MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia canadensis str. CA410 chromosome

Total Repeats: 22132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_016929	AAG	2	6	54482	54487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022448
1003	NC_016929	GAA	2	6	54576	54581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022448
1004	NC_016929	TTAG	2	8	54670	54677	25 %	50 %	25 %	0 %	379022448
1005	NC_016929	ATTT	2	8	54761	54768	25 %	75 %	0 %	0 %	379022448
1006	NC_016929	TATT	2	8	54823	54830	25 %	75 %	0 %	0 %	379022448
1007	NC_016929	TAA	2	6	54852	54857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022448
1008	NC_016929	TAA	2	6	54893	54898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022448
1009	NC_016929	AT	3	6	54906	54911	50 %	50 %	0 %	0 %	379022448
1010	NC_016929	AT	3	6	54932	54937	50 %	50 %	0 %	0 %	379022448
1011	NC_016929	ATG	2	6	54989	54994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022448
1012	NC_016929	ATT	2	6	55118	55123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022448
1013	NC_016929	ATA	2	6	55177	55182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022448
1014	NC_016929	A	7	7	55230	55236	100 %	0 %	0 %	0 %	379022448
1015	NC_016929	GGTT	2	8	55303	55310	0 %	50 %	50 %	0 %	379022448
1016	NC_016929	TCT	2	6	55331	55336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022448
1017	NC_016929	T	6	6	55347	55352	0 %	100 %	0 %	0 %	379022448
1018	NC_016929	GTT	2	6	55410	55415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379022448
1019	NC_016929	A	7	7	55453	55459	100 %	0 %	0 %	0 %	379022448
1020	NC_016929	ATAG	2	8	55480	55487	50 %	25 %	25 %	0 %	379022448
1021	NC_016929	A	6	6	55491	55496	100 %	0 %	0 %	0 %	379022448
1022	NC_016929	GAT	2	6	55507	55512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022448
1023	NC_016929	TA	3	6	55544	55549	50 %	50 %	0 %	0 %	379022448
1024	NC_016929	AAAAAG	2	12	55550	55561	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	379022448
1025	NC_016929	GTT	2	6	55577	55582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379022448
1026	NC_016929	TA	4	8	55617	55624	50 %	50 %	0 %	0 %	379022448
1027	NC_016929	CTA	3	9	55700	55708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022448
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1029	NC_016929	T	7	7	55868	55874	0 %	100 %	0 %	0 %	379022448
1030	NC_016929	TAG	2	6	55884	55889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022448
1031	NC_016929	AT	3	6	55909	55914	50 %	50 %	0 %	0 %	379022448
1032	NC_016929	AAT	2	6	55924	55929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022448
1033	NC_016929	TCTA	2	8	55932	55939	25 %	50 %	0 %	25 %	379022448
1034	NC_016929	CAA	2	6	55945	55950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379022448
1035	NC_016929	TAT	2	6	55951	55956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022448
1036	NC_016929	TAA	2	6	55959	55964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022448
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1041	NC_016929	TTA	2	6	56212	56217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022449
1042	NC_016929	CTA	2	6	56223	56228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022449
1043	NC_016929	A	7	7	56228	56234	100 %	0 %	0 %	0 %	379022449
1044	NC_016929	TTA	2	6	56259	56264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022449
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1047	NC_016929	TAG	2	6	56431	56436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022449
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1049	NC_016929	TGC	2	6	56456	56461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379022449
1050	NC_016929	T	6	6	56462	56467	0 %	100 %	0 %	0 %	379022449
1051	NC_016929	CAT	2	6	56471	56476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022449
1052	NC_016929	AGA	2	6	56787	56792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022450
1053	NC_016929	ATA	2	6	56869	56874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022450
1054	NC_016929	ATTTT	2	10	57322	57331	20 %	80 %	0 %	0 %	379022451
1055	NC_016929	ATT	2	6	57367	57372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022451
1056	NC_016929	GTT	2	6	57382	57387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379022451
1057	NC_016929	AG	4	8	57403	57410	50 %	0 %	50 %	0 %	379022451
1058	NC_016929	TTG	2	6	57430	57435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379022451
1059	NC_016929	A	6	6	57443	57448	100 %	0 %	0 %	0 %	379022451
1060	NC_016929	TAT	2	6	57471	57476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022451
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1062	NC_016929	CAT	2	6	57603	57608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022451
1063	NC_016929	TGC	2	6	57616	57621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379022451
1064	NC_016929	T	6	6	57625	57630	0 %	100 %	0 %	0 %	379022451
1065	NC_016929	A	6	6	57677	57682	100 %	0 %	0 %	0 %	379022451
1066	NC_016929	ATT	2	6	57707	57712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022451
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1072	NC_016929	TTC	2	6	58867	58872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022452
1073	NC_016929	ATG	2	6	58884	58889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022452
1074	NC_016929	TTA	2	6	58899	58904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022452
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1076	NC_016929	AT	3	6	58985	58990	50 %	50 %	0 %	0 %	379022452
1077	NC_016929	TAC	2	6	58993	58998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022452
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1084	NC_016929	TAT	3	9	59453	59461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022452
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1090	NC_016929	GAT	2	6	59600	59605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022452
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1096	NC_016929	TTAC	2	8	59856	59863	25 %	50 %	0 %	25 %	379022452
1097	NC_016929	TGC	2	6	59867	59872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379022452
1098	NC_016929	T	6	6	59874	59879	0 %	100 %	0 %	0 %	379022452
1099	NC_016929	T	6	6	59889	59894	0 %	100 %	0 %	0 %	379022452
1100	NC_016929	AT	3	6	60032	60037	50 %	50 %	0 %	0 %	379022452
1101	NC_016929	TAT	2	6	60119	60124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022452
1102	NC_016929	TTTAT	2	10	60138	60147	20 %	80 %	0 %	0 %	379022452
1103	NC_016929	GTAATA	2	12	60201	60212	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379022452
1104	NC_016929	AT	3	6	60219	60224	50 %	50 %	0 %	0 %	379022452
1105	NC_016929	TAAA	2	8	60238	60245	75 %	25 %	0 %	0 %	379022452
1106	NC_016929	A	7	7	60404	60410	100 %	0 %	0 %	0 %	379022453
1107	NC_016929	TAT	3	9	60443	60451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022453
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1109	NC_016929	TTGG	2	8	60541	60548	0 %	50 %	50 %	0 %	379022453
1110	NC_016929	CTT	2	6	60559	60564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022453
1111	NC_016929	GT	3	6	60588	60593	0 %	50 %	50 %	0 %	379022453
1112	NC_016929	TTA	2	6	60601	60606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022453
1113	NC_016929	TTG	2	6	60652	60657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379022453
1114	NC_016929	T	6	6	60689	60694	0 %	100 %	0 %	0 %	379022453
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1120	NC_016929	TA	3	6	60943	60948	50 %	50 %	0 %	0 %	379022453
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1123	NC_016929	GAA	2	6	60993	60998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022453
1124	NC_016929	T	6	6	61069	61074	0 %	100 %	0 %	0 %	379022453
1125	NC_016929	TGTT	2	8	61111	61118	0 %	75 %	25 %	0 %	379022453
1126	NC_016929	TA	3	6	61119	61124	50 %	50 %	0 %	0 %	379022453
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