25 %	379711747
7	NC_016930	AATA	2	8	5316	5323	75 %	25 %	0 %	0 %	379711747
8	NC_016930	ATTC	2	8	5353	5360	25 %	50 %	0 %	25 %	379711747
9	NC_016930	ATAA	2	8	6784	6791	75 %	25 %	0 %	0 %	379711749
10	NC_016930	ACTT	2	8	7166	7173	25 %	50 %	0 %	25 %	379711750
11	NC_016930	ATTT	2	8	7573	7580	25 %	75 %	0 %	0 %	379711750
12	NC_016930	CTGT	2	8	8009	8016	0 %	50 %	25 %	25 %	379711751
13	NC_016930	CCTC	2	8	9841	9848	0 %	25 %	0 %	75 %	379711753
14	NC_016930	CAAT	2	8	9888	9895	50 %	25 %	0 %	25 %	379711753
15	NC_016930	GATT	2	8	11857	11864	25 %	50 %	25 %	0 %	379711755
16	NC_016930	AAAT	2	8	11865	11872	75 %	25 %	0 %	0 %	379711755
17	NC_016930	AATT	2	8	11892	11899	50 %	50 %	0 %	0 %	379711755
18	NC_016930	TTAA	2	8	12073	12080	50 %	50 %	0 %	0 %	379711755
19	NC_016930	ATGA	2	8	12772	12779	50 %	25 %	25 %	0 %	379711756
20	NC_016930	TAAA	2	8	13795	13802	75 %	25 %	0 %	0 %	379711757
21	NC_016930	TAAA	2	8	13954	13961	75 %	25 %	0 %	0 %	379711757
22	NC_016930	TCAT	2	8	14075	14082	25 %	50 %	0 %	25 %	379711757
23	NC_016930	CTTT	2	8	14209	14216	0 %	75 %	0 %	25 %	379711757
24	NC_016930	GCAA	2	8	14549	14556	50 %	0 %	25 %	25 %	379711758
25	NC_016930	TCTT	2	8	14626	14633	0 %	75 %	0 %	25 %	379711758
26	NC_016930	AGTA	2	8	14884	14891	50 %	25 %	25 %	0 %	379711759
27	NC_016930	GCTT	2	8	15410	15417	0 %	50 %	25 %	25 %	379711760
28	NC_016930	AATT	2	8	15759	15766	50 %	50 %	0 %	0 %	379711760
29	NC_016930	AATA	2	8	16383	16390	75 %	25 %	0 %	0 %	379711761
30	NC_016930	TCTA	2	8	16850	16857	25 %	50 %	0 %	25 %	379711761
31	NC_016930	ACGT	2	8	17273	17280	25 %	25 %	25 %	25 %	379711761
32	NC_016930	CTTG	2	8	17388	17395	0 %	50 %	25 %	25 %	379711761
33	NC_016930	GTAA	2	8	19374	19381	50 %	25 %	25 %	0 %	379711763
34	NC_016930	AGAT	2	8	19628	19635	50 %	25 %	25 %	0 %	379711763
35	NC_016930	AGCA	2	8	19747	19754	50 %	0 %	25 %	25 %	379711763
36	NC_016930	AAAT	2	8	19790	19797	75 %	25 %	0 %	0 %	379711763
37	NC_016930	AATG	2	8	19991	19998	50 %	25 %	25 %	0 %	379711763
38	NC_016930	ATTA	2	8	20292	20299	50 %	50 %	0 %	0 %	379711763
39	NC_016930	ATAG	2	8	20340	20347	50 %	25 %	25 %	0 %	379711763
40	NC_016930	ATAG	2	8	20352	20359	50 %	25 %	25 %	0 %	379711763
41	NC_016930	CGTT	2	8	20770	20777	0 %	50 %	25 %	25 %	379711763
42	NC_016930	TAGT	2	8	21217	21224	25 %	50 %	25 %	0 %	379711763
43	NC_016930	AAGC	2	8	21957	21964	50 %	0 %	25 %	25 %	379711763
44	NC_016930	TAAA	2	8	22318	22325	75 %	25 %	0 %	0 %	379711763
45	NC_016930	AAGT	2	8	22831	22838	50 %	25 %	25 %	0 %	379711763
46	NC_016930	TTCA	2	8	23380	23387	25 %	50 %	0 %	25 %	379711763
47	NC_016930	AATA	2	8	23873	23880	75 %	25 %	0 %	0 %	379711763
48	NC_016930	TAAA	2	8	24019	24026	75 %	25 %	0 %	0 %	379711763
49	NC_016930	ATGT	2	8	24818	24825	25 %	50 %	25 %	0 %	379711765
50	NC_016930	TTAT	2	8	24872	24879	25 %	75 %	0 %	0 %	379711765
