MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia philipii str. 364D chromosome

Total Repeats: 24865

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016930	TCT	2	6	227701	227706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379711959
4502	NC_016930	TCA	3	9	227710	227718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711959
4503	NC_016930	ACA	2	6	227720	227725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379711959
4504	NC_016930	TAC	2	6	227799	227804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711959
4505	NC_016930	GAA	2	6	228160	228165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379711960
4506	NC_016930	ACTG	2	8	228185	228192	25 %	25 %	25 %	25 %	379711960
4507	NC_016930	TA	3	6	228200	228205	50 %	50 %	0 %	0 %	379711960
4508	NC_016930	T	6	6	228227	228232	0 %	100 %	0 %	0 %	379711960
4509	NC_016930	AGTC	2	8	228289	228296	25 %	25 %	25 %	25 %	379711960
4510	NC_016930	ATA	2	6	228326	228331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711961
4511	NC_016930	T	6	6	228410	228415	0 %	100 %	0 %	0 %	379711961
4512	NC_016930	A	6	6	228447	228452	100 %	0 %	0 %	0 %	379711962
4513	NC_016930	T	6	6	228537	228542	0 %	100 %	0 %	0 %	379711962
4514	NC_016930	T	6	6	228549	228554	0 %	100 %	0 %	0 %	379711962
4515	NC_016930	ATCC	2	8	228654	228661	25 %	25 %	0 %	50 %	379711962
4516	NC_016930	TTTC	2	8	228734	228741	0 %	75 %	0 %	25 %	379711962
4517	NC_016930	TCT	2	6	228826	228831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379711962
4518	NC_016930	TA	3	6	228854	228859	50 %	50 %	0 %	0 %	379711962
4519	NC_016930	ATT	2	6	228867	228872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711962
4520	NC_016930	A	6	6	228893	228898	100 %	0 %	0 %	0 %	379711962
4521	NC_016930	T	7	7	228917	228923	0 %	100 %	0 %	0 %	379711962
4522	NC_016930	ATT	2	6	228925	228930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711962
4523	NC_016930	TAA	2	6	228932	228937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711962
4524	NC_016930	ATTAA	2	10	228943	228952	60 %	40 %	0 %	0 %	379711962
4525	NC_016930	TTTA	2	8	228957	228964	25 %	75 %	0 %	0 %	379711962
4526	NC_016930	TTTG	2	8	229263	229270	0 %	75 %	25 %	0 %	379711963
4527	NC_016930	TAT	2	6	229312	229317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711963
4528	NC_016930	ATT	2	6	229373	229378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711963
4529	NC_016930	AT	3	6	229387	229392	50 %	50 %	0 %	0 %	379711963
4530	NC_016930	T	8	8	229401	229408	0 %	100 %	0 %	0 %	379711963
4531	NC_016930	AAT	2	6	229453	229458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711963
4532	NC_016930	ATT	2	6	229481	229486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711963
4533	NC_016930	CAT	2	6	229524	229529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711963
4534	NC_016930	GCC	2	6	229559	229564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379711963
4535	NC_016930	A	7	7	229615	229621	100 %	0 %	0 %	0 %	379711963
4536	NC_016930	TAGG	2	8	229623	229630	25 %	25 %	50 %	0 %	379711963
4537	NC_016930	GGC	2	6	229666	229671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379711963
4538	NC_016930	AT	3	6	229706	229711	50 %	50 %	0 %	0 %	379711963
4539	NC_016930	AAG	2	6	229743	229748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379711963
4540	NC_016930	AAGG	2	8	229838	229845	50 %	0 %	50 %	0 %	379711963
4541	NC_016930	TAG	2	6	230029	230034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711963
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4544	NC_016930	ATT	2	6	230159	230164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711963
4545	NC_016930	GAA	2	6	230165	230170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379711963
4546	NC_016930	ATG	2	6	230177	230182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711963
4547	NC_016930	AAT	2	6	230264	230269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711963
4548	NC_016930	ATCT	2	8	230315	230322	25 %	50 %	0 %	25 %	379711963
