MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 15006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016915	ATT	2	6	13	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018504
2	NC_016915	GCA	2	6	58	63	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018504
3	NC_016915	TAT	2	6	182	187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018504
4	NC_016915	ATT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018504
5	NC_016915	ATG	2	6	392	397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018504
6	NC_016915	ATA	2	6	433	438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018504
7	NC_016915	GTA	2	6	574	579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018504
8	NC_016915	TTA	2	6	587	592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018504
9	NC_016915	CAG	2	6	767	772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018504
10	NC_016915	TAA	2	6	776	781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018504
11	NC_016915	ATA	2	6	812	817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018504
12	NC_016915	ATA	2	6	1196	1201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018505
13	NC_016915	TGA	2	6	1255	1260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018505
14	NC_016915	GTA	2	6	1293	1298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018505
15	NC_016915	CAA	2	6	1355	1360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018505
16	NC_016915	TAA	2	6	1384	1389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018505
17	NC_016915	TCT	2	6	1503	1508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018506
18	NC_016915	ATA	3	9	1767	1775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018506
19	NC_016915	GTA	2	6	1833	1838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018506
20	NC_016915	TGA	2	6	1933	1938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018506
21	NC_016915	GAA	2	6	1990	1995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018506
22	NC_016915	AAT	2	6	2020	2025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018506
23	NC_016915	AAG	2	6	2037	2042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018506
24	NC_016915	TTA	2	6	2075	2080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018506
25	NC_016915	CAA	3	9	2138	2146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018506
26	NC_016915	AGC	2	6	2390	2395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018507
27	NC_016915	ATA	2	6	2435	2440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018507
28	NC_016915	ATA	2	6	2573	2578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018507
29	NC_016915	TAA	2	6	2604	2609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018507
30	NC_016915	ATG	2	6	2834	2839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018507
31	NC_016915	TAT	2	6	2854	2859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018507
32	NC_016915	TTA	2	6	2868	2873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018507
33	NC_016915	CTC	2	6	3065	3070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379018508
34	NC_016915	ATT	2	6	3076	3081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018508
35	NC_016915	ATT	2	6	3089	3094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018508
36	NC_016915	ATT	2	6	3202	3207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018508
37	NC_016915	AGA	2	6	3375	3380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018508
38	NC_016915	AGA	2	6	3390	3395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018508
39	NC_016915	AGC	2	6	3405	3410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018508
40	NC_016915	TGC	2	6	3417	3422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018508
41	NC_016915	ATT	2	6	3608	3613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018508
42	NC_016915	GTT	2	6	3644	3649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018508
43	NC_016915	GAG	2	6	3685	3690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379018508
44	NC_016915	TAT	2	6	3846	3851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018508
45	NC_016915	GCA	2	6	3874	3879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018508
46	NC_016915	AGA	2	6	3972	3977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018508
47	NC_016915	CTA	2	6	4067	4072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018508
48	NC_016915	TAT	2	6	4123	4128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018508
49	NC_016915	TTA	2	6	4129	4134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018508
50	NC_016915	TGT	2	6	4149	4154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018508
51	NC_016915	ATA	2	6	4343	4348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018508
52	NC_016915	GGC	2	6	4594	4599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379018508
53	NC_016915	GCA	2	6	4618	4623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018508
54	NC_016915	GAA	2	6	4717	4722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018508
55	NC_016915	AAG	2	6	4748	4753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018508
56	NC_016915	AAT	2	6	4759	4764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018508
57	NC_016915	GAA	2	6	4765	4770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018508
58	NC_016915	TAA	2	6	4785	4790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018508
59	NC_016915	CTA	2	6	4809	4814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018508
60	NC_016915	GAG	2	6	4858	4863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379018508
61	NC_016915	AAG	2	6	5201	5206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018508
62	NC_016915	ACG	2	6	5210	5215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018508
63	NC_016915	ATA	2	6	5237	5242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018508
64	NC_016915	ATT	2	6	5288	5293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018508
65	NC_016915	TAA	2	6	5310	5315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018508
66	NC_016915	GAT	2	6	5329	5334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018508
67	NC_016915	TGC	2	6	5367	5372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018508
68	NC_016915	ATT	2	6	5411	5416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018508
69	NC_016915	TGC	2	6	5424	5429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018508
70	NC_016915	CTA	2	6	5519	5524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018508
71	NC_016915	AGT	2	6	5556	5561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018508
72	NC_016915	CGC	2	6	5582	5587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379018508
73	NC_016915	TTG	2	6	5618	5623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018508
74	NC_016915	TTA	2	6	5647	5652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018508
75	NC_016915	ATA	2	6	5669	5674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018508
76	NC_016915	TAA	2	6	5738	5743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018508
