MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 24177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016915	ATG	3	9	24191	24199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018527
502	NC_016915	AGT	2	6	24205	24210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018527
503	NC_016915	TGT	2	6	24216	24221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018527
504	NC_016915	TAA	2	6	24252	24257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018527
505	NC_016915	TA	3	6	24274	24279	50 %	50 %	0 %	0 %	379018527
506	NC_016915	A	6	6	24302	24307	100 %	0 %	0 %	0 %	379018527
507	NC_016915	AGA	2	6	24309	24314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018527
508	NC_016915	AAG	2	6	24359	24364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018527
509	NC_016915	TA	3	6	24373	24378	50 %	50 %	0 %	0 %	379018527
510	NC_016915	A	6	6	24413	24418	100 %	0 %	0 %	0 %	379018527
511	NC_016915	TAA	2	6	24428	24433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018527
512	NC_016915	ATG	2	6	24452	24457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018527
513	NC_016915	A	6	6	24458	24463	100 %	0 %	0 %	0 %	379018527
514	NC_016915	TTC	2	6	24465	24470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018527
515	NC_016915	GAA	2	6	24481	24486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018527
516	NC_016915	TACCT	2	10	24552	24561	20 %	40 %	0 %	40 %	379018527
517	NC_016915	GAA	2	6	24571	24576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018527
518	NC_016915	AAG	2	6	24578	24583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018527
519	NC_016915	AAGT	2	8	24590	24597	50 %	25 %	25 %	0 %	379018527
520	NC_016915	GCATTA	2	12	24643	24654	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379018527
521	NC_016915	GAA	2	6	24706	24711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018527
522	NC_016915	GAA	3	9	24736	24744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018527
523	NC_016915	TCCGAT	2	12	24760	24771	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379018527
524	NC_016915	A	7	7	24828	24834	100 %	0 %	0 %	0 %	379018527
525	NC_016915	AAATGC	2	12	24836	24847	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379018527
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528	NC_016915	TAA	2	6	24942	24947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018527
529	NC_016915	TGA	2	6	24966	24971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018527
530	NC_016915	AGA	2	6	24972	24977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018527
531	NC_016915	TAA	2	6	25023	25028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018527
532	NC_016915	CTA	2	6	25079	25084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018527
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534	NC_016915	TTCA	2	8	25139	25146	25 %	50 %	0 %	25 %	379018527
535	NC_016915	ATTTAA	2	12	25149	25160	50 %	50 %	0 %	0 %	379018527
536	NC_016915	AAT	2	6	25171	25176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018527
537	NC_016915	TTA	2	6	25187	25192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018527
538	NC_016915	GAA	2	6	25233	25238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018527
539	NC_016915	TTA	2	6	25277	25282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018527
540	NC_016915	AAC	2	6	25290	25295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018527
541	NC_016915	TTA	2	6	25403	25408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018527
542	NC_016915	TA	3	6	25451	25456	50 %	50 %	0 %	0 %	379018527
543	NC_016915	AAT	2	6	25504	25509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018527
544	NC_016915	AT	3	6	25508	25513	50 %	50 %	0 %	0 %	379018527
545	NC_016915	TAA	2	6	25569	25574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018527
546	NC_016915	AATA	2	8	25632	25639	75 %	25 %	0 %	0 %	379018527
547	NC_016915	GTT	2	6	25642	25647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018527
548	NC_016915	ATA	2	6	25658	25663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018527
549	NC_016915	TAT	2	6	25725	25730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018527
550	NC_016915	TAC	2	6	25746	25751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018527
551	NC_016915	ATT	2	6	25769	25774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018527
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556	NC_016915	AAC	2	6	26626	26631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018529
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558	NC_016915	TAA	2	6	26677	26682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018529
559	NC_016915	TTA	2	6	26695	26700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018529
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573	NC_016915	ATATT	2	10	27620	27629	40 %	60 %	0 %	0 %	379018530
574	NC_016915	A	6	6	27643	27648	100 %	0 %	0 %	0 %	379018530
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594	NC_016915	TAA	2	6	28385	28390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018532
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598	NC_016915	T	6	6	28971	28976	0 %	100 %	0 %	0 %	379018533
599	NC_016915	TCT	2	6	29009	29014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018533
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611	NC_016915	AGC	2	6	29358	29363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018534
612	NC_016915	T	6	6	29398	29403	0 %	100 %	0 %	0 %	379018534
613	NC_016915	T	8	8	29422	29429	0 %	100 %	0 %	0 %	379018534
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615	NC_016915	T	7	7	29466	29472	0 %	100 %	0 %	0 %	379018534
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627	NC_016915	AT	3	6	29873	29878	50 %	50 %	0 %	0 %	379018535
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