51	NC_016930	AGCA	2	8	24946	24953	50 %	0 %	25 %	25 %	379711765
52	NC_016930	TAAT	2	8	25747	25754	50 %	50 %	0 %	0 %	379711766
53	NC_016930	AAGA	2	8	25899	25906	75 %	0 %	25 %	0 %	379711766
54	NC_016930	AAAT	2	8	25991	25998	75 %	25 %	0 %	0 %	379711766
55	NC_016930	ATTA	2	8	26019	26026	50 %	50 %	0 %	0 %	379711766
56	NC_016930	TCTA	2	8	27715	27722	25 %	50 %	0 %	25 %	379711770
57	NC_016930	ATTT	2	8	27759	27766	25 %	75 %	0 %	0 %	379711770
58	NC_016930	TGTC	2	8	27823	27830	0 %	50 %	25 %	25 %	379711770
59	NC_016930	ATAC	2	8	28420	28427	50 %	25 %	0 %	25 %	379711772
60	NC_016930	ATAA	2	8	28844	28851	75 %	25 %	0 %	0 %	379711772
61	NC_016930	CACT	2	8	28938	28945	25 %	25 %	0 %	50 %	379711772
62	NC_016930	TATT	2	8	29764	29771	25 %	75 %	0 %	0 %	379711774
63	NC_016930	AATT	2	8	31397	31404	50 %	50 %	0 %	0 %	379711776
64	NC_016930	TACC	2	8	31487	31494	25 %	25 %	0 %	50 %	379711776
65	NC_016930	GTTA	2	8	31869	31876	25 %	50 %	25 %	0 %	379711776
66	NC_016930	AAAC	2	8	33296	33303	75 %	0 %	0 %	25 %	379711778
67	NC_016930	TTAG	2	8	33472	33479	25 %	50 %	25 %	0 %	379711778
68	NC_016930	TTGC	2	8	33767	33774	0 %	50 %	25 %	25 %	379711778
69	NC_016930	TTCC	2	8	34007	34014	0 %	50 %	0 %	50 %	379711778
70	NC_016930	TGTT	2	8	34475	34482	0 %	75 %	25 %	0 %	379711779
71	NC_016930	TTGT	2	8	35081	35088	0 %	75 %	25 %	0 %	379711781
72	NC_016930	TATT	2	8	35160	35167	25 %	75 %	0 %	0 %	379711781
73	NC_016930	GTAA	2	8	35171	35178	50 %	25 %	25 %	0 %	379711781
74	NC_016930	TAAA	2	8	39322	39329	75 %	25 %	0 %	0 %	379711784
75	NC_016930	ATTT	2	8	39427	39434	25 %	75 %	0 %	0 %	379711784
76	NC_016930	GAAA	2	8	41057	41064	75 %	0 %	25 %	0 %	379711786
77	NC_016930	ATTT	2	8	41101	41108	25 %	75 %	0 %	0 %	379711786
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79	NC_016930	AAAT	2	8	41572	41579	75 %	25 %	0 %	0 %	379711787
80	NC_016930	TAAC	2	8	43467	43474	50 %	25 %	0 %	25 %	379711789
81	NC_016930	ATTC	2	8	43895	43902	25 %	50 %	0 %	25 %	379711789
82	NC_016930	ATGT	2	8	44250	44257	25 %	50 %	25 %	0 %	379711790
83	NC_016930	ATTT	2	8	44408	44415	25 %	75 %	0 %	0 %	379711790
84	NC_016930	TTAC	2	8	44487	44494	25 %	50 %	0 %	25 %	379711790
85	NC_016930	ATCA	2	8	45162	45169	50 %	25 %	0 %	25 %	379711791
86	NC_016930	TGCC	2	8	45472	45479	0 %	25 %	25 %	50 %	379711791
87	NC_016930	TATC	2	8	46031	46038	25 %	50 %	0 %	25 %	379711791
88	NC_016930	TTAA	2	8	46054	46061	50 %	50 %	0 %	0 %	379711791
89	NC_016930	TTGC	2	8	47345	47352	0 %	50 %	25 %	25 %	379711793
90	NC_016930	GTTT	2	8	47711	47718	0 %	75 %	25 %	0 %	379711794
91	NC_016930	TAAA	2	8	50862	50869	75 %	25 %	0 %	0 %	379711797
92	NC_016930	GAGG	2	8	50888	50895	25 %	0 %	75 %	0 %	379711797
93	NC_016930	ATTG	2	8	51271	51278	25 %	50 %	25 %	0 %	379711797
94	NC_016930	TTAT	2	8	51485	51492	25 %	75 %	0 %	0 %	379711797
95	NC_016930	TGCT	2	8	51567	51574	0 %	50 %	25 %	25 %	379711797
