MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 24177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016915	AAT	2	6	203083	203088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018696
4002	NC_016915	TTA	2	6	203167	203172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018696
4003	NC_016915	TCT	2	6	203197	203202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018696
4004	NC_016915	CATT	2	8	203329	203336	25 %	50 %	0 %	25 %	379018696
4005	NC_016915	TTTA	2	8	203352	203359	25 %	75 %	0 %	0 %	379018696
4006	NC_016915	AAT	2	6	203368	203373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018696
4007	NC_016915	CATT	2	8	203410	203417	25 %	50 %	0 %	25 %	379018696
4008	NC_016915	TGC	2	6	203418	203423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018696
4009	NC_016915	CTA	2	6	203456	203461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018696
4010	NC_016915	CAT	2	6	203471	203476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018696
4011	NC_016915	TCA	2	6	203563	203568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018696
4012	NC_016915	TAA	2	6	203583	203588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018696
4013	NC_016915	CTT	3	9	203621	203629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018696
4014	NC_016915	CGC	2	6	203651	203656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379018696
4015	NC_016915	ATT	2	6	203686	203691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018696
4016	NC_016915	CAAG	2	8	203705	203712	50 %	0 %	25 %	25 %	379018696
4017	NC_016915	ATG	2	6	203749	203754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018696
4018	NC_016915	GAATT	2	10	203759	203768	40 %	40 %	20 %	0 %	379018696
4019	NC_016915	CGC	2	6	203804	203809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379018696
4020	NC_016915	T	6	6	203902	203907	0 %	100 %	0 %	0 %	379018696
4021	NC_016915	GCT	2	6	203917	203922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018696
4022	NC_016915	TGA	2	6	203931	203936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018696
4023	NC_016915	TGAT	2	8	204009	204016	25 %	50 %	25 %	0 %	379018696
4024	NC_016915	AAT	2	6	204173	204178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018696
4025	NC_016915	ATTT	3	12	204200	204211	25 %	75 %	0 %	0 %	379018696
4026	NC_016915	AAGCCC	2	12	204219	204230	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	379018696
4027	NC_016915	TGC	2	6	204288	204293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018696
4028	NC_016915	TGC	2	6	204324	204329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018696
4029	NC_016915	TAC	2	6	204338	204343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018696
4030	NC_016915	A	6	6	204350	204355	100 %	0 %	0 %	0 %	379018696
4031	NC_016915	AT	3	6	204430	204435	50 %	50 %	0 %	0 %	379018696
4032	NC_016915	CAG	2	6	204577	204582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018697
4033	NC_016915	TAAA	2	8	204625	204632	75 %	25 %	0 %	0 %	379018697
4034	NC_016915	ATA	2	6	204645	204650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018697
4035	NC_016915	TAA	2	6	204704	204709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018697
4036	NC_016915	ATT	2	6	204734	204739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018697
4037	NC_016915	ACG	2	6	204758	204763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018697
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4040	NC_016915	ATA	2	6	204828	204833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018697
4041	NC_016915	GAA	2	6	204954	204959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018697
4042	NC_016915	TAA	2	6	204981	204986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018697
4043	NC_016915	AGT	2	6	205050	205055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018697
4044	NC_016915	ATA	2	6	205080	205085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018697
4045	NC_016915	AAT	2	6	205094	205099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018697
4046	NC_016915	T	6	6	205140	205145	0 %	100 %	0 %	0 %	379018697
4047	NC_016915	CAT	2	6	205220	205225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018697
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4049	NC_016915	AGC	2	6	205403	205408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018697
4050	NC_016915	CTG	2	6	205429	205434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018697
4051	NC_016915	GAA	2	6	205449	205454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018697
4052	NC_016915	ATC	2	6	205478	205483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018697
4053	NC_016915	AAC	2	6	205516	205521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018697
4054	NC_016915	GCT	2	6	205752	205757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018697
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4057	NC_016915	ATT	2	6	205926	205931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018698
4058	NC_016915	CAA	2	6	205932	205937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018698
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4061	NC_016915	A	6	6	206149	206154	100 %	0 %	0 %	0 %	379018698
4062	NC_016915	TCT	2	6	206168	206173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018698
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4065	NC_016915	CT	3	6	206560	206565	0 %	50 %	0 %	50 %	379018699
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4070	NC_016915	CCTG	2	8	206652	206659	0 %	25 %	25 %	50 %	379018699
4071	NC_016915	CTAA	2	8	206689	206696	50 %	25 %	0 %	25 %	379018699
4072	NC_016915	ATTTT	2	10	206704	206713	20 %	80 %	0 %	0 %	379018699
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4107	NC_016915	ATT	2	6	208853	208858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018702
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4111	NC_016915	AATTT	2	10	208919	208928	40 %	60 %	0 %	0 %	379018702
4112	NC_016915	TAG	2	6	208979	208984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018703
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4114	NC_016915	TATT	2	8	209026	209033	25 %	75 %	0 %	0 %	379018703
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4493	NC_016915	GAT	2	6	227580	227585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018720
4494	NC_016915	TAAATT	2	12	227621	227632	50 %	50 %	0 %	0 %	379018720
4495	NC_016915	GCC	2	6	227637	227642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379018720
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4497	NC_016915	ATG	2	6	227891	227896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018720
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