MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 24177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_016915	ATT	2	6	54972	54977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018559
1003	NC_016915	TGA	2	6	54986	54991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018559
1004	NC_016915	ATT	2	6	55003	55008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018559
1005	NC_016915	AAT	2	6	55080	55085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018559
1006	NC_016915	AAAT	2	8	55135	55142	75 %	25 %	0 %	0 %	379018559
1007	NC_016915	TAA	2	6	55420	55425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018560
1008	NC_016915	TAA	2	6	55471	55476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018560
1009	NC_016915	ACT	2	6	55479	55484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018560
1010	NC_016915	ATA	2	6	55511	55516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018560
1011	NC_016915	TCT	2	6	55525	55530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018560
1012	NC_016915	TAAG	2	8	55545	55552	50 %	25 %	25 %	0 %	379018560
1013	NC_016915	GTT	3	9	55588	55596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018560
1014	NC_016915	T	6	6	55650	55655	0 %	100 %	0 %	0 %	379018560
1015	NC_016915	AT	3	6	55704	55709	50 %	50 %	0 %	0 %	379018560
1016	NC_016915	A	6	6	55766	55771	100 %	0 %	0 %	0 %	379018560
1017	NC_016915	AGT	2	6	55785	55790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018560
1018	NC_016915	TTA	2	6	55795	55800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018560
1019	NC_016915	A	6	6	55819	55824	100 %	0 %	0 %	0 %	379018560
1020	NC_016915	ATTGCT	2	12	55896	55907	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379018560
1021	NC_016915	GA	3	6	56075	56080	50 %	0 %	50 %	0 %	379018561
1022	NC_016915	TTA	2	6	56101	56106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018561
1023	NC_016915	GCA	2	6	56140	56145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018561
1024	NC_016915	ATAA	2	8	56172	56179	75 %	25 %	0 %	0 %	379018561
1025	NC_016915	T	6	6	56216	56221	0 %	100 %	0 %	0 %	379018561
1026	NC_016915	AGC	2	6	56235	56240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018561
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1028	NC_016915	TTC	2	6	56263	56268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018561
1029	NC_016915	ATT	2	6	56277	56282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018561
1030	NC_016915	TAC	2	6	56321	56326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018561
1031	NC_016915	TGC	2	6	56358	56363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018561
1032	NC_016915	ATT	2	6	56404	56409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018561
1033	NC_016915	ATTTAT	2	12	56483	56494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018561
1034	NC_016915	TCC	2	6	56532	56537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379018561
1035	NC_016915	CAT	2	6	56591	56596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018561
1036	NC_016915	TAG	2	6	56600	56605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018561
1037	NC_016915	ATAAGG	2	12	56682	56693	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379018561
1038	NC_016915	T	7	7	56757	56763	0 %	100 %	0 %	0 %	379018561
1039	NC_016915	CCG	2	6	56809	56814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379018561
1040	NC_016915	GCA	2	6	56836	56841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018561
1041	NC_016915	CTTT	2	8	56872	56879	0 %	75 %	0 %	25 %	379018561
1042	NC_016915	T	6	6	56887	56892	0 %	100 %	0 %	0 %	379018561
1043	NC_016915	GCA	2	6	56926	56931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018561
1044	NC_016915	TAC	2	6	56940	56945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018561
1045	NC_016915	ATC	2	6	57033	57038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018561
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1049	NC_016915	ACTT	2	8	57383	57390	25 %	50 %	0 %	25 %	379018562
1050	NC_016915	T	6	6	57434	57439	0 %	100 %	0 %	0 %	379018562
1051	NC_016915	GAT	2	6	57462	57467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018562
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1053	NC_016915	GTA	2	6	57606	57611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018562
1054	NC_016915	ATG	2	6	57719	57724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018562
1055	NC_016915	AAT	2	6	57753	57758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018562
1056	NC_016915	CCA	2	6	57764	57769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379018562
1057	NC_016915	T	6	6	57797	57802	0 %	100 %	0 %	0 %	379018562
1058	NC_016915	TTGC	2	8	57841	57848	0 %	50 %	25 %	25 %	379018562
1059	NC_016915	ATAA	2	8	57873	57880	75 %	25 %	0 %	0 %	379018562
1060	NC_016915	ACC	2	6	57908	57913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379018562
1061	NC_016915	ATAA	2	8	57927	57934	75 %	25 %	0 %	0 %	379018562
1062	NC_016915	GCT	2	6	57957	57962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018562
1063	NC_016915	AAT	2	6	57970	57975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018562
1064	NC_016915	TAA	2	6	57992	57997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018562
1065	NC_016915	CATC	2	8	58064	58071	25 %	25 %	0 %	50 %	379018562
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1069	NC_016915	ATTT	3	12	58240	58251	25 %	75 %	0 %	0 %	379018562
1070	NC_016915	ATT	2	6	58301	58306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018562
1071	NC_016915	ATA	2	6	58310	58315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018562
1072	NC_016915	ATA	2	6	58386	58391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018562
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1109	NC_016915	TAA	2	6	60097	60102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018567
1110	NC_016915	TAA	2	6	60209	60214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018567
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1112	NC_016915	A	6	6	60280	60285	100 %	0 %	0 %	0 %	379018567
1113	NC_016915	TTA	2	6	60295	60300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018567
1114	NC_016915	CAA	2	6	60306	60311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018567
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1116	NC_016915	TAA	2	6	60365	60370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018567
1117	NC_016915	AT	3	6	60397	60402	50 %	50 %	0 %	0 %	379018567
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1125	NC_016915	ATA	2	6	61037	61042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018568
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