MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia canadensis str. CA410 chromosome

Total Repeats: 22132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_016929	TAA	2	6	25910	25915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022426
503	NC_016929	TAG	2	6	25942	25947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022426
504	NC_016929	ACTA	2	8	26158	26165	50 %	25 %	0 %	25 %	379022427
505	NC_016929	CTA	2	6	26168	26173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022427
506	NC_016929	TA	3	6	26214	26219	50 %	50 %	0 %	0 %	379022427
507	NC_016929	T	6	6	26316	26321	0 %	100 %	0 %	0 %	379022427
508	NC_016929	AT	3	6	26362	26367	50 %	50 %	0 %	0 %	379022427
509	NC_016929	TATCA	2	10	26388	26397	40 %	40 %	0 %	20 %	379022427
510	NC_016929	ATT	2	6	26433	26438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022427
511	NC_016929	TAG	2	6	26498	26503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022427
512	NC_016929	T	6	6	26614	26619	0 %	100 %	0 %	0 %	379022427
513	NC_016929	CTT	2	6	26624	26629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022427
514	NC_016929	CATATA	2	12	26672	26683	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379022427
515	NC_016929	ATA	2	6	26739	26744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022427
516	NC_016929	TAA	2	6	26909	26914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022427
517	NC_016929	AT	3	6	26920	26925	50 %	50 %	0 %	0 %	379022427
518	NC_016929	ATC	2	6	26943	26948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022427
519	NC_016929	CTG	2	6	26966	26971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379022427
520	NC_016929	AAGC	2	8	27002	27009	50 %	0 %	25 %	25 %	379022427
521	NC_016929	AT	3	6	27069	27074	50 %	50 %	0 %	0 %	379022427
522	NC_016929	GTA	2	6	27104	27109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022427
523	NC_016929	ATA	2	6	27131	27136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022427
524	NC_016929	TTG	2	6	27222	27227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379022427
525	NC_016929	TAT	2	6	27242	27247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022427
526	NC_016929	CAT	3	9	27267	27275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022427
527	NC_016929	TAT	2	6	27314	27319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022427
528	NC_016929	AGC	2	6	27349	27354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022427
529	NC_016929	TTA	2	6	27355	27360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022427
530	NC_016929	TATTT	2	10	27372	27381	20 %	80 %	0 %	0 %	379022427
531	NC_016929	CTT	2	6	27386	27391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022427
532	NC_016929	T	6	6	27487	27492	0 %	100 %	0 %	0 %	379022427
533	NC_016929	T	7	7	27512	27518	0 %	100 %	0 %	0 %	379022427
534	NC_016929	TGG	2	6	27648	27653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379022427
535	NC_016929	TCA	2	6	27733	27738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022427
536	NC_016929	TTTG	2	8	27751	27758	0 %	75 %	25 %	0 %	379022427
537	NC_016929	TAG	2	6	27767	27772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022427
538	NC_016929	TAT	2	6	28489	28494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022428
539	NC_016929	A	6	6	28581	28586	100 %	0 %	0 %	0 %	379022428
540	NC_016929	ATC	2	6	28611	28616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022428
541	NC_016929	TTAG	2	8	28660	28667	25 %	50 %	25 %	0 %	379022428
542	NC_016929	TAAT	2	8	28703	28710	50 %	50 %	0 %	0 %	379022428
543	NC_016929	AATT	2	8	28812	28819	50 %	50 %	0 %	0 %	379022428
544	NC_016929	TAA	2	6	28853	28858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022428
545	NC_016929	T	6	6	28889	28894	0 %	100 %	0 %	0 %	379022428
546	NC_016929	ATT	2	6	28947	28952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022428
547	NC_016929	TGC	2	6	28960	28965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379022428
548	NC_016929	GAT	2	6	29031	29036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022428
549	NC_016929	ATC	2	6	29049	29054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022428
550	NC_016929	TCT	2	6	29062	29067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022428
551	NC_016929	TC	3	6	29082	29087	0 %	50 %	0 %	50 %	379022428
552	NC_016929	ATA	2	6	29094	29099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022428
553	NC_016929	TCT	2	6	29166	29171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022428
554	NC_016929	TTCC	2	8	29195	29202	0 %	50 %	0 %	50 %	379022428
555	NC_016929	ACCAT	2	10	29216	29225	40 %	20 %	0 %	40 %	379022428
556	NC_016929	TTA	2	6	29248	29253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022428
557	NC_016929	TTC	2	6	29282	29287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022428
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559	NC_016929	TCT	2	6	29368	29373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022428
560	NC_016929	AT	3	6	29384	29389	50 %	50 %	0 %	0 %	379022428
561	NC_016929	TAT	2	6	29495	29500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022428
562	NC_016929	ACC	2	6	29610	29615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379022429
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564	NC_016929	T	7	7	29639	29645	0 %	100 %	0 %	0 %	379022429
565	NC_016929	T	6	6	29649	29654	0 %	100 %	0 %	0 %	379022429
566	NC_016929	GCC	2	6	29694	29699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379022429
567	NC_016929	T	6	6	29706	29711	0 %	100 %	0 %	0 %	379022429
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583	NC_016929	ACTT	2	8	31942	31949	25 %	50 %	0 %	25 %	379022431
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591	NC_016929	AT	3	6	32219	32224	50 %	50 %	0 %	0 %	379022431
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603	NC_016929	AT	3	6	32679	32684	50 %	50 %	0 %	0 %	379022432
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613	NC_016929	CT	3	6	33093	33098	0 %	50 %	0 %	50 %	379022432
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617	NC_016929	ATA	2	6	33619	33624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022433
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620	NC_016929	CAT	2	6	34101	34106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022434
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626	NC_016929	AT	3	6	34307	34312	50 %	50 %	0 %	0 %	379022434
627	NC_016929	T	6	6	34327	34332	0 %	100 %	0 %	0 %	379022434
628	NC_016929	TA	4	8	34380	34387	50 %	50 %	0 %	0 %	379022434
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