MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia canadensis str. CA410 chromosome

Total Repeats: 22132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016929	AT	3	6	79708	79713	50 %	50 %	0 %	0 %	379022468
1502	NC_016929	TTTTTA	2	12	79735	79746	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	379022468
1503	NC_016929	TG	3	6	79760	79765	0 %	50 %	50 %	0 %	379022468
1504	NC_016929	AT	3	6	79794	79799	50 %	50 %	0 %	0 %	379022468
1505	NC_016929	AATA	2	8	79938	79945	75 %	25 %	0 %	0 %	379022469
1506	NC_016929	AT	3	6	79989	79994	50 %	50 %	0 %	0 %	379022469
1507	NC_016929	TCT	2	6	80029	80034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022469
1508	NC_016929	GAA	2	6	80101	80106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022469
1509	NC_016929	ATT	2	6	80163	80168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022469
1510	NC_016929	ATTTA	2	10	80196	80205	40 %	60 %	0 %	0 %	379022469
1511	NC_016929	AAC	2	6	80222	80227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379022469
1512	NC_016929	TAT	2	6	80237	80242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022469
1513	NC_016929	TGAT	2	8	80327	80334	25 %	50 %	25 %	0 %	379022469
1514	NC_016929	A	7	7	80362	80368	100 %	0 %	0 %	0 %	379022469
1515	NC_016929	AGA	2	6	80713	80718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022470
1516	NC_016929	TGC	2	6	80812	80817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379022470
1517	NC_016929	TCTA	2	8	80842	80849	25 %	50 %	0 %	25 %	379022470
1518	NC_016929	ACGGAT	2	12	80855	80866	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379022470
1519	NC_016929	A	6	6	80868	80873	100 %	0 %	0 %	0 %	379022470
1520	NC_016929	GAT	2	6	80897	80902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022470
1521	NC_016929	AG	3	6	80924	80929	50 %	0 %	50 %	0 %	379022470
1522	NC_016929	AATT	2	8	80931	80938	50 %	50 %	0 %	0 %	379022470
1523	NC_016929	A	6	6	81047	81052	100 %	0 %	0 %	0 %	379022470
1524	NC_016929	ACAA	2	8	81062	81069	75 %	0 %	0 %	25 %	379022470
1525	NC_016929	TA	3	6	81144	81149	50 %	50 %	0 %	0 %	379022470
1526	NC_016929	ATT	2	6	81176	81181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022470
1527	NC_016929	TATT	2	8	81186	81193	25 %	75 %	0 %	0 %	379022470
1528	NC_016929	A	6	6	81206	81211	100 %	0 %	0 %	0 %	379022470
1529	NC_016929	TGC	2	6	81220	81225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379022470
1530	NC_016929	ATG	2	6	81282	81287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022470
1531	NC_016929	ACA	2	6	81292	81297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379022470
1532	NC_016929	TAAT	2	8	81323	81330	50 %	50 %	0 %	0 %	379022470
1533	NC_016929	CTT	2	6	81342	81347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022471
1534	NC_016929	TAT	2	6	81393	81398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022471
1535	NC_016929	AAT	2	6	81416	81421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022471
1536	NC_016929	AATA	2	8	81436	81443	75 %	25 %	0 %	0 %	379022471
1537	NC_016929	TAA	2	6	81445	81450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022471
1538	NC_016929	TAA	2	6	81502	81507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022471
1539	NC_016929	TA	3	6	81542	81547	50 %	50 %	0 %	0 %	379022471
1540	NC_016929	TAG	2	6	81567	81572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022471
1541	NC_016929	TAA	2	6	81607	81612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022471
1542	NC_016929	TGT	2	6	81616	81621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379022471
1543	NC_016929	AGA	2	6	81631	81636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022471
1544	NC_016929	AGAA	2	8	81640	81647	75 %	0 %	25 %	0 %	379022471
1545	NC_016929	AC	3	6	81674	81679	50 %	0 %	0 %	50 %	379022471
1546	NC_016929	GAT	2	6	81752	81757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022471
1547	NC_016929	AAT	2	6	81773	81778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022471
1548	NC_016929	ATA	2	6	81792	81797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022471
1549	NC_016929	AGA	3	9	81826	81834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022471
1550	NC_016929	A	6	6	81916	81921	100 %	0 %	0 %	0 %	379022471
1551	NC_016929	AAC	2	6	82016	82021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379022471
1552	NC_016929	TTTC	2	8	82037	82044	0 %	75 %	0 %	25 %	379022471
1553	NC_016929	TA	3	6	82049	82054	50 %	50 %	0 %	0 %	379022471
1554	NC_016929	TA	3	6	82056	82061	50 %	50 %	0 %	0 %	379022471
1555	NC_016929	TTA	2	6	82137	82142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022471
1556	NC_016929	CTA	2	6	82471	82476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022472
1557	NC_016929	TTTA	2	8	82478	82485	25 %	75 %	0 %	0 %	379022472
1558	NC_016929	TAG	2	6	82576	82581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022472
