MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia canadensis str. CA410 chromosome

Total Repeats: 22132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3003	NC_016929	TAAA	2	8	152689	152696	75 %	25 %	0 %	0 %	379022527
3004	NC_016929	T	6	6	152712	152717	0 %	100 %	0 %	0 %	379022527
3005	NC_016929	TAT	2	6	152771	152776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022527
3006	NC_016929	TA	3	6	152793	152798	50 %	50 %	0 %	0 %	379022527
3007	NC_016929	TAA	2	6	152950	152955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022527
3008	NC_016929	CAT	2	6	152998	153003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022527
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3012	NC_016929	TGC	2	6	153131	153136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379022527
3013	NC_016929	TTA	2	6	153143	153148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022527
3014	NC_016929	AAT	2	6	153182	153187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022527
3015	NC_016929	A	7	7	153192	153198	100 %	0 %	0 %	0 %	379022527
3016	NC_016929	TTAA	2	8	153205	153212	50 %	50 %	0 %	0 %	379022527
3017	NC_016929	TAA	2	6	153543	153548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022528
3018	NC_016929	AT	3	6	153564	153569	50 %	50 %	0 %	0 %	379022528
3019	NC_016929	ATATC	2	10	153651	153660	40 %	40 %	0 %	20 %	379022528
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3021	NC_016929	CGT	2	6	153792	153797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379022529
3022	NC_016929	CGC	2	6	153800	153805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379022529
3023	NC_016929	TGT	2	6	153850	153855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379022529
3024	NC_016929	AAT	2	6	153867	153872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022529
3025	NC_016929	GAAA	2	8	153886	153893	75 %	0 %	25 %	0 %	379022529
3026	NC_016929	A	6	6	153904	153909	100 %	0 %	0 %	0 %	379022529
3027	NC_016929	A	7	7	153937	153943	100 %	0 %	0 %	0 %	379022529
3028	NC_016929	TAA	2	6	153971	153976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022529
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3033	NC_016929	A	6	6	154123	154128	100 %	0 %	0 %	0 %	379022529
3034	NC_016929	TGA	2	6	154129	154134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022529
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3039	NC_016929	TAA	2	6	154226	154231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022529
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3041	NC_016929	A	7	7	154254	154260	100 %	0 %	0 %	0 %	379022529
3042	NC_016929	AAAC	2	8	154292	154299	75 %	0 %	0 %	25 %	379022530
3043	NC_016929	ACT	2	6	154356	154361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022530
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3045	NC_016929	GCT	2	6	154476	154481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379022530
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3053	NC_016929	GAA	3	9	154992	155000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022530
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3055	NC_016929	GTA	2	6	155103	155108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022530
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3057	NC_016929	AAGT	2	8	155155	155162	50 %	25 %	25 %	0 %	379022530
3058	NC_016929	GAA	2	6	155169	155174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022530
3059	NC_016929	ATGA	2	8	155229	155236	50 %	25 %	25 %	0 %	379022530
3060	NC_016929	AT	3	6	155268	155273	50 %	50 %	0 %	0 %	379022530
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3063	NC_016929	ATGC	2	8	155352	155359	25 %	25 %	25 %	25 %	379022530
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3101	NC_016929	A	7	7	157212	157218	100 %	0 %	0 %	0 %	379022532
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3122	NC_016929	AAGA	2	8	158262	158269	75 %	0 %	25 %	0 %	379022534
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3490	NC_016929	TTGT	2	8	175364	175371	0 %	75 %	25 %	0 %	379022543
3491	NC_016929	GAG	2	6	175456	175461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379022543
3492	NC_016929	CCA	2	6	175513	175518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379022543
3493	NC_016929	TGC	2	6	175556	175561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379022543
3494	NC_016929	AAT	2	6	175587	175592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022543
3495	NC_016929	CAA	2	6	175609	175614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379022543
3496	NC_016929	A	6	6	175701	175706	100 %	0 %	0 %	0 %	379022543
3497	NC_016929	AAGAAT	2	12	175715	175726	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379022543
3498	NC_016929	TA	3	6	175949	175954	50 %	50 %	0 %	0 %	379022544
3499	NC_016929	A	6	6	175993	175998	100 %	0 %	0 %	0 %	379022544
3500	NC_016929	TATTAC	2	12	176036	176047	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379022544

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