96	NC_016930	GTGA	2	8	51674	51681	25 %	25 %	50 %	0 %	379711797
97	NC_016930	CCGC	2	8	52441	52448	0 %	0 %	25 %	75 %	379711797
98	NC_016930	GTTC	2	8	52452	52459	0 %	50 %	25 %	25 %	379711797
99	NC_016930	GACC	2	8	52470	52477	25 %	0 %	25 %	50 %	379711797
100	NC_016930	AAAT	2	8	53190	53197	75 %	25 %	0 %	0 %	379711797
101	NC_016930	TAAG	2	8	53599	53606	50 %	25 %	25 %	0 %	379711798
102	NC_016930	ATAA	2	8	54226	54233	75 %	25 %	0 %	0 %	379711799
103	NC_016930	CTTT	2	8	54926	54933	0 %	75 %	0 %	25 %	379711799
104	NC_016930	ACTT	2	8	55437	55444	25 %	50 %	0 %	25 %	379711800
105	NC_016930	TTGC	2	8	55895	55902	0 %	50 %	25 %	25 %	379711800
106	NC_016930	ATAA	2	8	55927	55934	75 %	25 %	0 %	0 %	379711800
107	NC_016930	ATAA	2	8	55981	55988	75 %	25 %	0 %	0 %	379711800
108	NC_016930	CATC	2	8	56118	56125	25 %	25 %	0 %	50 %	379711800
109	NC_016930	ATTT	3	12	56294	56305	25 %	75 %	0 %	0 %	379711800
110	NC_016930	GTTA	2	8	57036	57043	25 %	50 %	25 %	0 %	379711802
111	NC_016930	AGAA	2	8	57669	57676	75 %	0 %	25 %	0 %	379711803
112	NC_016930	AAAG	2	8	58049	58056	75 %	0 %	25 %	0 %	379711804
113	NC_016930	TAAA	2	8	58116	58123	75 %	25 %	0 %	0 %	379711804
114	NC_016930	AAGA	2	8	59237	59244	75 %	0 %	25 %	0 %	379711806
115	NC_016930	AGTC	2	8	59472	59479	25 %	25 %	25 %	25 %	379711806
116	NC_016930	TAAT	2	8	59888	59895	50 %	50 %	0 %	0 %	379711806
117	NC_016930	ATTA	2	8	59964	59971	50 %	50 %	0 %	0 %	379711806
118	NC_016930	ATCT	2	8	60221	60228	25 %	50 %	0 %	25 %	379711806
119	NC_016930	GAAT	2	8	60785	60792	50 %	25 %	25 %	0 %	379711807
120	NC_016930	CAAG	2	8	61016	61023	50 %	0 %	25 %	25 %	379711807
121	NC_016930	ATGG	2	8	61339	61346	25 %	25 %	50 %	0 %	379711807
122	NC_016930	AAGA	2	8	61624	61631	75 %	0 %	25 %	0 %	379711807
123	NC_016930	AGAA	2	8	61709	61716	75 %	0 %	25 %	0 %	379711807
124	NC_016930	TTAA	2	8	63399	63406	50 %	50 %	0 %	0 %	379711810
125	NC_016930	GGAA	2	8	63455	63462	50 %	0 %	50 %	0 %	379711810
126	NC_016930	GCAT	2	8	63507	63514	25 %	25 %	25 %	25 %	379711810
127	NC_016930	TGCT	2	8	63734	63741	0 %	50 %	25 %	25 %	379711810
128	NC_016930	AATT	2	8	64557	64564	50 %	50 %	0 %	0 %	379711812
129	NC_016930	TGTT	2	8	64817	64824	0 %	75 %	25 %	0 %	379711812
130	NC_016930	TGAT	2	8	65366	65373	25 %	50 %	25 %	0 %	379711812
131	NC_016930	AATT	2	8	65747	65754	50 %	50 %	0 %	0 %	379711812
132	NC_016930	CCTA	2	8	66124	66131	25 %	25 %	0 %	50 %	379711813
133	NC_016930	AAAC	2	8	66321	66328	75 %	0 %	0 %	25 %	379711813
134	NC_016930	TTAT	2	8	66967	66974	25 %	75 %	0 %	0 %	379711814
135	NC_016930	AACT	2	8	67356	67363	50 %	25 %	0 %	25 %	379711814
136	NC_016930	GAAT	2	8	68135	68142	50 %	25 %	25 %	0 %	379711815
137	NC_016930	TAAT	2	8	68150	68157	50 %	50 %	0 %	0 %	379711815
138	NC_016930	TAGT	2	8	68516	68523	25 %	50 %	25 %	0 %	379711815
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