1559	NC_016929	TAG	2	6	82585	82590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022472
1560	NC_016929	CTA	2	6	82594	82599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022472
1561	NC_016929	ATT	2	6	82605	82610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022472
1562	NC_016929	AT	3	6	82649	82654	50 %	50 %	0 %	0 %	379022472
1563	NC_016929	AT	3	6	82689	82694	50 %	50 %	0 %	0 %	379022472
1564	NC_016929	GTT	2	6	82702	82707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379022472
1565	NC_016929	T	6	6	82706	82711	0 %	100 %	0 %	0 %	379022472
1566	NC_016929	TCA	2	6	82720	82725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022472
1567	NC_016929	TCA	2	6	82728	82733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022472
1568	NC_016929	AAG	2	6	82921	82926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022472
1569	NC_016929	T	6	6	82975	82980	0 %	100 %	0 %	0 %	379022472
1570	NC_016929	CCTATA	2	12	84755	84766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022473
1571	NC_016929	CTA	2	6	84816	84821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022473
1572	NC_016929	GATT	2	8	84873	84880	25 %	50 %	25 %	0 %	379022473
1573	NC_016929	ATC	2	6	84886	84891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022473
1574	NC_016929	TTGC	2	8	84957	84964	0 %	50 %	25 %	25 %	379022473
1575	NC_016929	TA	3	6	84997	85002	50 %	50 %	0 %	0 %	379022473
1576	NC_016929	AAT	2	6	85179	85184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022473
1577	NC_016929	TAG	3	9	85197	85205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022473
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1580	NC_016929	A	6	6	85299	85304	100 %	0 %	0 %	0 %	379022473
1581	NC_016929	CTTC	2	8	85334	85341	0 %	50 %	0 %	50 %	379022473
1582	NC_016929	ACT	2	6	85411	85416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022473
1583	NC_016929	T	6	6	85453	85458	0 %	100 %	0 %	0 %	379022473
1584	NC_016929	AATG	2	8	85609	85616	50 %	25 %	25 %	0 %	379022474
1585	NC_016929	GGTT	2	8	85646	85653	0 %	50 %	50 %	0 %	379022474
1586	NC_016929	TTAGT	2	10	85659	85668	20 %	60 %	20 %	0 %	379022474
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1590	NC_016929	T	6	6	85748	85753	0 %	100 %	0 %	0 %	379022474
1591	NC_016929	AGT	2	6	85754	85759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022474
1592	NC_016929	TAC	2	6	85767	85772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022474
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1594	NC_016929	AGT	2	6	85811	85816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022474
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1596	NC_016929	ATT	4	12	85840	85851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022474
1597	NC_016929	TTTA	2	8	85930	85937	25 %	75 %	0 %	0 %	379022474
1598	NC_016929	T	6	6	85955	85960	0 %	100 %	0 %	0 %	379022474
1599	NC_016929	ATT	2	6	85973	85978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022474
1600	NC_016929	GGTG	2	8	85986	85993	0 %	25 %	75 %	0 %	379022474
1601	NC_016929	TAG	2	6	86001	86006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022474
1602	NC_016929	TTA	2	6	86022	86027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022474
1603	NC_016929	ATT	2	6	86108	86113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022474
1604	NC_016929	A	6	6	86117	86122	100 %	0 %	0 %	0 %	379022474
1605	NC_016929	TAA	2	6	86127	86132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022474
1606	NC_016929	GAT	2	6	86140	86145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022474
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1608	NC_016929	TAT	2	6	86241	86246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022474
1609	NC_016929	GTA	2	6	86256	86261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022474
1610	NC_016929	ATA	2	6	86270	86275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022474
1611	NC_016929	TTC	2	6	86279	86284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022474
1612	NC_016929	AGC	2	6	86362	86367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022474
1613	NC_016929	TAA	3	9	86418	86426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022474
1614	NC_016929	TTAT	2	8	86438	86445	25 %	75 %	0 %	0 %	379022474
1615	NC_016929	A	8	8	86457	86464	100 %	0 %	0 %	0 %	379022474
1616	NC_016929	TAT	2	6	86545	86550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022475
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1622	NC_016929	GGA	2	6	86664	86669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379022475
1623	NC_016929	T	6	6	86673	86678	0 %	100 %	0 %	0 %	379022475
1624	NC_016929	ATT	2	6	86726	86731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022475
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1626	NC_016929	GTA	2	6	86914	86919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022475
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