4549	NC_016930	GATT	2	8	230364	230371	25 %	50 %	25 %	0 %	379711963
4550	NC_016930	ATA	2	6	230541	230546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711964
4551	NC_016930	TGA	2	6	230548	230553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711964
4552	NC_016930	A	7	7	230557	230563	100 %	0 %	0 %	0 %	379711964
4553	NC_016930	AAT	3	9	230632	230640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711965
4554	NC_016930	T	6	6	230655	230660	0 %	100 %	0 %	0 %	379711965
4555	NC_016930	GTG	2	6	230669	230674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379711965
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4557	NC_016930	ATG	2	6	230788	230793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711965
4558	NC_016930	AGAA	2	8	230802	230809	75 %	0 %	25 %	0 %	379711965
4559	NC_016930	TAA	2	6	230822	230827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711965
4560	NC_016930	TTA	2	6	230891	230896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711965
4561	NC_016930	CAT	3	9	230899	230907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711965
4562	NC_016930	TTA	2	6	230934	230939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711965
4563	NC_016930	ATACT	2	10	231040	231049	40 %	40 %	0 %	20 %	379711966
4564	NC_016930	TTG	2	6	231057	231062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379711966
4565	NC_016930	AAACT	2	10	231072	231081	60 %	20 %	0 %	20 %	379711966
4566	NC_016930	AGAA	2	8	231094	231101	75 %	0 %	25 %	0 %	379711966
4567	NC_016930	TAA	2	6	231131	231136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711966
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4570	NC_016930	TA	3	6	231627	231632	50 %	50 %	0 %	0 %	379711967
4571	NC_016930	CATA	2	8	231666	231673	50 %	25 %	0 %	25 %	379711967
4572	NC_016930	TTC	2	6	231685	231690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379711967
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4588	NC_016930	TGG	2	6	232589	232594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379711969
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4596	NC_016930	A	7	7	233133	233139	100 %	0 %	0 %	0 %	379711969
4597	NC_016930	A	6	6	233250	233255	100 %	0 %	0 %	0 %	379711969
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4603	NC_016930	AT	3	6	233442	233447	50 %	50 %	0 %	0 %	379711969
4604	NC_016930	TTTA	2	8	233530	233537	25 %	75 %	0 %	0 %	379711970
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4609	NC_016930	TAG	3	9	233812	233820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711970
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4612	NC_016930	AT	3	6	233989	233994	50 %	50 %	0 %	0 %	379711971
4613	NC_016930	T	6	6	233994	233999	0 %	100 %	0 %	0 %	379711971
4614	NC_016930	TGC	2	6	234020	234025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379711971
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4617	NC_016930	TTAA	2	8	234101	234108	50 %	50 %	0 %	0 %	379711971
4618	NC_016930	TACCA	2	10	234121	234130	40 %	20 %	0 %	40 %	379711971
4619	NC_016930	TTTG	2	8	234142	234149	0 %	75 %	25 %	0 %	379711971
4620	NC_016930	ATTT	2	8	234198	234205	25 %	75 %	0 %	0 %	379711971
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4625	NC_016930	CTT	2	6	234502	234507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379711972
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4994	NC_016930	ATG	3	9	250445	250453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711986
4995	NC_016930	ATT	2	6	250471	250476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711986
4996	NC_016930	A	6	6	250490	250495	100 %	0 %	0 %	0 %	379711986
4997	NC_016930	TAA	2	6	250497	250502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711986
4998	NC_016930	AAG	2	6	250514	250519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379711986
4999	NC_016930	AAAT	3	12	250574	250585	75 %	25 %	0 %	0 %	379711986
5000	NC_016930	AT	3	6	250588	250593	50 %	50 %	0 %	0 %	379711986

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