MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia philipii str. 364D chromosome

Total Repeats: 15464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016930	ATT	2	6	13	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711743
2	NC_016930	GCA	2	6	58	63	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379711743
3	NC_016930	TAT	2	6	182	187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711743
4	NC_016930	ATT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711743
5	NC_016930	ATG	2	6	392	397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711743
6	NC_016930	ATA	2	6	433	438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711743
7	NC_016930	TTA	2	6	587	592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711743
8	NC_016930	CAG	2	6	767	772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379711743
9	NC_016930	TAA	2	6	776	781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711743
10	NC_016930	ATA	2	6	812	817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711743
11	NC_016930	ATA	2	6	1196	1201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711744
12	NC_016930	TGA	2	6	1255	1260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711744
13	NC_016930	GTA	2	6	1293	1298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711744
14	NC_016930	CAA	2	6	1355	1360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379711744
15	NC_016930	TAA	2	6	1384	1389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711744
16	NC_016930	TCT	2	6	1503	1508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379711745
17	NC_016930	ATA	3	9	1767	1775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711745
18	NC_016930	GTA	2	6	1833	1838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711745
19	NC_016930	TGA	2	6	1933	1938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711745
20	NC_016930	GAA	2	6	1990	1995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379711745
21	NC_016930	AAT	2	6	2020	2025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711745
22	NC_016930	AAG	2	6	2037	2042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379711745
23	NC_016930	TTA	2	6	2075	2080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711745
24	NC_016930	CAA	3	9	2138	2146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379711745
25	NC_016930	AGC	2	6	2390	2395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379711746
26	NC_016930	ATA	2	6	2435	2440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711746
27	NC_016930	ATA	2	6	2573	2578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711746
28	NC_016930	TAA	2	6	2604	2609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711746
29	NC_016930	ATG	2	6	2834	2839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711746
30	NC_016930	TAT	2	6	2854	2859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711746
31	NC_016930	CTC	2	6	3065	3070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379711747
32	NC_016930	ATT	2	6	3076	3081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711747
33	NC_016930	ATT	2	6	3089	3094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711747
34	NC_016930	ATT	2	6	3202	3207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711747
35	NC_016930	AGA	2	6	3375	3380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379711747
36	NC_016930	AGA	2	6	3390	3395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379711747
37	NC_016930	AGC	2	6	3405	3410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379711747
38	NC_016930	TGC	2	6	3417	3422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379711747
39	NC_016930	ATT	2	6	3608	3613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711747
40	NC_016930	GTT	2	6	3644	3649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379711747
41	NC_016930	GAG	2	6	3685	3690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379711747
42	NC_016930	TAT	2	6	3846	3851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711747
43	NC_016930	GCA	2	6	3874	3879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379711747
44	NC_016930	AGA	2	6	3972	3977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379711747
45	NC_016930	CTA	2	6	4067	4072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711747
46	NC_016930	TAT	2	6	4123	4128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711747
47	NC_016930	TTA	2	6	4129	4134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711747
48	NC_016930	TGT	2	6	4149	4154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379711747
49	NC_016930	ATA	2	6	4343	4348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711747
50	NC_016930	GGC	2	6	4594	4599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379711747
51	NC_016930	GCA	2	6	4618	4623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379711747
52	NC_016930	GAA	2	6	4717	4722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379711747
53	NC_016930	AAG	2	6	4748	4753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379711747
54	NC_016930	AAT	2	6	4759	4764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711747
55	NC_016930	GAA	2	6	4765	4770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379711747
56	NC_016930	TAA	2	6	4785	4790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711747
57	NC_016930	CTA	2	6	4809	4814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711747
58	NC_016930	GAG	2	6	4858	4863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379711747
59	NC_016930	AAG	2	6	5201	5206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379711747
60	NC_016930	ACG	2	6	5210	5215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379711747
61	NC_016930	ATA	2	6	5237	5242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711747
62	NC_016930	ATT	2	6	5288	5293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711747
63	NC_016930	TAA	2	6	5310	5315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711747
64	NC_016930	GAT	2	6	5329	5334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711747
65	NC_016930	TGC	2	6	5367	5372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379711747