77	NC_016915	ATA	2	6	5761	5766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018508
78	NC_016915	GAA	2	6	5767	5772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018508
79	NC_016915	ATA	2	6	5815	5820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018508
80	NC_016915	ATG	2	6	5848	5853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018508
81	NC_016915	CTT	2	6	6102	6107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018509
82	NC_016915	TCA	2	6	6120	6125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018509
83	NC_016915	ATA	2	6	6129	6134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018509
84	NC_016915	TGT	2	6	6211	6216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018509
85	NC_016915	GAT	2	6	6238	6243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018509
86	NC_016915	AAC	3	9	6263	6271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018509
87	NC_016915	AAT	2	6	6289	6294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018509
88	NC_016915	CAA	2	6	6314	6319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018509
89	NC_016915	CTA	3	9	6468	6476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018510
90	NC_016915	ATT	2	6	6515	6520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018510
91	NC_016915	TTC	2	6	6581	6586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018510
92	NC_016915	ATC	2	6	6732	6737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018510
93	NC_016915	CCG	2	6	6780	6785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379018510
94	NC_016915	ATT	2	6	6786	6791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018510
95	NC_016915	TAC	2	6	6842	6847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018510
96	NC_016915	ATT	2	6	6848	6853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018510
97	NC_016915	ATT	3	9	6899	6907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018510
98	NC_016915	TCA	2	6	6919	6924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018510
99	NC_016915	CCG	2	6	6927	6932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379018510
100	NC_016915	TAT	2	6	6973	6978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018510
101	NC_016915	ATT	2	6	6987	6992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018510
102	NC_016915	TAC	2	6	7097	7102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018510
103	NC_016915	GTA	2	6	7212	7217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018510
104	NC_016915	CTT	2	6	7429	7434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018511
105	NC_016915	TAG	2	6	7441	7446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018511
106	NC_016915	AGC	2	6	7472	7477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018511
107	NC_016915	CTA	2	6	7618	7623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018511
108	NC_016915	ATA	3	9	7920	7928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018512
109	NC_016915	ATA	2	6	7947	7952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018512
110	NC_016915	GCC	2	6	7967	7972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379018512
111	NC_016915	TGC	2	6	8098	8103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018512
112	NC_016915	ATA	2	6	8130	8135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018512
113	NC_016915	TAG	2	6	8233	8238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018512
114	NC_016915	ATT	2	6	8258	8263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018512
115	NC_016915	ACG	2	6	8364	8369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018512
116	NC_016915	TCG	2	6	8370	8375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018512
117	NC_016915	TGT	2	6	8403	8408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018512
118	NC_016915	CTC	2	6	8437	8442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379018512
119	NC_016915	TAT	2	6	8473	8478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018512
120	NC_016915	TAA	2	6	8485	8490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018512
121	NC_016915	CAA	2	6	8554	8559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018512
122	NC_016915	ATT	2	6	8571	8576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018512
123	NC_016915	TAG	2	6	8578	8583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018512
124	NC_016915	TAA	2	6	8654	8659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018512
125	NC_016915	AGC	3	9	8708	8716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018512
126	NC_016915	AGG	2	6	8828	8833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379018512
127	NC_016915	TAC	2	6	8902	8907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018512
128	NC_016915	GGT	2	6	9370	9375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379018513
129	NC_016915	AGT	2	6	9451	9456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018513
130	NC_016915	GGT	2	6	9467	9472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379018513
131	NC_016915	GCT	2	6	9479	9484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018513
132	NC_016915	GAA	2	6	9512	9517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018513
133	NC_016915	TGA	2	6	9780	9785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018514
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136	NC_016915	AAT	2	6	9895	9900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018514
137	NC_016915	TGA	2	6	9918	9923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018514
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140	NC_016915	TAC	3	9	10050	10058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018514
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142	NC_016915	GTT	2	6	10115	10120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018514
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152	NC_016915	ATT	3	9	11693	11701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018515
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154	NC_016915	AAT	2	6	11867	11872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018516
155	NC_016915	ATT	2	6	11929	11934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018516
156	NC_016915	AAT	2	6	11944	11949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018516
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163	NC_016915	TTC	2	6	12394	12399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018517
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165	NC_016915	GTG	2	6	12563	12568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379018517
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257	NC_016915	TAA	2	6	20792	20797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018527
258	NC_016915	TAC	2	6	20862	20867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018527
259	NC_016915	TAC	2	6	20889	20894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018527
260	NC_016915	CAT	2	6	20909	20914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018527
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