MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 24177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_016915	A	7	7	178127	178133	100 %	0 %	0 %	0 %	379018679
3503	NC_016915	GCT	2	6	178530	178535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018680
3504	NC_016915	CCT	2	6	178551	178556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379018680
3505	NC_016915	GCA	2	6	178593	178598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018680
3506	NC_016915	ATG	2	6	178615	178620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018680
3507	NC_016915	TAG	2	6	178679	178684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018680
3508	NC_016915	TAAAA	2	10	178694	178703	80 %	20 %	0 %	0 %	379018680
3509	NC_016915	CTC	2	6	178705	178710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379018680
3510	NC_016915	CTT	2	6	178714	178719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018680
3511	NC_016915	CTA	2	6	178762	178767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018680
3512	NC_016915	A	6	6	178767	178772	100 %	0 %	0 %	0 %	379018680
3513	NC_016915	GTA	2	6	178779	178784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018680
3514	NC_016915	GAT	2	6	178800	178805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018680
3515	NC_016915	A	6	6	178847	178852	100 %	0 %	0 %	0 %	379018680
3516	NC_016915	AGC	2	6	178859	178864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018680
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3518	NC_016915	TGC	2	6	178886	178891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018680
3519	NC_016915	AGT	2	6	178907	178912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018680
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3521	NC_016915	AAGA	2	8	178937	178944	75 %	0 %	25 %	0 %	379018681
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3523	NC_016915	A	7	7	178970	178976	100 %	0 %	0 %	0 %	379018681
3524	NC_016915	TA	3	6	179013	179018	50 %	50 %	0 %	0 %	379018681
3525	NC_016915	CAT	2	6	179052	179057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018681
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3529	NC_016915	TAG	2	6	179235	179240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018681
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3532	NC_016915	ATGT	2	8	179289	179296	25 %	50 %	25 %	0 %	379018681
3533	NC_016915	A	6	6	179512	179517	100 %	0 %	0 %	0 %	379018681
3534	NC_016915	TCT	2	6	179597	179602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018681
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3538	NC_016915	AGT	2	6	179910	179915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018682
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3540	NC_016915	TAG	2	6	180032	180037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018682
3541	NC_016915	TAG	2	6	180083	180088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018682
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3545	NC_016915	ATC	2	6	180494	180499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018683
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3549	NC_016915	CTGTAG	2	12	180571	180582	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379018683
3550	NC_016915	GCA	3	9	180594	180602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018683
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3553	NC_016915	AGT	2	6	180647	180652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018683
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3555	NC_016915	TGA	2	6	180743	180748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018683
3556	NC_016915	A	6	6	180777	180782	100 %	0 %	0 %	0 %	379018683
3557	NC_016915	GCT	2	6	180816	180821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018683
3558	NC_016915	ATT	2	6	180845	180850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018683
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3561	NC_016915	GAA	2	6	181840	181845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018684
3562	NC_016915	A	6	6	181850	181855	100 %	0 %	0 %	0 %	379018684
3563	NC_016915	TAG	2	6	181873	181878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018684
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3565	NC_016915	A	7	7	181906	181912	100 %	0 %	0 %	0 %	379018684
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3592	NC_016915	AT	3	6	182876	182881	50 %	50 %	0 %	0 %	379018684
3593	NC_016915	GCA	2	6	182922	182927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018684
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3603	NC_016915	TTAA	2	8	183552	183559	50 %	50 %	0 %	0 %	379018684
3604	NC_016915	AATA	2	8	183581	183588	75 %	25 %	0 %	0 %	379018684
3605	NC_016915	AG	3	6	183602	183607	50 %	0 %	50 %	0 %	379018684
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