66	NC_016930	ATT	2	6	5411	5416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711747
67	NC_016930	TGC	2	6	5424	5429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379711747
68	NC_016930	CTA	2	6	5519	5524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711747
69	NC_016930	AGT	2	6	5556	5561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711747
70	NC_016930	CGC	2	6	5582	5587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379711747
71	NC_016930	TTG	2	6	5618	5623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379711747
72	NC_016930	TTA	2	6	5647	5652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711747
73	NC_016930	ATA	2	6	5669	5674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711747
74	NC_016930	TAA	2	6	5738	5743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711747
75	NC_016930	ATA	2	6	5761	5766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711747
76	NC_016930	GAA	2	6	5767	5772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379711747
77	NC_016930	ATA	2	6	5815	5820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711747
78	NC_016930	ATG	2	6	5848	5853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711747
79	NC_016930	TCA	2	6	6019	6024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711747
80	NC_016930	TGT	2	6	6104	6109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379711748
81	NC_016930	GAT	2	6	6131	6136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711748
82	NC_016930	AAC	3	9	6156	6164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379711748
83	NC_016930	CAA	2	6	6207	6212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379711748
84	NC_016930	CTA	3	9	6361	6369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711749
85	NC_016930	ATT	2	6	6408	6413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711749
86	NC_016930	TTC	2	6	6474	6479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379711749
87	NC_016930	ATC	2	6	6625	6630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711749
88	NC_016930	CCG	2	6	6673	6678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379711749
89	NC_016930	ATT	2	6	6679	6684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711749
90	NC_016930	TAC	2	6	6735	6740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711749
91	NC_016930	ATT	2	6	6741	6746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711749
92	NC_016930	ATT	3	9	6792	6800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711749
93	NC_016930	TCA	2	6	6812	6817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711749
94	NC_016930	CCG	2	6	6820	6825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379711749
95	NC_016930	TAT	2	6	6866	6871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711749
96	NC_016930	ATT	2	6	6880	6885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711749
97	NC_016930	TAC	2	6	6990	6995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711749
98	NC_016930	GTA	2	6	7105	7110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711749
99	NC_016930	CTT	2	6	7322	7327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379711750
100	NC_016930	TAG	2	6	7334	7339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711750
101	NC_016930	AGC	2	6	7365	7370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379711750
102	NC_016930	CTA	2	6	7511	7516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711750
103	NC_016930	ATA	3	9	7813	7821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711751
104	NC_016930	ATA	2	6	7840	7845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711751
105	NC_016930	GCC	2	6	7860	7865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379711751
106	NC_016930	ATA	2	6	8023	8028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711751
107	NC_016930	TAG	2	6	8126	8131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711751
108	NC_016930	ATT	2	6	8151	8156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711751
109	NC_016930	ACG	2	6	8257	8262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379711751
110	NC_016930	TCG	2	6	8263	8268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379711751
111	NC_016930	TGT	2	6	8296	8301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379711751
112	NC_016930	CTC	2	6	8330	8335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379711751
113	NC_016930	TAT	2	6	8366	8371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711751
114	NC_016930	TAA	2	6	8378	8383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711751
115	NC_016930	CAA	2	6	8447	8452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379711751
116	NC_016930	ATT	2	6	8464	8469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711751
117	NC_016930	TAG	2	6	8471	8476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711751
118	NC_016930	TAA	2	6	8547	8552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711751
119	NC_016930	AGC	3	9	8601	8609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379711751
120	NC_016930	AGG	2	6	8721	8726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379711751
121	NC_016930	TAC	2	6	8795	8800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711751
122	NC_016930	GGT	2	6	9260	9265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379711752
123	NC_016930	AGT	2	6	9341	9346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711752
124	NC_016930	GGT	2	6	9357	9362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379711752
125	NC_016930	GCT	2	6	9369	9374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379711752
126	NC_016930	GAA	2	6	9402	9407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379711752
127	NC_016930	TGA	2	6	9679	9684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711753
128	NC_016930	AGT	2	6	9760	9765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711753
129	NC_016930	TGG	2	6	9781	9786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379711753
130	NC_016930	AAT	2	6	9794	9799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711753
131	NC_016930	TGA	2	6	9817	9822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711753
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